MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae JM45 plasmid p1

Total Repeats: 156

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022078	ACGGC	2	10	3813	3822	20 %	0 %	40 %	40 %	530573003
2	NC_022078	CACGG	2	10	4289	4298	20 %	0 %	40 %	40 %	530573003
3	NC_022078	GCGCC	2	10	5066	5075	0 %	0 %	40 %	60 %	530573004
4	NC_022078	CTGTA	2	10	6980	6989	20 %	40 %	20 %	20 %	530573006
5	NC_022078	GCTGA	2	10	7840	7849	20 %	20 %	40 %	20 %	530573006
6	NC_022078	CGCAC	2	10	7937	7946	20 %	0 %	20 %	60 %	530573006
7	NC_022078	TCACG	2	10	8223	8232	20 %	20 %	20 %	40 %	530573006
8	NC_022078	CGCAG	2	10	8866	8875	20 %	0 %	40 %	40 %	530573007
9	NC_022078	TCACC	2	10	8908	8917	20 %	20 %	0 %	60 %	530573007
10	NC_022078	GCGGT	2	10	9339	9348	0 %	20 %	60 %	20 %	530573007
11	NC_022078	CAGCG	2	10	14557	14566	20 %	0 %	40 %	40 %	530573012
12	NC_022078	CTGGC	2	10	15091	15100	0 %	20 %	40 %	40 %	530573012
13	NC_022078	TGGTC	2	10	16493	16502	0 %	40 %	40 %	20 %	530573013
14	NC_022078	TGCTC	2	10	17746	17755	0 %	40 %	20 %	40 %	530573014
15	NC_022078	GCGAC	2	10	18670	18679	20 %	0 %	40 %	40 %	530573015
16	NC_022078	CCGAA	2	10	21575	21584	40 %	0 %	20 %	40 %	530573016
17	NC_022078	CAGCC	2	10	21653	21662	20 %	0 %	20 %	60 %	530573016
18	NC_022078	ACCTG	2	10	25513	25522	20 %	20 %	20 %	40 %	530573021
19	NC_022078	TGAAG	2	10	25968	25977	40 %	20 %	40 %	0 %	530573021
20	NC_022078	GCGCG	2	10	30322	30331	0 %	0 %	60 %	40 %	530573024
21	NC_022078	GGCCT	2	10	31295	31304	0 %	20 %	40 %	40 %	530573025
22	NC_022078	AACCG	2	10	33467	33476	40 %	0 %	20 %	40 %	530573027
23	NC_022078	GGGCG	2	10	40309	40318	0 %	0 %	80 %	20 %	530573032
24	NC_022078	GCCAG	2	10	40808	40817	20 %	0 %	40 %	40 %	530573033
25	NC_022078	CACGG	2	10	41257	41266	20 %	0 %	40 %	40 %	530573034
26	NC_022078	GCGCG	2	10	41608	41617	0 %	0 %	60 %	40 %	530573034
27	NC_022078	CGATG	2	10	42786	42795	20 %	20 %	40 %	20 %	530573034
28	NC_022078	TTGGC	2	10	43278	43287	0 %	40 %	40 %	20 %	530573034
29	NC_022078	CCTCA	2	10	45324	45333	20 %	20 %	0 %	60 %	530573036
30	NC_022078	TTTGC	2	10	47424	47433	0 %	60 %	20 %	20 %	530573037
31	NC_022078	TGATC	2	10	47466	47475	20 %	40 %	20 %	20 %	530573037
32	NC_022078	TTTGC	2	10	49499	49508	0 %	60 %	20 %	20 %	530573039
33	NC_022078	TGATC	2	10	49541	49550	20 %	40 %	20 %	20 %	530573039
34	NC_022078	GAGCT	2	10	55784	55793	20 %	20 %	40 %	20 %	530573041
35	NC_022078	TTTTC	2	10	56462	56471	0 %	80 %	0 %	20 %	530573041
36	NC_022078	ACGGT	2	10	60769	60778	20 %	20 %	40 %	20 %	530573044
37	NC_022078	TGCTC	2	10	64076	64085	0 %	40 %	20 %	40 %	530573047
38	NC_022078	AGGCC	2	10	64265	64274	20 %	0 %	40 %	40 %	530573047
39	NC_022078	GCCGA	2	10	64625	64634	20 %	0 %	40 %	40 %	530573048
40	NC_022078	GGCCC	2	10	65823	65832	0 %	0 %	40 %	60 %	530573049
41	NC_022078	ATTTT	2	10	72345	72354	20 %	80 %	0 %	0 %	530573053
42	NC_022078	TTGGC	2	10	74979	74988	0 %	40 %	40 %	20 %	530573054
43	NC_022078	GAAGC	2	10	77090	77099	40 %	0 %	40 %	20 %	530573056
44	NC_022078	CGTTG	2	10	82994	83003	0 %	40 %	40 %	20 %	530573057
45	NC_022078	TCAGT	2	10	83793	83802	20 %	40 %	20 %	20 %	530573058
46	NC_022078	AGTCC	2	10	84793	84802	20 %	20 %	20 %	40 %	530573060
47	NC_022078	TTTGT	2	10	85029	85038	0 %	80 %	20 %	0 %	530573060
48	NC_022078	AAGCA	2	10	87067	87076	60 %	0 %	20 %	20 %	530573061
49	NC_022078	GCATC	2	10	91762	91771	20 %	20 %	20 %	40 %	530573067
50	NC_022078	CTGCG	2	10	92273	92282	0 %	20 %	40 %	40 %	530573067
51	NC_022078	GTTCA	2	10	93559	93568	20 %	40 %	20 %	20 %	530573068
52	NC_022078	TGTTT	2	10	93650	93659	0 %	80 %	20 %	0 %	530573068
53	NC_022078	ATTTT	2	10	94663	94672	20 %	80 %	0 %	0 %	530573069
54	NC_022078	GCTTG	2	10	95152	95161	0 %	40 %	40 %	20 %	530573070
55	NC_022078	CTTTT	2	10	98991	99000	0 %	80 %	0 %	20 %	530573071
56	NC_022078	GGGCG	2	10	99683	99692	0 %	0 %	80 %	20 %	530573071
57	NC_022078	ATTTC	2	10	103410	103419	20 %	60 %	0 %	20 %	530573075
58	NC_022078	GGTTT	2	10	110276	110285	0 %	60 %	40 %	0 %	530573087
59	NC_022078	TGATC	2	10	112162	112171	20 %	40 %	20 %	20 %	530573089
60	NC_022078	TCAGA	2	10	114288	114297	40 %	20 %	20 %	20 %	530573090
61	NC_022078	CGGTT	2	10	114500	114509	0 %	40 %	40 %	20 %	530573090
62	NC_022078	GCAAT	2	10	118112	118121	40 %	20 %	20 %	20 %	530573092
63	NC_022078	CGCGC	2	10	124148	124157	0 %	0 %	40 %	60 %	530573096
64	NC_022078	TTTGC	2	10	127377	127386	0 %	60 %	20 %	20 %	530573098
65	NC_022078	TGATC	2	10	127419	127428	20 %	40 %	20 %	20 %	530573098
66	NC_022078	GCCAG	2	10	133521	133530	20 %	0 %	40 %	40 %	530573102
67	NC_022078	AGCGC	2	10	134031	134040	20 %	0 %	40 %	40 %	530573102
68	NC_022078	GCCAG	2	10	134811	134820	20 %	0 %	40 %	40 %	530573102
69	NC_022078	GGCCG	2	10	135304	135313	0 %	0 %	60 %	40 %	530573102
70	NC_022078	GAAGC	2	10	135542	135551	40 %	0 %	40 %	20 %	530573103
71	NC_022078	TGTGG	2	10	136078	136087	0 %	40 %	60 %	0 %	530573104
72	NC_022078	TTTCG	2	10	137403	137412	0 %	60 %	20 %	20 %	530573105
73	NC_022078	TGCTC	2	10	140618	140627	0 %	40 %	20 %	40 %	530573107
74	NC_022078	AGGCC	2	10	140807	140816	20 %	0 %	40 %	40 %	530573107
75	NC_022078	AGCTC	2	10	143491	143500	20 %	20 %	20 %	40 %	530573110
76	NC_022078	GCGAG	2	10	150328	150337	20 %	0 %	60 %	20 %	530573113
77	NC_022078	AACTT	2	10	152813	152822	40 %	40 %	0 %	20 %	530573114
78	NC_022078	GGCCT	2	10	154487	154496	0 %	20 %	40 %	40 %	530573116
79	NC_022078	GAGCA	2	10	154676	154685	40 %	0 %	40 %	20 %	530573116
80	NC_022078	TGCTC	2	10	158693	158702	0 %	40 %	20 %	40 %	530573117
81	NC_022078	AGGCC	2	10	158882	158891	20 %	0 %	40 %	40 %	530573117
82	NC_022078	GCGCC	2	10	169691	169700	0 %	0 %	40 %	60 %	530573126
83	NC_022078	GCGCA	2	10	170363	170372	20 %	0 %	40 %	40 %	530573126
84	NC_022078	CGGCC	2	10	170928	170937	0 %	0 %	40 %	60 %	530573126
85	NC_022078	CCGTG	2	10	171259	171268	0 %	20 %	40 %	40 %	530573126
86	NC_022078	CGGGC	2	10	173648	173657	0 %	0 %	60 %	40 %	530573127
87	NC_022078	GACGC	2	10	175293	175302	20 %	0 %	40 %	40 %	530573128
88	NC_022078	GTTGA	2	10	178436	178445	20 %	40 %	40 %	0 %	530573131
89	NC_022078	CTTCA	2	10	178842	178851	20 %	40 %	0 %	40 %	530573132
90	NC_022078	GCCAT	2	10	185010	185019	20 %	20 %	20 %	40 %	530573141
91	NC_022078	CGGGA	2	10	188504	188513	20 %	0 %	60 %	20 %	530573145
92	NC_022078	ACCAT	2	10	189812	189821	40 %	20 %	0 %	40 %	530573147
93	NC_022078	TTCAG	2	10	190096	190105	20 %	40 %	20 %	20 %	530573147
94	NC_022078	TGGAA	2	10	190885	190894	40 %	20 %	40 %	0 %	530573149
95	NC_022078	ATCGA	2	10	193182	193191	40 %	20 %	20 %	20 %	530573150
96	NC_022078	AGACC	2	10	195486	195495	40 %	0 %	20 %	40 %	530573153
97	NC_022078	CATCG	2	10	195793	195802	20 %	20 %	20 %	40 %	530573153
98	NC_022078	TTCCC	2	10	196879	196888	0 %	40 %	0 %	60 %	530573155
99	NC_022078	AGTTA	2	10	197010	197019	40 %	40 %	20 %	0 %	530573155
100	NC_022078	GGTCA	2	10	200679	200688	20 %	20 %	40 %	20 %	530573157
101	NC_022078	CGTAT	2	10	202020	202029	20 %	40 %	20 %	20 %	530573159
102	NC_022078	ACGCA	2	10	202836	202845	40 %	0 %	20 %	40 %	530573161
103	NC_022078	GACAG	2	10	204864	204873	40 %	0 %	40 %	20 %	530573161
104	NC_022078	ATTCG	2	10	205385	205394	20 %	40 %	20 %	20 %	530573162
105	NC_022078	CGTCG	2	10	206969	206978	0 %	20 %	40 %	40 %	530573163
106	NC_022078	CTGTC	2	10	207100	207109	0 %	40 %	20 %	40 %	530573163
107	NC_022078	AGGCA	2	10	208937	208946	40 %	0 %	40 %	20 %	530573163
108	NC_022078	AGCTC	2	10	213400	213409	20 %	20 %	20 %	40 %	530573168
109	NC_022078	TTATC	2	10	214526	214535	20 %	60 %	0 %	20 %	530573168
110	NC_022078	ATCAC	2	10	216505	216514	40 %	20 %	0 %	40 %	530573169
111	NC_022078	CCAGC	2	10	216814	216823	20 %	0 %	20 %	60 %	530573170
112	NC_022078	ATGGC	2	10	217706	217715	20 %	20 %	40 %	20 %	530573171
113	NC_022078	GTGAT	2	10	218384	218393	20 %	40 %	40 %	0 %	530573172
114	NC_022078	TACTG	2	10	219906	219915	20 %	40 %	20 %	20 %	530573173
115	NC_022078	TTTGC	2	10	227153	227162	0 %	60 %	20 %	20 %	530573176
116	NC_022078	TGATC	2	10	227195	227204	20 %	40 %	20 %	20 %	530573176
117	NC_022078	ACTGA	2	10	233490	233499	40 %	20 %	20 %	20 %	530573178
118	NC_022078	CTGCA	2	10	233695	233704	20 %	20 %	20 %	40 %	530573178
119	NC_022078	AGGGA	2	10	239314	239323	40 %	0 %	60 %	0 %	530573181
120	NC_022078	CTGCG	2	10	242429	242438	0 %	20 %	40 %	40 %	530573182
121	NC_022078	TGTCG	2	10	242480	242489	0 %	40 %	40 %	20 %	530573182
122	NC_022078	CGCAG	2	10	248596	248605	20 %	0 %	40 %	40 %	530573191
123	NC_022078	TGTGG	2	10	249098	249107	0 %	40 %	60 %	0 %	530573192
124	NC_022078	ATGAA	2	10	249990	249999	60 %	20 %	20 %	0 %	530573192
125	NC_022078	GCGTT	2	10	250356	250365	0 %	40 %	40 %	20 %	530573192
126	NC_022078	CATTC	2	10	259108	259117	20 %	40 %	0 %	40 %	530573205
127	NC_022078	GGAAA	2	10	261374	261383	60 %	0 %	40 %	0 %	530573207
128	NC_022078	TTCAG	2	10	264226	264235	20 %	40 %	20 %	20 %	530573211
129	NC_022078	CGTGC	2	10	264598	264607	0 %	20 %	40 %	40 %	530573212
130	NC_022078	TGACC	2	10	265787	265796	20 %	20 %	20 %	40 %	530573213
131	NC_022078	AAGCT	2	10	267192	267201	40 %	20 %	20 %	20 %	530573215
132	NC_022078	TACCG	2	10	272425	272434	20 %	20 %	20 %	40 %	530573223
133	NC_022078	TTCGG	2	10	272638	272647	0 %	40 %	40 %	20 %	530573223
134	NC_022078	ACCGT	2	10	273644	273653	20 %	20 %	20 %	40 %	530573224
135	NC_022078	TTCTG	2	10	274558	274567	0 %	60 %	20 %	20 %	530573225
136	NC_022078	AGTCC	2	10	274621	274630	20 %	20 %	20 %	40 %	530573225
137	NC_022078	GAAGG	2	10	276314	276323	40 %	0 %	60 %	0 %	530573227
138	NC_022078	GGAAA	2	10	278532	278541	60 %	0 %	40 %	0 %	530573230
139	NC_022078	AAAAT	2	10	280343	280352	80 %	20 %	0 %	0 %	530573233
140	NC_022078	GCGTG	2	10	282330	282339	0 %	20 %	60 %	20 %	530573235
141	NC_022078	TTTAT	2	10	286502	286511	20 %	80 %	0 %	0 %	530573237
142	NC_022078	CGTGC	2	10	287423	287432	0 %	20 %	40 %	40 %	530573237
143	NC_022078	CCTGT	2	10	288028	288037	0 %	40 %	20 %	40 %	530573237
144	NC_022078	ACCGT	2	10	288404	288413	20 %	20 %	20 %	40 %	530573237
145	NC_022078	TGGTG	2	10	295021	295030	0 %	40 %	60 %	0 %	530573239
146	NC_022078	AAAAT	2	10	299330	299339	80 %	20 %	0 %	0 %	530573241
147	NC_022078	CTGGA	2	10	300137	300146	20 %	20 %	40 %	20 %	530573243
148	NC_022078	AGACG	2	10	307525	307534	40 %	0 %	40 %	20 %	530573247
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150	NC_022078	TGATC	2	10	311046	311055	20 %	40 %	20 %	20 %	530573248
151	NC_022078	AATTC	2	10	312950	312959	40 %	40 %	0 %	20 %	530573251
152	NC_022078	CGCAG	2	10	312968	312977	20 %	0 %	40 %	40 %	530573251
153	NC_022078	AACTG	2	10	313895	313904	40 %	20 %	20 %	20 %	530573251
154	NC_022078	AGACC	2	10	313964	313973	40 %	0 %	20 %	40 %	530573251
155	NC_022078	TGACC	2	10	314687	314696	20 %	20 %	20 %	40 %	530573251
156	NC_022078	CTGTC	2	10	315292	315301	0 %	40 %	20 %	40 %	530573251

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.