MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Geobacillus sp. JF8

Total Repeats: 149

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022080	AAATGG	2	12	9275	9286	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022080	CGAAGG	2	12	30013	30024	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_022080	AGAGGG	2	12	45973	45984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022080	AGTCAA	2	12	95162	95173	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_022080	TGTTTG	2	12	147378	147389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022080	TAAAAG	2	12	159042	159053	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022080	GCGGCC	2	12	177294	177305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_022080	ATCAAT	2	12	183516	183527	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_022080	AAATGG	2	12	198852	198863	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022080	CCGCCC	2	12	199417	199428	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
11	NC_022080	AAATGA	2	12	219953	219964	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022080	TGCGTC	2	12	222304	222315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_022080	CGAAGG	2	12	225611	225622	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_022080	TTCTTT	2	12	236552	236563	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_022080	TGCGTC	2	12	253242	253253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_022080	GGAAAC	2	12	256696	256707	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_022080	CTGAAA	2	12	290100	290111	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_022080	GGAAAA	2	12	306935	306946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022080	AGGGGG	2	12	310674	310685	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022080	GTAAAA	2	12	317141	317152	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022080	CTTGCC	2	12	331880	331891	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
22	NC_022080	CGGAAG	2	12	336966	336977	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_022080	GCCGGT	2	12	405366	405377	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_022080	ATGCAT	2	12	419078	419089	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_022080	AGTTTT	2	12	435178	435189	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022080	AGCAAC	2	12	444318	444329	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_022080	TTTTTG	2	12	449459	449470	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022080	TTTTCG	2	12	479446	479457	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_022080	CGAAGG	2	12	494934	494945	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_022080	GGCAAC	2	12	531299	531310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_022080	AATTTT	2	12	539086	539097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022080	GATAAA	2	12	542044	542055	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022080	TTTTAT	2	12	549872	549883	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022080	TCTTTT	2	12	612092	612103	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_022080	AAAAAG	2	12	682588	682599	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022080	GAGATG	2	12	692420	692431	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022080	CTTTTT	2	12	713566	713577	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_022080	ATTAAA	2	12	778368	778379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022080	ATCCGA	2	12	820573	820584	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_022080	CGGATT	2	12	820589	820600	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_022080	ATTTCC	2	12	821735	821746	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_022080	AAGGGG	2	12	879630	879641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022080	CCGCTG	2	12	941065	941076	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_022080	TCGCAT	2	12	978437	978448	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_022080	TAGACA	2	12	1015912	1015923	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_022080	CGATGG	2	12	1056798	1056809	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_022080	GCTGTT	2	12	1146409	1146420	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_022080	TCCATT	2	12	1156149	1156160	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_022080	TTTTTC	2	12	1170326	1170337	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_022080	TCATTG	2	12	1196536	1196547	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_022080	AGCCGA	2	12	1198739	1198750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_022080	AATAGA	2	12	1232729	1232740	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022080	TGCGAG	2	12	1287737	1287748	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_022080	TTTGGT	2	12	1290867	1290878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022080	CCTTTT	2	12	1300427	1300438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_022080	CTTTCT	2	12	1309511	1309522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_022080	ATTTAT	2	12	1313469	1313480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022080	AGGGGA	2	12	1317839	1317850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022080	CGGGGG	2	12	1334087	1334098	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_022080	GAGAAA	2	12	1336555	1336566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022080	CCCTTT	2	12	1343255	1343266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_022080	TTGCGG	2	12	1353649	1353660	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_022080	CTTTTA	2	12	1357269	1357280	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_022080	TTGATA	2	12	1381532	1381543	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022080	GGAGAG	2	12	1387861	1387872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022080	TGAAAA	2	12	1422426	1422437	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022080	CGCTTT	2	12	1466160	1466171	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_022080	AAAAAT	2	12	1511403	1511414	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022080	GGGAGA	2	12	1531146	1531157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022080	TTGTTT	2	12	1567555	1567566	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022080	GCGGAA	2	12	1580849	1580860	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_022080	AGGGGG	2	12	1604820	1604831	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022080	AATTAA	2	12	1630187	1630198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022080	TTGGCG	2	12	1662845	1662856	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_022080	TCTGTT	2	12	1670311	1670322	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_022080	TTTGTA	2	12	1675580	1675591	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022080	TTTTGA	2	12	1681315	1681326	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022080	CTTTTC	2	12	1706550	1706561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_022080	CCGGCA	2	12	1706924	1706935	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
80	NC_022080	TCTATC	2	12	1771130	1771141	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_022080	AATCAT	2	12	1771166	1771177	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_022080	GAAGTT	2	12	1781001	1781012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022080	GTTTTG	2	12	1799120	1799131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022080	CATCCG	2	12	1820818	1820829	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
85	NC_022080	CAGTTT	2	12	1832071	1832082	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_022080	TATCTT	2	12	1890856	1890867	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_022080	CTCCTT	2	12	1924977	1924988	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_022080	TGCCGA	2	12	1980259	1980270	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_022080	ATTACC	2	12	1992878	1992889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_022080	GAAAAA	2	12	1994326	1994337	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022080	GTAACA	2	12	2026728	2026739	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_022080	GGGAAG	2	12	2042361	2042372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022080	CTTCCG	2	12	2054986	2054997	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
94	NC_022080	GTGATT	2	12	2076358	2076369	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022080	CTTCTC	2	12	2083419	2083430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_022080	GAAAAA	2	12	2092800	2092811	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022080	TAATCA	2	12	2121394	2121405	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_022080	GGGGCG	2	12	2121562	2121573	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_022080	TGCGCC	2	12	2139656	2139667	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
100	NC_022080	TTTTTC	2	12	2172019	2172030	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_022080	CCGGCT	2	12	2204836	2204847	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
102	NC_022080	TGATAG	2	12	2212772	2212783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022080	ATCACT	2	12	2230458	2230469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_022080	AAAGGC	2	12	2236097	2236108	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_022080	CCGGCC	2	12	2243359	2243370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_022080	GAATAT	2	12	2261957	2261968	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022080	AAGGGC	2	12	2272583	2272594	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_022080	CGATGG	2	12	2299250	2299261	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_022080	CGCGAT	2	12	2309686	2309697	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_022080	GGAGTG	2	12	2333283	2333294	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022080	CTTTCC	2	12	2353316	2353327	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_022080	AATGGA	2	12	2379713	2379724	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022080	CCCTTT	2	12	2389012	2389023	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_022080	CAAAGG	2	12	2395502	2395513	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_022080	TTTATT	2	12	2446011	2446022	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022080	AGCGCC	2	12	2481383	2481394	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
117	NC_022080	AGGCAT	2	12	2484379	2484390	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_022080	TTTACT	2	12	2513639	2513650	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_022080	AGAAAA	2	12	2513691	2513702	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022080	CGCCGG	2	12	2516821	2516832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_022080	GTGACG	2	12	2581703	2581714	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_022080	TTCCAT	2	12	2585244	2585255	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_022080	TAATGA	2	12	2591087	2591098	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022080	TTCTTT	2	12	2636023	2636034	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_022080	CTTCCT	2	12	2697895	2697906	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_022080	TGCCGG	2	12	2699604	2699615	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_022080	ATTTTT	2	12	2704543	2704554	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022080	AATGAT	2	12	2775230	2775241	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022080	CCTTCG	2	12	2808061	2808072	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
130	NC_022080	TTTCCA	2	12	2867860	2867871	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_022080	TTTTAT	2	12	2909414	2909425	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022080	AAAGGA	2	12	2948305	2948316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022080	TCCATC	2	12	2958565	2958576	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_022080	CGTCAT	2	12	2970692	2970703	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_022080	GAAAAT	2	12	3006518	3006529	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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140	NC_022080	GAAAAA	2	12	3212264	3212275	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022080	GCCGAT	2	12	3279973	3279984	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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149	NC_022080	TCCAAA	2	12	3432600	3432611	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.