MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Klebsiella pneumoniae JM45 plasmid p1

Total Repeats: 113

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022078	CATCAG	2	12	4485	4496	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	530573004
2	NC_022078	GCCCAC	2	12	7321	7332	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	530573006
3	NC_022078	GGCGCG	2	12	8312	8323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530573006
4	NC_022078	ATCCTG	2	12	9545	9556	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	530573007
5	NC_022078	CCGAAG	2	12	12434	12445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530573010
6	NC_022078	CAACAG	2	12	13260	13271	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	530573011
7	NC_022078	CCAGCG	2	12	19140	19151	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	530573015
8	NC_022078	GTCTTC	2	12	22571	22582	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	530573017
9	NC_022078	TGCGGG	2	12	23061	23072	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	530573017
10	NC_022078	AGAGGA	2	12	24989	25000	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022078	GCAAGC	2	12	29010	29021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_022078	TAAGCT	2	12	30246	30257	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_022078	CTGGTC	2	12	30602	30613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530573024
14	NC_022078	GACGGT	2	12	33366	33377	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	530573027
15	NC_022078	CCATCG	2	12	34789	34800	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16	NC_022078	GCGCCC	2	12	36229	36240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530573030
17	NC_022078	GGTCGG	2	12	36406	36417	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	530573030
18	NC_022078	GCTAAG	2	12	40651	40662	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	530573033
19	NC_022078	GATGGA	2	12	51662	51673	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022078	AAAGAA	2	12	59563	59574	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022078	GCAAGC	2	12	71089	71100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_022078	GCGAGA	2	12	71494	71505	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	530573052
23	NC_022078	TTCGGG	2	12	77969	77980	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_022078	TGGACG	2	12	80733	80744	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_022078	TTTCTG	2	12	84661	84672	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	530573060
26	NC_022078	TGCGGC	2	12	88862	88873	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	530573065
27	NC_022078	CATCAG	2	12	89130	89141	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	530573065
28	NC_022078	GTCCCT	2	12	91942	91953	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	530573067
29	NC_022078	TTCGTC	2	12	92666	92677	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	530573067
30	NC_022078	TTCTCT	2	12	93990	94001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530573069
31	NC_022078	ACCCAT	2	12	95081	95092	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	530573070
32	NC_022078	GATATT	2	12	104647	104658	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	530573078
33	NC_022078	AATCAA	2	12	105678	105689	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_022078	AATATC	2	12	106015	106026	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	530573081
35	NC_022078	TCCTGC	2	12	106354	106365	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	530573082
36	NC_022078	TCCGTA	2	12	108962	108973	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_022078	GAGCTG	2	12	116663	116674	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_022078	TAGAGG	2	12	119036	119047	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	530573093
39	NC_022078	TGGACG	2	12	123580	123591	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	530573096
40	NC_022078	GCTTCG	2	12	125610	125621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_022078	CGCGTC	2	12	125781	125792	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_022078	ATCAAT	2	12	129461	129472	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	530573100
43	NC_022078	TTGAAG	2	12	129552	129563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530573100
44	NC_022078	CGACCT	2	12	135638	135649	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	530573103
45	NC_022078	AGCCGC	2	12	136808	136819	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_022078	GCATCT	2	12	139664	139675	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_022078	TCAGCT	2	12	139811	139822	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_022078	CCCATC	2	12	143889	143900	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	530573110
49	NC_022078	TGACCA	2	12	149623	149634	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	530573113
50	NC_022078	GCTTGC	2	12	159423	159434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_022078	TCGGCG	2	12	159443	159454	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_022078	GCTTTT	2	12	162861	162872	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	530573121
53	NC_022078	ATCGGC	2	12	163080	163091	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	530573121
54	NC_022078	CGCCGA	2	12	164343	164354	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	530573123
55	NC_022078	GCAAGC	2	12	164363	164374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530573123
56	NC_022078	TCCAAT	2	12	166533	166544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_022078	ATGGAA	2	12	167347	167358	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022078	GGGAGC	2	12	171087	171098	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	530573126
59	NC_022078	CTGGCA	2	12	172225	172236	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_022078	TCGCGC	2	12	172970	172981	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_022078	GCGCGA	2	12	173322	173333	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_022078	CTGAAA	2	12	174793	174804	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_022078	GAAAGC	2	12	182211	182222	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	530573139
64	NC_022078	GACCGC	2	12	187339	187350	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	530573144
65	NC_022078	AACCAG	2	12	187771	187782	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	530573144
66	NC_022078	CAACGT	2	12	192715	192726	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	530573150
67	NC_022078	TCAGGC	2	12	195990	196001	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	530573153
68	NC_022078	CGGCAA	2	12	199886	199897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530573157
69	NC_022078	TAGGTG	2	12	200086	200097	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	530573157
70	NC_022078	TTCATT	2	12	200128	200139	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	530573157
71	NC_022078	TTGATG	2	12	202598	202609	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	530573160
72	NC_022078	CCGTGG	2	12	202623	202634	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	530573160
73	NC_022078	GACTGA	2	12	203693	203704	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	530573161
74	NC_022078	CCCACC	2	12	203833	203844	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	530573161
75	NC_022078	TTCAGG	2	12	205903	205914	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	530573163
76	NC_022078	GATATC	2	12	206873	206884	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	530573163
77	NC_022078	ACATAC	2	12	208773	208784	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	530573163
78	NC_022078	TCCATA	2	12	210142	210153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530573164
79	NC_022078	TAATTT	2	12	212223	212234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530573166
80	NC_022078	GATTGC	2	12	213666	213677	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	530573168
81	NC_022078	CGTAAA	2	12	216719	216730	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	530573170
82	NC_022078	TTCCAT	2	12	218092	218103	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_022078	AGATTA	2	12	223527	223538	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022078	TCTGAA	2	12	228873	228884	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_022078	GGGTTC	2	12	241480	241491	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_022078	GAAAAA	2	12	244577	244588	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	530573186
87	NC_022078	CGAGGA	2	12	245425	245436	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	530573188
88	NC_022078	TGAAAA	2	12	250938	250949	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	530573193
89	NC_022078	CCGCTG	2	12	251653	251664	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	530573194
90	NC_022078	GATATC	2	12	257051	257062	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	530573201
91	NC_022078	AAAATT	2	12	260880	260891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022078	TCTGGC	2	12	266777	266788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530573214
93	NC_022078	TCTCTT	2	12	268228	268239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530573217
94	NC_022078	CGCTGA	2	12	271178	271189	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	530573223
95	NC_022078	CATCAC	2	12	272457	272468	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	530573223
96	NC_022078	GGGAAG	2	12	276467	276478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530573227
97	NC_022078	GGTCAC	2	12	276583	276594	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	530573227
98	NC_022078	ACATCA	2	12	281019	281030	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	530573234
99	NC_022078	GTTCAG	2	12	281618	281629	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	530573234
100	NC_022078	GCTGAT	2	12	286528	286539	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	530573237
101	NC_022078	GGATAA	2	12	288765	288776	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022078	AGCGGG	2	12	290051	290062	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_022078	GGATAA	2	12	292608	292619	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022078	TTTGCC	2	12	294383	294394	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	530573238
105	NC_022078	GCCGGT	2	12	295138	295149	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	530573239
106	NC_022078	AAAAGC	2	12	298157	298168	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	530573241
107	NC_022078	TCAAAT	2	12	307263	307274	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	530573247
108	NC_022078	AATTAA	2	12	309563	309574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022078	GGGCCG	2	12	311193	311204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530573249
110	NC_022078	GGGCCG	2	12	311449	311460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530573250
111	NC_022078	AAAAGA	2	12	312608	312619	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	530573250
112	NC_022078	GATGGC	2	12	312863	312874	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	530573251
113	NC_022078	CAGACG	2	12	316399	316410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.