MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5113

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022081	TTTGAA	2	12	17286	17297	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022081	TCATAT	2	12	65462	65473	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_022081	AGTCAA	2	12	102176	102187	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_022081	GAAAAG	2	12	148670	148681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022081	AAACAA	2	12	148711	148722	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_022081	AGGTAT	2	12	166859	166870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022081	TTTATA	2	12	206079	206090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022081	GAGAAT	2	12	270135	270146	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022081	GATAAA	2	12	319453	319464	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022081	TATTGA	2	12	320858	320869	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022081	ACGATT	2	12	332294	332305	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_022081	ATATCA	2	12	335704	335715	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_022081	TGATAA	2	12	401674	401685	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022081	TTTTTC	2	12	433989	434000	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_022081	AAAAAG	2	12	458248	458259	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022081	AATAAA	2	12	462535	462546	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022081	CGGCTC	2	12	475542	475553	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_022081	CTTATT	2	12	501938	501949	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_022081	TAAAGA	2	12	522526	522537	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022081	ATCCTC	2	12	525534	525545	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_022081	TTTCAA	2	12	581986	581997	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_022081	AAAAGG	2	12	633204	633215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022081	TCAATC	2	12	652021	652032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_022081	CTTTCT	2	12	664269	664280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_022081	TTTCTC	2	12	684216	684227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_022081	AAATGA	2	12	712050	712061	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022081	GGCGGG	2	12	743054	743065	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_022081	AGGGCC	2	12	744684	744695	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_022081	CCGGAG	2	12	753744	753755	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_022081	TTTTTC	2	12	793941	793952	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_022081	GGATTT	2	12	801899	801910	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022081	TAAAAA	2	12	803718	803729	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022081	TTTTTA	2	12	819704	819715	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022081	TCATTT	2	12	832989	833000	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_022081	CTTTTT	2	12	841461	841472	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_022081	AAAAAG	2	12	853089	853100	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022081	TTATAT	2	12	863769	863780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022081	GTGCTG	2	12	866622	866633	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_022081	CATCTT	2	12	868473	868484	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_022081	CCTTTC	2	12	905797	905808	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_022081	ATGAAA	2	12	906534	906545	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022081	TCTTTT	2	12	1007739	1007750	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_022081	ATGCTC	2	12	1007865	1007876	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_022081	ATAATG	2	12	1018467	1018478	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022081	TCTTTT	2	12	1024590	1024601	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_022081	GAAAAA	2	12	1027619	1027630	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022081	GAAAAG	2	12	1034007	1034018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022081	TTACTA	2	12	1039168	1039179	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_022081	CGCAAA	2	12	1039243	1039254	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_022081	GGCTGC	2	12	1142320	1142331	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_022081	TTTCTA	2	12	1153557	1153568	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_022081	GTTAAC	2	12	1190250	1190261	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_022081	TCTTTT	2	12	1319669	1319680	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_022081	CTGTTT	2	12	1330171	1330182	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_022081	TAATTG	2	12	1341938	1341949	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022081	ATCATT	2	12	1355393	1355404	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_022081	AGAAAA	2	12	1357599	1357610	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022081	ATCATT	2	12	1358634	1358645	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_022081	TCAAAC	2	12	1470872	1470883	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_022081	TCCGGT	2	12	1593242	1593253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_022081	TTTGTT	2	12	1667503	1667514	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022081	AAAATA	2	12	1790738	1790749	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022081	TAAAAA	2	12	1809359	1809370	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022081	ATAAAA	2	12	1813650	1813661	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022081	TGTTCT	2	12	1816054	1816065	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_022081	AACTGA	2	12	1817609	1817620	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_022081	AAAATG	2	12	1822585	1822596	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022081	TACGTT	2	12	1823465	1823476	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_022081	GATATA	2	12	1836368	1836379	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022081	TAAAAA	2	12	1836388	1836399	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022081	ATGAGC	2	12	1864263	1864274	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_022081	CTCTAT	2	12	1868097	1868108	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_022081	GTCATT	2	12	1870917	1870928	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_022081	ATAAAA	2	12	1976494	1976505	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022081	AAGAGA	2	12	1976571	1976582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022081	CTTTTT	2	12	2015509	2015520	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_022081	GTTTTT	2	12	2064821	2064832	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022081	AAATAA	2	12	2106638	2106649	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022081	AATGAA	2	12	2109668	2109679	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022081	ATCAAA	2	12	2178312	2178323	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_022081	ATAAAA	2	12	2330430	2330441	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022081	CGTCAT	2	12	2345571	2345582	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_022081	ATATTT	2	12	2349663	2349674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022081	AACGGA	2	12	2370564	2370575	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_022081	CAATCT	2	12	2393795	2393806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_022081	ACCGTT	2	12	2399469	2399480	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_022081	TGAAAA	2	12	2402301	2402312	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022081	TTCTAA	2	12	2452188	2452199	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_022081	TGACTT	2	12	2478307	2478318	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_022081	GAAGCA	2	12	2500153	2500164	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_022081	TAAAAA	2	12	2504274	2504285	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022081	CCTTTG	2	12	2511401	2511412	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_022081	ACAAAA	2	12	2527488	2527499	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_022081	AAGAAA	2	12	2533171	2533182	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022081	TTCTCC	2	12	2553234	2553245	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_022081	CCCTCT	2	12	2681733	2681744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_022081	ATTGGA	2	12	2693843	2693854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022081	CTCTTT	2	12	2728535	2728546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_022081	CTTATA	2	12	2741636	2741647	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_022081	TTTAAG	2	12	2755340	2755351	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022081	CAGAGA	2	12	2755991	2756002	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_022081	TCTTTG	2	12	2758051	2758062	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_022081	GGAAAA	2	12	2773462	2773473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022081	CCAAAA	2	12	2784857	2784868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_022081	TTTTAA	2	12	2807039	2807050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022081	TTTTGC	2	12	2807066	2807077	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_022081	CTTATC	2	12	2823334	2823345	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_022081	CTAAAA	2	12	2865292	2865303	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_022081	TTAAGA	2	12	2928156	2928167	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022081	ATTATC	2	12	3026162	3026173	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_022081	CCGCGG	2	12	3033668	3033679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_022081	ATTTTA	2	12	3036565	3036576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022081	TTTTCT	2	12	3068076	3068087	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_022081	TAAATG	2	12	3111301	3111312	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022081	TAATGA	2	12	3149231	3149242	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022081	GAAAAA	2	12	3166593	3166604	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022081	CTTTTT	2	12	3280361	3280372	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_022081	GAGAAA	2	12	3291217	3291228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022081	TTTCTT	2	12	3294826	3294837	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_022081	TTTCAT	2	12	3329756	3329767	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_022081	TCTTAT	2	12	3358608	3358619	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_022081	CAATCA	2	12	3395157	3395168	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_022081	GATGAA	2	12	3428538	3428549	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022081	GCATAA	2	12	3449097	3449108	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_022081	AAAATA	2	12	3480879	3480890	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022081	CAAAAA	2	12	3553180	3553191	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_022081	ACATAT	2	12	3553230	3553241	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_022081	GCTTTT	2	12	3562884	3562895	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_022081	ATCTCC	2	12	3573391	3573402	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_022081	CAAAAA	2	12	3573521	3573532	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_022081	AATATA	2	12	3640134	3640145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022081	AAATGA	2	12	3663760	3663771	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022081	TTTCAC	2	12	3702506	3702517	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_022081	AATATT	2	12	3801381	3801392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022081	CTCTAT	2	12	3802585	3802596	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_022081	ACGATA	2	12	3843109	3843120	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_022081	ACAAAA	2	12	3852554	3852565	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_022081	GCTCTT	2	12	3872671	3872682	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_022081	GAAAAA	2	12	3887086	3887097	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.