MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia miyamotoi LB-2001

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022079	ATCTT	2	10	1423	1432	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_022079	TAATT	2	10	1848	1857	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022079	CCCCA	2	10	2034	2043	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
4	NC_022079	AAATT	2	10	22588	22597	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022079	TATAC	2	10	24934	24943	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_022079	ATTTA	2	10	31717	31726	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022079	AATAT	2	10	68372	68381	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022079	CATAA	2	10	80564	80573	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_022079	ATTAA	2	10	80582	80591	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022079	ACTTA	2	10	98214	98223	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_022079	ATTAA	2	10	101100	101109	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022079	ATTTA	2	10	106630	106639	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022079	ATTCT	2	10	109429	109438	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_022079	TTAAA	2	10	114836	114845	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022079	ACACA	2	10	120955	120964	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_022079	AAATC	2	10	121143	121152	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_022079	AAAAC	2	10	140436	140445	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_022079	CTTTC	2	10	141921	141930	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_022079	AAAAT	2	10	143070	143079	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022079	TCAGC	2	10	143830	143839	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_022079	TAAAA	2	10	144339	144348	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022079	AAAAT	2	10	147855	147864	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022079	TATAA	2	10	158934	158943	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022079	ATTAA	2	10	176576	176585	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022079	AAAAT	2	10	177615	177624	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022079	AAAAT	2	10	177642	177651	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022079	TAGCA	2	10	181205	181214	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_022079	ATAAA	2	10	181324	181333	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022079	CATTA	2	10	189990	189999	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_022079	ATAAA	2	10	204895	204904	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022079	ACAAA	2	10	227436	227445	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_022079	TAAAA	2	10	227851	227860	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022079	CTTTA	2	10	228264	228273	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_022079	AAACA	2	10	240651	240660	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_022079	CGAAA	2	10	244358	244367	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_022079	ATAGA	2	10	244458	244467	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022079	TATAT	2	10	251040	251049	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022079	CAAAT	2	10	254016	254025	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_022079	ATATT	2	10	254091	254100	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022079	AGTCC	2	10	257321	257330	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_022079	AAAAC	2	10	341878	341887	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_022079	TAAAA	2	10	358853	358862	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022079	AACAA	2	10	360622	360631	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_022079	ATTAA	2	10	361119	361128	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022079	TCAAT	2	10	363225	363234	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_022079	CACTT	2	10	370630	370639	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_022079	TGTTA	2	10	370693	370702	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022079	AGAAT	2	10	375116	375125	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022079	TTGTT	2	10	393804	393813	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022079	CAAAA	2	10	395950	395959	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_022079	TTAAC	2	10	404986	404995	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_022079	GCAAA	2	10	414981	414990	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_022079	TTTAA	2	10	415043	415052	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022079	ATTTA	2	10	417581	417590	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022079	AAAAG	2	10	418184	418193	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022079	ATTAA	2	10	419856	419865	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022079	AATAA	2	10	419916	419925	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022079	AATGC	2	10	420984	420993	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_022079	AAAAG	2	10	421094	421103	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022079	AATTG	2	10	422968	422977	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022079	TTATA	2	10	427928	427937	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022079	ATATA	2	10	427960	427969	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022079	ATGAA	2	10	434425	434434	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022079	CTCCC	2	10	436942	436951	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
65	NC_022079	AATGC	2	10	437215	437224	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_022079	AAAAT	2	10	437773	437782	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022079	AATTA	2	10	438809	438818	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022079	CAATT	2	10	442878	442887	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_022079	AATAA	2	10	442921	442930	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022079	CTTCT	2	10	444933	444942	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_022079	ATACA	2	10	446724	446733	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_022079	AGCAA	2	10	450140	450149	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_022079	AAAAT	2	10	450166	450175	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022079	AAAAT	2	10	450521	450530	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022079	AAATT	2	10	450591	450600	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022079	TTGAA	2	10	456156	456165	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022079	AATCA	2	10	456245	456254	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_022079	TATAA	2	10	457840	457849	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022079	TGTTT	2	10	463492	463501	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022079	TGAAT	2	10	476700	476709	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022079	AATTT	2	10	476752	476761	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022079	ATTTT	2	10	478606	478615	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022079	ATGTT	2	10	483004	483013	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022079	AATTA	2	10	485763	485772	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022079	TGAAT	2	10	493925	493934	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022079	TTATT	2	10	495827	495836	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022079	AGGTT	2	10	542316	542325	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022079	TGTTT	2	10	555301	555310	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022079	TTTTA	2	10	555353	555362	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022079	GATTT	2	10	564781	564790	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022079	AGTAC	2	10	580263	580272	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_022079	TTGTT	2	10	580449	580458	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022079	TTTAC	2	10	580481	580490	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_022079	ATTTT	2	10	587170	587179	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022079	ATTTC	2	10	588595	588604	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_022079	TTGAA	2	10	589707	589716	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022079	TGGAA	2	10	589824	589833	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022079	GTTTA	2	10	590535	590544	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022079	TATTT	2	10	590795	590804	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022079	ATTTT	2	10	590927	590936	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022079	ATTTT	2	10	593144	593153	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022079	ATTTT	2	10	593183	593192	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022079	ATTAT	2	10	600125	600134	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022079	ATTTA	2	10	601637	601646	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022079	ATTTA	2	10	617248	617257	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022079	GATTT	2	10	617279	617288	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022079	AATTT	2	10	620567	620576	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022079	ATTTT	2	10	624917	624926	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022079	TTTTG	2	10	627727	627736	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022079	TTTTG	2	10	639893	639902	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022079	ATTTA	2	10	644824	644833	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022079	TGTTT	2	10	671058	671067	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022079	TTTTG	2	10	671107	671116	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022079	TTTTA	2	10	677813	677822	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022079	ATTTG	2	10	691827	691836	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022079	AGAAT	2	10	692248	692257	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022079	TTTAG	2	10	694236	694245	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022079	ATTTT	2	10	694258	694267	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022079	GTATT	2	10	696875	696884	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022079	AATAG	2	10	702468	702477	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022079	GTGAT	2	10	729931	729940	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022079	TTTTG	2	10	735968	735977	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022079	TATAT	2	10	754702	754711	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022079	TTGAT	2	10	771507	771516	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022079	TTATT	2	10	777820	777829	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022079	TTCTT	2	10	799438	799447	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_022079	ATATT	2	10	799646	799655	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022079	ATGAA	2	10	800913	800922	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022079	TTATG	2	10	800970	800979	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022079	ATAAA	2	10	818756	818765	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022079	ATTTG	2	10	823781	823790	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022079	CAAGG	2	10	823947	823956	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_022079	GTATT	2	10	824484	824493	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022079	TTTTA	2	10	829010	829019	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022079	GAATT	2	10	884106	884115	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022079	CTATC	2	10	902336	902345	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_022079	ATAAA	2	10	902516	902525	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022079	AGATA	2	10	904827	904836	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022079	TAAGT	2	10	907230	907239	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022079	ATTGT	2	10	907240	907249	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.