MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae JM45 plasmid p1

Total Repeats: 113

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022078	GCCCG	2	10	1942	1951	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2	NC_022078	ACCCG	2	10	1960	1969	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_022078	ACCTT	2	10	11136	11145	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_022078	CGGCG	2	10	14221	14230	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5	NC_022078	ACGGC	2	10	20531	20540	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_022078	AGGCA	2	10	21018	21027	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_022078	CAGGG	2	10	24382	24391	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_022078	CTGAC	2	10	27501	27510	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_022078	CGCAA	2	10	27529	27538	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_022078	CCAAA	2	10	30260	30269	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_022078	GGCGC	2	10	35708	35717	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12	NC_022078	AGCGG	2	10	36953	36962	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_022078	CAGGG	2	10	40436	40445	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_022078	ATCCT	2	10	44567	44576	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_022078	AATAA	2	10	44722	44731	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022078	ATCCC	2	10	45800	45809	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
17	NC_022078	GATTT	2	10	47624	47633	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022078	CCCTG	2	10	49660	49669	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_022078	ATACT	2	10	50719	50728	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_022078	ATCGT	2	10	52386	52395	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_022078	CCGAT	2	10	52633	52642	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_022078	TCTCC	2	10	53300	53309	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
23	NC_022078	GAAAG	2	10	54220	54229	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022078	GCTGA	2	10	55265	55274	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_022078	GCGGG	2	10	55325	55334	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
26	NC_022078	GAACT	2	10	59390	59399	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_022078	GCACA	2	10	62377	62386	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_022078	AGGGG	2	10	62609	62618	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022078	CGTCC	2	10	63032	63041	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_022078	CCGCG	2	10	63372	63381	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
31	NC_022078	GCCCC	2	10	66604	66613	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
32	NC_022078	ATCTC	2	10	66909	66918	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_022078	ATCAC	2	10	68403	68412	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_022078	CAGCG	2	10	72937	72946	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_022078	GGGAT	2	10	73080	73089	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022078	GCCGC	2	10	75457	75466	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
37	NC_022078	AGGGC	2	10	76671	76680	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
38	NC_022078	CCTTT	2	10	77831	77840	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_022078	CGCGC	2	10	81301	81310	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
40	NC_022078	CCTGA	2	10	96436	96445	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_022078	TTTCA	2	10	96457	96466	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_022078	CGCTG	2	10	103319	103328	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_022078	CGCAG	2	10	105216	105225	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_022078	AGCGG	2	10	105240	105249	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
45	NC_022078	CGGCC	2	10	116596	116605	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
46	NC_022078	CAAGC	2	10	118683	118692	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_022078	GCTAA	2	10	120909	120918	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_022078	GCCGC	2	10	121122	121131	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
49	NC_022078	TTAGC	2	10	131236	131245	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_022078	ATTCT	2	10	135462	135471	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_022078	ATCGC	2	10	137046	137055	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_022078	TTTAA	2	10	142506	142515	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022078	CAGGG	2	10	145703	145712	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
54	NC_022078	CGGGC	2	10	146611	146620	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
55	NC_022078	CTGCT	2	10	148145	148154	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_022078	CGCTG	2	10	151209	151218	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_022078	AGATG	2	10	155473	155482	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022078	GACGG	2	10	156141	156150	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_022078	GGCCT	2	10	156347	156356	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
60	NC_022078	GAGCA	2	10	156536	156545	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_022078	TCCCA	2	10	157109	157118	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
62	NC_022078	TGACC	2	10	157893	157902	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_022078	AACTG	2	10	159020	159029	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_022078	CAAGC	2	10	159545	159554	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_022078	ACGAG	2	10	169315	169324	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_022078	AACAC	2	10	178497	178506	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_022078	CAATC	2	10	179193	179202	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_022078	ATCAT	2	10	181317	181326	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_022078	ATATC	2	10	181388	181397	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_022078	TATCA	2	10	181426	181435	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_022078	CCCGG	2	10	186830	186839	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
72	NC_022078	AAAAT	2	10	190651	190660	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022078	AGCGG	2	10	191387	191396	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
74	NC_022078	CAGGC	2	10	192084	192093	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_022078	GGCAT	2	10	192379	192388	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_022078	TAAAT	2	10	200880	200889	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022078	AATGA	2	10	200909	200918	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022078	CCGTC	2	10	215124	215133	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
79	NC_022078	CTGTA	2	10	222576	222585	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_022078	CCCTT	2	10	223835	223844	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
81	NC_022078	AGACG	2	10	228887	228896	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_022078	ACAGA	2	10	229000	229009	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_022078	CTTCT	2	10	231221	231230	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_022078	TCACA	2	10	237861	237870	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_022078	GGAGA	2	10	240075	240084	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022078	ATCGG	2	10	240742	240751	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_022078	ACGAT	2	10	240989	240998	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_022078	GAGTG	2	10	241774	241783	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022078	GCCAT	2	10	242073	242082	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_022078	TCGCG	2	10	242177	242186	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
91	NC_022078	GTGCC	2	10	242268	242277	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
92	NC_022078	CCTCA	2	10	243122	243131	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
93	NC_022078	GCCGC	2	10	244160	244169	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
94	NC_022078	TTTCC	2	10	247261	247270	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_022078	ATGGT	2	10	252549	252558	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022078	CTGGT	2	10	254202	254211	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_022078	GTAGC	2	10	254629	254638	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_022078	GCCGC	2	10	255855	255864	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
99	NC_022078	TTTCC	2	10	258355	258364	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
100	NC_022078	GCCGC	2	10	258643	258652	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
101	NC_022078	CTGTT	2	10	277905	277914	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_022078	TGACC	2	10	288954	288963	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_022078	CACGA	2	10	289150	289159	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_022078	GGACG	2	10	290199	290208	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
105	NC_022078	GACCT	2	10	291352	291361	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_022078	AAGGA	2	10	292646	292655	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022078	CGGGC	2	10	293195	293204	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
108	NC_022078	CGTAT	2	10	294889	294898	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_022078	TATCT	2	10	300514	300523	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_022078	CAGGG	2	10	303148	303157	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
111	NC_022078	CAACG	2	10	305246	305255	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_022078	TTGCG	2	10	315899	315908	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_022078	TTTTC	2	10	316012	316021	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.