MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia miyamotoi LB-2001

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022079	ATAAAA	2	12	2140	2151	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022079	CATTAT	2	12	138883	138894	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_022079	ATAAGC	2	12	139313	139324	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_022079	CAAAAG	2	12	140048	140059	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_022079	CAGAAA	2	12	141081	141092	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_022079	TAACAT	2	12	142057	142068	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_022079	TGAAAA	2	12	143555	143566	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022079	AAAACG	2	12	144326	144337	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_022079	AAATAA	2	12	147819	147830	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022079	TCAATA	2	12	158831	158842	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_022079	ATTTTT	2	12	187122	187133	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022079	AAAAAT	2	12	253351	253362	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022079	ATAATT	2	12	254077	254088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022079	AAACTA	2	12	295112	295123	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_022079	TAAAAA	2	12	313150	313161	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022079	AGAAAA	2	12	332428	332439	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022079	TAACTT	3	18	363140	363157	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_022079	TTTAAT	2	12	370744	370755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022079	AATAAA	2	12	393766	393777	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022079	ATTTAT	2	12	415203	415214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022079	TTTTGA	2	12	420472	420483	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022079	TATTTT	2	12	420575	420586	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022079	AAGATA	2	12	420880	420891	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022079	TTTTCA	2	12	421563	421574	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_022079	ATTAGT	2	12	434598	434609	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022079	TCGGGT	2	12	436752	436763	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_022079	TTCGCC	2	12	444129	444140	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_022079	TTATTT	2	12	444856	444867	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022079	TTATAT	2	12	447684	447695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022079	CATAGA	2	12	456057	456068	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_022079	ATTTTG	2	12	465911	465922	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022079	ATTTTT	2	12	466082	466093	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022079	AATATA	2	12	476725	476736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022079	CACAGC	2	12	481861	481872	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_022079	ATAGTT	2	12	496004	496015	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022079	TAAAAA	2	12	501943	501954	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022079	GATATT	2	12	536610	536621	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022079	TAGATA	2	12	539362	539373	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022079	ACTTTA	2	12	550496	550507	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_022079	AATAAA	2	12	556773	556784	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022079	TTTAAT	2	12	569230	569241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022079	TTCTAT	2	12	580125	580136	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_022079	GTTTGA	2	12	589903	589914	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022079	ATTTTG	2	12	590597	590608	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022079	CATTGG	2	12	591288	591299	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_022079	TTCAAT	2	12	659093	659104	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_022079	TTATTG	2	12	669385	669396	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022079	TAATTT	2	12	671045	671056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022079	TTTTAA	2	12	710670	710681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022079	ATTTAT	3	18	739689	739706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022079	ATAATG	2	12	762316	762327	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022079	TTAATT	2	12	777639	777650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022079	TGATTT	2	12	777841	777852	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022079	TGATTT	2	12	782807	782818	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022079	ATTTTT	2	12	810924	810935	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022079	GATATA	2	12	870930	870941	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022079	TTCTTT	2	12	872898	872909	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_022079	ATGATA	2	12	884207	884218	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022079	TATTTT	2	12	891181	891192	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.