MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Geobacillus sp. JF8 plasmid pBt40

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022092	CAAAG	2	10	40	49	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_022092	ACGAG	2	10	1838	1847	40 %	0 %	40 %	20 %	530779557
3	NC_022092	TTGGA	2	10	4753	4762	20 %	40 %	40 %	0 %	530779561
4	NC_022092	TGAAA	2	10	5570	5579	60 %	20 %	20 %	0 %	530779561
5	NC_022092	CGTAC	2	10	7805	7814	20 %	20 %	20 %	40 %	530779564
6	NC_022092	AAAGA	2	10	8773	8782	80 %	0 %	20 %	0 %	530779565
7	NC_022092	GGTTT	2	10	9160	9169	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022092	ACGAA	2	10	10253	10262	60 %	0 %	20 %	20 %	530779567
9	NC_022092	TCTTA	2	10	13093	13102	20 %	60 %	0 %	20 %	530779569
10	NC_022092	AAATT	2	10	14244	14253	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022092	ATTAA	2	10	16248	16257	60 %	40 %	0 %	0 %	530779572
12	NC_022092	ATGAT	2	10	16591	16600	40 %	40 %	20 %	0 %	530779572
13	NC_022092	CCGCG	2	10	17875	17884	0 %	0 %	40 %	60 %	530779573
14	NC_022092	CGCAC	2	10	18267	18276	20 %	0 %	20 %	60 %	530779573
15	NC_022092	ATCAT	2	10	24865	24874	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_022092	CGATT	2	10	30171	30180	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_022092	AATGA	2	10	31445	31454	60 %	20 %	20 %	0 %	530779586
18	NC_022092	ATAAC	2	10	31696	31705	60 %	20 %	0 %	20 %	530779587
19	NC_022092	AAATA	2	10	32676	32685	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022092	TCTTT	2	10	36571	36580	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_022092	TTTTC	2	10	37706	37715	0 %	80 %	0 %	20 %	530779592
22	NC_022092	ACGAA	2	10	39095	39104	60 %	0 %	20 %	20 %	530779593

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.