MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia miyamotoi LB-2001

Total Repeats: 561

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022079	ATAAAA	2	12	2140	2151	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022079	ATCCTT	2	12	2710	2721	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	530575402
3	NC_022079	AAGAAA	2	12	6984	6995	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	530575405
4	NC_022079	CAAACC	2	12	7750	7761	50 %	0 %	0 %	50 %	530575406
5	NC_022079	CAATAA	2	12	8981	8992	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	530575408
6	NC_022079	CTATTT	2	12	9170	9181	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	530575409
7	NC_022079	TTAAAA	2	12	12706	12717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530575414
8	NC_022079	AATGAA	2	12	12982	12993	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	530575414
9	NC_022079	ATCAAA	2	12	13266	13277	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	530575414
10	NC_022079	GGACTT	2	12	16172	16183	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	530575417
11	NC_022079	AAATTA	2	12	16469	16480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530575417
12	NC_022079	TGAATT	2	12	19502	19513	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	530575420
13	NC_022079	GCTGAT	2	12	20394	20405	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	530575421
14	NC_022079	TTCATT	2	12	21879	21890	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	530575422
15	NC_022079	TTTTTA	2	12	22990	23001	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	530575424
16	NC_022079	AAATAG	2	12	24365	24376	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	530575426
17	NC_022079	CAATAA	2	12	26029	26040	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	530575428
18	NC_022079	TAAAAA	2	12	26545	26556	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	530575428
19	NC_022079	TTAAAT	2	12	27515	27526	50 %	50 %	0 %	0 %	530575430
20	NC_022079	TTTCAA	2	12	28006	28017	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	530575431
21	NC_022079	CAAAAA	2	12	28588	28599	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	530575431
22	NC_022079	CAAACT	2	12	30311	30322	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	530575432
23	NC_022079	CCTATT	2	12	31298	31309	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	530575434
24	NC_022079	ACTTAA	2	12	31829	31840	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	530575435
25	NC_022079	ATTAAT	2	12	31905	31916	50 %	50 %	0 %	0 %	530575435
26	NC_022079	TTCATC	2	12	31983	31994	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	530575435
27	NC_022079	TATCAA	2	12	32492	32503	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	530575435
28	NC_022079	TTTCCA	2	12	33094	33105	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	530575435
29	NC_022079	GAAGCA	2	12	33406	33417	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	530575435
30	NC_022079	TATATT	2	12	34981	34992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530575436
31	NC_022079	CATTAT	2	12	35200	35211	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	530575436
32	NC_022079	TATCAA	2	12	36709	36720	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	530575438
33	NC_022079	ATAAAA	2	12	36880	36891	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	530575438
34	NC_022079	TAAATT	2	12	37505	37516	50 %	50 %	0 %	0 %	530575438
35	NC_022079	TATATC	2	12	37595	37606	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	530575438
36	NC_022079	ATCCTT	2	12	41556	41567	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	530575442
37	NC_022079	CAATTT	2	12	42380	42391	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	530575443
38	NC_022079	TTAAAT	2	12	43036	43047	50 %	50 %	0 %	0 %	530575444
39	NC_022079	ATTAAT	2	12	43403	43414	50 %	50 %	0 %	0 %	530575444
40	NC_022079	TATCTC	2	12	45646	45657	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	530575446
41	NC_022079	AATATT	2	12	47648	47659	50 %	50 %	0 %	0 %	530575449
42	NC_022079	TAAAAA	2	12	49225	49236	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	530575451
43	NC_022079	AATATG	2	12	55404	55415	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	530575457
44	NC_022079	AAAGAA	2	12	57162	57173	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	530575460
45	NC_022079	TTTTCA	2	12	60300	60311	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	530575464
46	NC_022079	TTTCAA	2	12	61941	61952	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	530575465
47	NC_022079	TAATGA	2	12	63648	63659	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	530575466
48	NC_022079	AAAATT	2	12	65325	65336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530575468
49	NC_022079	AAAATT	2	12	65866	65877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530575469
50	NC_022079	ATATTC	2	12	65983	65994	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	530575469
51	NC_022079	AAAATA	2	12	66124	66135	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	530575469
52	NC_022079	ATTTAA	2	12	67466	67477	50 %	50 %	0 %	0 %	530575470
53	NC_022079	TCCATA	2	12	67580	67591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530575470
54	NC_022079	ATAAAA	2	12	69313	69324	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	530575472
55	NC_022079	ATTAAA	2	12	71241	71252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530575474
56	NC_022079	ATTAAA	2	12	71553	71564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530575474
57	NC_022079	GGAATT	2	12	74493	74504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530575477
58	NC_022079	ATTAAA	2	12	75287	75298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530575477
59	NC_022079	AAAGAA	2	12	77372	77383	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	530575479
60	NC_022079	CTTCAA	2	12	78060	78071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530575480
61	NC_022079	AATACA	2	12	78471	78482	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	530575480
62	NC_022079	TTTAAA	2	12	79646	79657	50 %	50 %	0 %	0 %	530575482
63	NC_022079	ATTTTC	2	12	84310	84321	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	530575486
64	NC_022079	TAAAAA	2	12	86497	86508	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	530575487
65	NC_022079	AGAAAT	2	12	86746	86757	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	530575488
66	NC_022079	AAACAA	2	12	86874	86885	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	530575488
67	NC_022079	ATCAAA	2	12	88332	88343	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	530575489
68	NC_022079	TCAAAA	2	12	88841	88852	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	530575489
69	NC_022079	CAGCAA	2	12	90123	90134	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	530575491
70	NC_022079	ACCAAT	2	12	92634	92645	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	530575493
71	NC_022079	TCTCTT	2	12	94845	94856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530575496
72	NC_022079	TGGACT	2	12	99627	99638	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	530575499
73	NC_022079	GAAAAA	2	12	100155	100166	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	530575500
74	NC_022079	TTCAAT	2	12	101509	101520	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	530575502
75	NC_022079	AGCTAA	2	12	102595	102606	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	530575502
76	NC_022079	TAAATC	2	12	103895	103906	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	530575504
77	NC_022079	TTGAAA	2	12	109228	109239	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	530575508
78	NC_022079	TTAATT	2	12	112246	112257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530575512
79	NC_022079	CACCAA	2	12	113438	113449	50 %	0 %	0 %	50 %	530575513
80	NC_022079	TTATAC	2	12	117554	117565	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	530575516
81	NC_022079	AATACT	2	12	118919	118930	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	530575518
82	NC_022079	ATTTAA	2	12	123943	123954	50 %	50 %	0 %	0 %	530575523
83	NC_022079	TTCTTT	2	12	126956	126967	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	530575372
84	NC_022079	ATCTAT	2	12	131060	131071	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	530575528
85	NC_022079	ATGGAA	2	12	131816	131827	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	530575529
86	NC_022079	ACTATA	2	12	132888	132899	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	530575529
87	NC_022079	ATCAAA	2	12	134000	134011	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	530575530
88	NC_022079	CTTTGG	2	12	135576	135587	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	530575532
89	NC_022079	CATCTT	2	12	136918	136929	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	530575533
90	NC_022079	CACTAT	2	12	137966	137977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530575533
91	NC_022079	ATACAC	2	12	138810	138821	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	530575534
92	NC_022079	CATTAT	2	12	138883	138894	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_022079	ATAAGC	2	12	139313	139324	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_022079	CAAAAG	2	12	140048	140059	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_022079	CAGAAA	2	12	141081	141092	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_022079	TAACAT	2	12	142057	142068	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_022079	TGAAAA	2	12	143555	143566	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022079	AAAACG	2	12	144326	144337	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_022079	ATTTGC	2	12	147583	147594	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	530575538
100	NC_022079	AAATAA	2	12	147819	147830	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022079	GGAGCT	2	12	148202	148213	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	530575539
102	NC_022079	ATCTGA	2	12	148552	148563	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	530575539
103	NC_022079	TCAACT	2	12	149951	149962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530575540
104	NC_022079	CAAGAA	2	12	152867	152878	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	530575542
105	NC_022079	AATTTA	2	12	153796	153807	50 %	50 %	0 %	0 %	530575543
106	NC_022079	TTTTTA	2	12	154096	154107	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	530575544
107	NC_022079	AAATTT	2	12	158578	158589	50 %	50 %	0 %	0 %	530575547
108	NC_022079	TCAATA	2	12	158831	158842	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_022079	ATGGAC	2	12	159062	159073	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	530575548
110	NC_022079	TAAAAA	2	12	164152	164163	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	530575552
111	NC_022079	TTCCAA	2	12	173132	173143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530575562
112	NC_022079	AATTTA	2	12	174087	174098	50 %	50 %	0 %	0 %	530575563
113	NC_022079	ACAATA	2	12	174519	174530	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	530575563
114	NC_022079	ATTAAA	2	12	175011	175022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530575564
115	NC_022079	CAAGAC	2	12	176443	176454	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	530575565
116	NC_022079	TATCTT	2	12	178923	178934	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	530575568
117	NC_022079	CTGCTT	2	12	180777	180788	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	530575569
118	NC_022079	ATTTTT	2	12	187122	187133	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022079	CTCTAT	2	12	188355	188366	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	530575580
120	NC_022079	TGCTTC	2	12	191949	191960	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	530575584
121	NC_022079	AATACA	2	12	196769	196780	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	530575588
122	NC_022079	AGAAAA	2	12	196801	196812	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	530575588
123	NC_022079	ATATCA	2	12	197720	197731	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	530575588
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239	NC_022079	TTTTCA	2	12	382965	382976	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	530575755
240	NC_022079	TTTCAC	2	12	383833	383844	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	530575755
241	NC_022079	CAATAA	2	12	383931	383942	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	530575755
242	NC_022079	AACATC	2	12	387076	387087	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	530575759
243	NC_022079	AATAAA	2	12	393766	393777	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
244	NC_022079	CTGATC	2	12	394121	394132	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	530575765
245	NC_022079	CTGATC	2	12	395182	395193	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	530575766
246	NC_022079	CATATC	2	12	395400	395411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530575766
247	NC_022079	CTTCTA	2	12	396216	396227	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	530575375
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249	NC_022079	AACCCT	2	12	401138	401149	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	530575768
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251	NC_022079	TAAAAA	2	12	408769	408780	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	530575774
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258	NC_022079	AAGATA	2	12	420880	420891	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
259	NC_022079	TTTTCA	2	12	421563	421574	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
260	NC_022079	AGAAAC	2	12	425010	425021	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	530575785
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266	NC_022079	TCGGGT	2	12	436752	436763	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
267	NC_022079	TATGCT	2	12	440931	440942	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	530575794
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270	NC_022079	TTATTT	2	12	444856	444867	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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351	NC_022079	CTTATA	2	12	572256	572267	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	530575907
352	NC_022079	ATCAGA	2	12	574806	574817	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	530575909
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354	NC_022079	ATTCCA	2	12	577071	577082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530575911
355	NC_022079	TTCTAT	2	12	580125	580136	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
356	NC_022079	TGATTA	2	12	581221	581232	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	530575915
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461	NC_022079	ATAATG	2	12	762316	762327	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
462	NC_022079	AGATTT	2	12	762391	762402	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	530576066
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469	NC_022079	TTCTAT	2	12	771855	771866	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	530576072
470	NC_022079	TTAAAG	2	12	773087	773098	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	530576073
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472	NC_022079	TTAATT	2	12	777639	777650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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