MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae JM45 plasmid p1

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022078	AGAGGA	2	12	24989	25000	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022078	GCAAGC	2	12	29010	29021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_022078	TAAGCT	2	12	30246	30257	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_022078	CCATCG	2	12	34789	34800	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_022078	GATGGA	2	12	51662	51673	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022078	AAAGAA	2	12	59563	59574	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022078	GCAAGC	2	12	71089	71100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_022078	TTCGGG	2	12	77969	77980	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_022078	TGGACG	2	12	80733	80744	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_022078	AATCAA	2	12	105678	105689	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_022078	TCCGTA	2	12	108962	108973	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_022078	GAGCTG	2	12	116663	116674	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_022078	GCTTCG	2	12	125610	125621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_022078	CGCGTC	2	12	125781	125792	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_022078	AGCCGC	2	12	136808	136819	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_022078	GCATCT	2	12	139664	139675	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_022078	TCAGCT	2	12	139811	139822	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_022078	GCTTGC	2	12	159423	159434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_022078	TCGGCG	2	12	159443	159454	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_022078	TCCAAT	2	12	166533	166544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_022078	ATGGAA	2	12	167347	167358	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022078	CTGGCA	2	12	172225	172236	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_022078	TCGCGC	2	12	172970	172981	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_022078	GCGCGA	2	12	173322	173333	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_022078	CTGAAA	2	12	174793	174804	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_022078	TTCCAT	2	12	218092	218103	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_022078	AGATTA	2	12	223527	223538	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022078	TCTGAA	2	12	228873	228884	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_022078	GGGTTC	2	12	241480	241491	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_022078	AAAATT	2	12	260880	260891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022078	GGATAA	2	12	288765	288776	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022078	AGCGGG	2	12	290051	290062	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_022078	GGATAA	2	12	292608	292619	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022078	AATTAA	2	12	309563	309574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022078	CAGACG	2	12	316399	316410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.