MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Geobacillus sp. JF8 plasmid pBt40

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022092	ATTG	2	8	357	364	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022092	GTTT	2	8	522	529	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022092	TGGT	2	8	892	899	0 %	50 %	50 %	0 %	530779556
4	NC_022092	AAAG	2	8	1125	1132	75 %	0 %	25 %	0 %	530779556
5	NC_022092	AACG	2	8	1202	1209	50 %	0 %	25 %	25 %	530779556
6	NC_022092	GAAA	2	8	1307	1314	75 %	0 %	25 %	0 %	530779556
7	NC_022092	GAAA	2	8	1617	1624	75 %	0 %	25 %	0 %	530779557
8	NC_022092	AAAG	2	8	1728	1735	75 %	0 %	25 %	0 %	530779557
9	NC_022092	TGAA	2	8	3553	3560	50 %	25 %	25 %	0 %	530779559
10	NC_022092	GAAT	2	8	3572	3579	50 %	25 %	25 %	0 %	530779559
11	NC_022092	AACG	2	8	4014	4021	50 %	0 %	25 %	25 %	530779560
12	NC_022092	ACGG	2	8	4572	4579	25 %	0 %	50 %	25 %	530779560
13	NC_022092	TGTA	2	8	5805	5812	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022092	GTTT	2	8	6202	6209	0 %	75 %	25 %	0 %	530779562
15	NC_022092	GGGA	2	8	6738	6745	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022092	GAAG	2	8	7016	7023	50 %	0 %	50 %	0 %	530779563
17	NC_022092	CGGT	2	8	7416	7423	0 %	25 %	50 %	25 %	530779563
18	NC_022092	GCGG	2	8	7772	7779	0 %	0 %	75 %	25 %	530779564
19	NC_022092	ACGA	2	8	7875	7882	50 %	0 %	25 %	25 %	530779564
20	NC_022092	GAAG	2	8	7973	7980	50 %	0 %	50 %	0 %	530779564
21	NC_022092	AGTT	2	8	9034	9041	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022092	AAAG	2	8	10893	10900	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022092	CAGC	2	8	12126	12133	25 %	0 %	25 %	50 %	530779568
24	NC_022092	CAAA	2	8	12191	12198	75 %	0 %	0 %	25 %	530779568
25	NC_022092	TTAT	2	8	12391	12398	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022092	CAAA	2	8	12417	12424	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_022092	CTTT	2	8	12562	12569	0 %	75 %	0 %	25 %	530779569
28	NC_022092	TTTA	2	8	13819	13826	25 %	75 %	0 %	0 %	530779569
29	NC_022092	TAAT	2	8	13848	13855	50 %	50 %	0 %	0 %	530779570
30	NC_022092	TTAT	2	8	13905	13912	25 %	75 %	0 %	0 %	530779570
31	NC_022092	TCAC	2	8	14549	14556	25 %	25 %	0 %	50 %	530779571
32	NC_022092	ATGA	2	8	16902	16909	50 %	25 %	25 %	0 %	530779572
33	NC_022092	TCCA	2	8	17351	17358	25 %	25 %	0 %	50 %	530779573
34	NC_022092	TGTT	2	8	17496	17503	0 %	75 %	25 %	0 %	530779573
35	NC_022092	TATC	2	8	17984	17991	25 %	50 %	0 %	25 %	530779573
36	NC_022092	GTAC	2	8	18390	18397	25 %	25 %	25 %	25 %	530779573
37	NC_022092	AGCT	2	8	18864	18871	25 %	25 %	25 %	25 %	530779573
38	NC_022092	GAAC	2	8	18981	18988	50 %	0 %	25 %	25 %	530779573
39	NC_022092	ATTG	2	8	19678	19685	25 %	50 %	25 %	0 %	530779573
40	NC_022092	AGAA	2	8	19791	19798	75 %	0 %	25 %	0 %	530779573
41	NC_022092	AAAT	2	8	20205	20212	75 %	25 %	0 %	0 %	530779574
42	NC_022092	TCCA	2	8	20658	20665	25 %	25 %	0 %	50 %	530779574
43	NC_022092	TTCC	2	8	21609	21616	0 %	50 %	0 %	50 %	530779576
44	NC_022092	GGGT	2	8	22182	22189	0 %	25 %	75 %	0 %	530779576
45	NC_022092	GAGC	2	8	22268	22275	25 %	0 %	50 %	25 %	530779576
46	NC_022092	GCAT	2	8	22531	22538	25 %	25 %	25 %	25 %	530779576
47	NC_022092	GCTT	2	8	23043	23050	0 %	50 %	25 %	25 %	530779577
48	NC_022092	GTTG	2	8	23181	23188	0 %	50 %	50 %	0 %	530779553
49	NC_022092	CTTG	2	8	23204	23211	0 %	50 %	25 %	25 %	530779553
50	NC_022092	TACA	2	8	23889	23896	50 %	25 %	0 %	25 %	530779553
51	NC_022092	TGAT	2	8	24706	24713	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022092	AATC	2	8	24958	24965	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_022092	TTCT	2	8	25106	25113	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_022092	AGCA	2	8	25127	25134	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_022092	TCCT	2	8	25834	25841	0 %	50 %	0 %	50 %	530779578
56	NC_022092	GACC	2	8	25958	25965	25 %	0 %	25 %	50 %	530779578
57	NC_022092	ATCC	2	8	26406	26413	25 %	25 %	0 %	50 %	530779578
58	NC_022092	CCCT	2	8	26507	26514	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
59	NC_022092	ATTT	2	8	26714	26721	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022092	TGTT	2	8	27161	27168	0 %	75 %	25 %	0 %	530779579
61	NC_022092	TTTA	2	8	27191	27198	25 %	75 %	0 %	0 %	530779579
62	NC_022092	GCAG	2	8	27334	27341	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_022092	CTGG	2	8	27511	27518	0 %	25 %	50 %	25 %	530779555
64	NC_022092	TTGT	2	8	27559	27566	0 %	75 %	25 %	0 %	530779555
65	NC_022092	CTTC	2	8	28092	28099	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_022092	CCCG	2	8	28227	28234	0 %	0 %	25 %	75 %	530779580
67	NC_022092	TAGA	2	8	28771	28778	50 %	25 %	25 %	0 %	530779581
68	NC_022092	GGAA	2	8	28790	28797	50 %	0 %	50 %	0 %	530779581
69	NC_022092	TCAT	2	8	29473	29480	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_022092	GGAA	2	8	30317	30324	50 %	0 %	50 %	0 %	530779585
71	NC_022092	GAGC	2	8	31246	31253	25 %	0 %	50 %	25 %	530779586
72	NC_022092	GTCT	2	8	31518	31525	0 %	50 %	25 %	25 %	530779586
73	NC_022092	CTGA	2	8	31671	31678	25 %	25 %	25 %	25 %	530779587
74	NC_022092	CAAC	2	8	31721	31728	50 %	0 %	0 %	50 %	530779587
75	NC_022092	AGGA	2	8	31735	31742	50 %	0 %	50 %	0 %	530779587
76	NC_022092	TTTC	2	8	31765	31772	0 %	75 %	0 %	25 %	530779587
77	NC_022092	CGGA	2	8	31779	31786	25 %	0 %	50 %	25 %	530779587
78	NC_022092	GTAT	2	8	32082	32089	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022092	TTAA	2	8	32366	32373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022092	TTTA	2	8	32490	32497	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022092	CCAA	2	8	32852	32859	50 %	0 %	0 %	50 %	530779588
82	NC_022092	CGAT	2	8	33611	33618	25 %	25 %	25 %	25 %	530779588
83	NC_022092	TGAA	2	8	33766	33773	50 %	25 %	25 %	0 %	530779588
84	NC_022092	GGGA	2	8	34051	34058	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022092	TCAG	2	8	34194	34201	25 %	25 %	25 %	25 %	530779589
86	NC_022092	GAAA	2	8	34613	34620	75 %	0 %	25 %	0 %	530779589
87	NC_022092	CAAG	2	8	35374	35381	50 %	0 %	25 %	25 %	530779590
88	NC_022092	CAAG	2	8	35455	35462	50 %	0 %	25 %	25 %	530779590
89	NC_022092	GGAA	2	8	35654	35661	50 %	0 %	50 %	0 %	530779590
90	NC_022092	GCAA	2	8	35726	35733	50 %	0 %	25 %	25 %	530779590
91	NC_022092	GGAA	2	8	35752	35759	50 %	0 %	50 %	0 %	530779590
92	NC_022092	TTTA	2	8	35766	35773	25 %	75 %	0 %	0 %	530779590
93	NC_022092	ACGG	2	8	35802	35809	25 %	0 %	50 %	25 %	530779590
94	NC_022092	CCGA	2	8	35837	35844	25 %	0 %	25 %	50 %	530779590
95	NC_022092	TAAT	2	8	35895	35902	50 %	50 %	0 %	0 %	530779590
96	NC_022092	GAAA	2	8	36043	36050	75 %	0 %	25 %	0 %	530779590
97	NC_022092	ACCA	2	8	36234	36241	50 %	0 %	0 %	50 %	530779590
98	NC_022092	GTTC	2	8	36395	36402	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_022092	TTCA	2	8	36703	36710	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_022092	GAAG	2	8	37447	37454	50 %	0 %	50 %	0 %	530779591
101	NC_022092	TGCC	2	8	37943	37950	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_022092	ACGG	2	8	38349	38356	25 %	0 %	50 %	25 %	530779593
103	NC_022092	ATAA	2	8	39630	39637	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022092	TTAA	2	8	39647	39654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.