MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermofilum sp. 1910b

Total Repeats: 145

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022093	GCTTA	2	10	23508	23517	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_022093	GAAAA	2	10	27696	27705	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022093	TCTAA	2	10	52445	52454	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_022093	TCCTT	2	10	71848	71857	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_022093	GAAGG	2	10	76010	76019	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022093	AAACT	2	10	76539	76548	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_022093	TATTT	2	10	83947	83956	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022093	ATTTT	2	10	113907	113916	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022093	TTTGT	2	10	123670	123679	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022093	TGAGG	2	10	126749	126758	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022093	TTAGG	2	10	146048	146057	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022093	CATAA	2	10	157349	157358	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_022093	ACAAG	2	10	199050	199059	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_022093	ATTGA	2	10	205640	205649	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022093	CAACA	2	10	207274	207283	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_022093	TGTTA	2	10	210492	210501	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022093	TTGTT	2	10	211612	211621	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022093	GTTTT	2	10	212296	212305	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022093	ATTTC	2	10	220653	220662	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_022093	TTTTG	2	10	237540	237549	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022093	TTTTG	2	10	247342	247351	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022093	GAAGC	2	10	253330	253339	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_022093	GTTTT	2	10	257970	257979	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022093	ATAGT	2	10	281124	281133	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022093	TTTTG	2	10	319425	319434	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022093	AAAAT	2	10	323023	323032	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022093	TAAAA	2	10	326605	326614	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022093	GGTTA	2	10	337285	337294	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022093	GAGAA	2	10	359505	359514	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022093	TTTTC	2	10	372068	372077	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_022093	CGAGG	2	10	417440	417449	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
32	NC_022093	GAGCT	2	10	420471	420480	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_022093	CCAAA	2	10	431820	431829	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_022093	TAAAA	2	10	436656	436665	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022093	GGCAA	2	10	436690	436699	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_022093	TTCTT	2	10	440720	440729	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_022093	CATCA	2	10	467464	467473	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_022093	CAATG	2	10	468564	468573	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_022093	TGCCG	2	10	469309	469318	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_022093	AGACT	2	10	532214	532223	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_022093	CTACG	2	10	534299	534308	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_022093	TCCCC	2	10	535917	535926	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
43	NC_022093	CGAGC	2	10	536530	536539	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_022093	TTCTC	2	10	560214	560223	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_022093	GGATT	2	10	579164	579173	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022093	CGAGA	2	10	589528	589537	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_022093	AGACT	2	10	594383	594392	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_022093	CGCCA	2	10	618440	618449	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
49	NC_022093	ATTAT	2	10	626404	626413	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022093	ACAAA	2	10	635594	635603	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_022093	AACAA	2	10	646555	646564	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_022093	GCCGA	2	10	647079	647088	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_022093	TGCCT	2	10	677527	677536	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_022093	ATCTA	2	10	679090	679099	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_022093	CGTAA	2	10	679328	679337	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_022093	AAGCC	2	10	684695	684704	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_022093	CTAAC	2	10	687204	687213	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
58	NC_022093	AGACA	2	10	694226	694235	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_022093	TACTC	2	10	695809	695818	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_022093	TTTAG	2	10	696024	696033	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022093	TATAC	2	10	696231	696240	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_022093	ACGTT	2	10	706498	706507	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_022093	TTTAT	2	10	706591	706600	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022093	TGCAC	2	10	710539	710548	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_022093	TTTCG	2	10	710867	710876	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_022093	ATACT	2	10	711571	711580	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_022093	AAATG	2	10	716273	716282	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022093	TGGGA	2	10	716458	716467	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022093	CCTCT	2	10	725760	725769	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
70	NC_022093	TGGAG	2	10	726026	726035	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022093	TAACC	2	10	733001	733010	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_022093	GTAAC	2	10	795598	795607	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_022093	TTCTC	2	10	830519	830528	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_022093	AACAA	2	10	839913	839922	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_022093	AAAAT	2	10	844255	844264	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022093	AAACA	2	10	850752	850761	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_022093	TAATG	2	10	852835	852844	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022093	TGTTT	2	10	855329	855338	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022093	TACCT	2	10	883132	883141	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_022093	ATTTT	2	10	886064	886073	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022093	TTGTC	2	10	916917	916926	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_022093	GTGTA	2	10	949934	949943	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022093	TATTT	2	10	989748	989757	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022093	TAAAA	2	10	994538	994547	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022093	CTCAA	2	10	1013839	1013848	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_022093	TTAAA	2	10	1016068	1016077	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022093	GAGCT	2	10	1025438	1025447	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_022093	CAAAA	2	10	1036391	1036400	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_022093	ATCTA	2	10	1049704	1049713	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_022093	AGACT	2	10	1068643	1068652	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_022093	ACAGC	2	10	1070304	1070313	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_022093	TCTCT	2	10	1072962	1072971	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_022093	ACAAA	2	10	1072978	1072987	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_022093	TTTCT	2	10	1075323	1075332	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_022093	TTGTC	2	10	1154389	1154398	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_022093	CCCAA	2	10	1156279	1156288	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
97	NC_022093	TAAAA	2	10	1157211	1157220	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022093	GAAAA	2	10	1183019	1183028	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022093	ACCTT	2	10	1199389	1199398	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
100	NC_022093	CCTTT	2	10	1210408	1210417	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_022093	ACATA	2	10	1215726	1215735	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_022093	ACAAA	2	10	1235680	1235689	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_022093	AATTT	2	10	1270243	1270252	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022093	TAGAG	2	10	1281051	1281060	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022093	TAAAA	2	10	1301556	1301565	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022093	TTTTA	2	10	1312164	1312173	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022093	CTTTT	2	10	1322110	1322119	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_022093	AGTCA	2	10	1353441	1353450	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_022093	ATTTT	2	10	1366232	1366241	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022093	ATTAA	2	10	1385487	1385496	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022093	AATTG	2	10	1394736	1394745	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022093	AGTAA	2	10	1401272	1401281	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022093	ATGAA	2	10	1409386	1409395	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022093	CAAAA	2	10	1417961	1417970	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_022093	CCTCG	2	10	1419955	1419964	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
116	NC_022093	CCACG	2	10	1420976	1420985	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
117	NC_022093	TTTTG	2	10	1442792	1442801	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022093	GTGGG	2	10	1442820	1442829	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022093	TGAAT	2	10	1446458	1446467	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022093	TAAAA	2	10	1457141	1457150	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022093	TGTTT	2	10	1464217	1464226	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022093	AAGGA	2	10	1472088	1472097	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022093	AGGTA	2	10	1475144	1475153	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022093	GTAAA	2	10	1481548	1481557	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022093	ATTTA	2	10	1512873	1512882	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022093	ACCAA	2	10	1519243	1519252	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_022093	TAAAA	2	10	1528578	1528587	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022093	TTAAT	2	10	1529087	1529096	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022093	CTGGA	2	10	1539793	1539802	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_022093	AAAAG	2	10	1545581	1545590	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022093	ATTTC	2	10	1560405	1560414	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_022093	ATCCA	2	10	1562189	1562198	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_022093	ATTTT	2	10	1593104	1593113	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022093	GGAAA	2	10	1593285	1593294	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022093	CCTAT	2	10	1600782	1600791	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_022093	CCTAA	2	10	1602303	1602312	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_022093	ATCTC	2	10	1608901	1608910	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_022093	TTAAA	2	10	1627100	1627109	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022093	GGTTT	2	10	1660190	1660199	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022093	TTATG	2	10	1664812	1664821	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022093	TCTCC	2	10	1664901	1664910	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
142	NC_022093	TAGAA	2	10	1666367	1666376	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022093	TAAAA	2	10	1680830	1680839	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022093	TTTTA	2	10	1683224	1683233	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022093	TAAAA	2	10	1730952	1730961	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.