MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae JM45 plasmid p1

Total Repeats: 299

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022078	AGCG	2	8	1749	1756	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_022078	TCTG	2	8	1984	1991	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_022078	TAAA	2	8	10265	10272	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022078	AGGT	2	8	10321	10328	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022078	GGAT	2	8	10337	10344	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022078	TCCA	2	8	11367	11374	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_022078	ATAA	2	8	11575	11582	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022078	CTGG	2	8	13642	13649	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_022078	CTGG	2	8	14203	14210	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_022078	GTGA	2	8	19765	19772	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022078	ACCA	2	8	19988	19995	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_022078	CCAA	2	8	20138	20145	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_022078	TATG	2	8	20220	20227	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022078	CTGT	2	8	20363	20370	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_022078	CAGT	2	8	20662	20669	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_022078	TAAG	2	8	21365	21372	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022078	CAGC	2	8	21762	21769	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_022078	GGCC	2	8	22100	22107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_022078	TTGC	2	8	24609	24616	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_022078	AAGC	2	8	27166	27173	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_022078	AGAC	2	8	27280	27287	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_022078	ATAG	2	8	27347	27354	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022078	TTCA	2	8	27575	27582	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_022078	GCTT	2	8	27655	27662	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_022078	TATC	2	8	28165	28172	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_022078	GTCG	2	8	28980	28987	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_022078	GACA	2	8	29470	29477	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_022078	CAGC	2	8	33745	33752	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_022078	CCGT	2	8	34775	34782	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_022078	TCGG	2	8	34860	34867	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_022078	CTGG	2	8	34904	34911	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_022078	GCAG	2	8	35801	35808	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_022078	CAGC	2	8	37140	37147	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_022078	GGCA	2	8	37361	37368	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_022078	TTGA	2	8	37621	37628	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022078	CGCT	2	8	37810	37817	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_022078	AATA	2	8	39456	39463	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022078	AATA	2	8	39489	39496	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022078	CTTG	2	8	44651	44658	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_022078	GGCG	2	8	45782	45789	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_022078	CTGC	2	8	45951	45958	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_022078	CGTT	2	8	46293	46300	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_022078	TAAT	2	8	48470	48477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022078	TACA	2	8	50064	50071	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_022078	TGGT	2	8	50962	50969	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022078	GTTT	2	8	51926	51933	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022078	CTGA	2	8	52689	52696	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_022078	TCCA	2	8	53008	53015	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_022078	TTCT	2	8	53115	53122	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_022078	TGGC	2	8	53540	53547	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_022078	TGTA	2	8	53684	53691	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022078	CCAT	2	8	53771	53778	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_022078	TCGC	2	8	54267	54274	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_022078	CGCC	2	8	55244	55251	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55	NC_022078	AGCG	2	8	57996	58003	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_022078	CAGC	2	8	58925	58932	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_022078	ACCC	2	8	59295	59302	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
58	NC_022078	TACC	2	8	62807	62814	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_022078	ACGC	2	8	66946	66953	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_022078	AGCT	2	8	67092	67099	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_022078	CGGT	2	8	67250	67257	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_022078	ATCG	2	8	68138	68145	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_022078	AGGT	2	8	68175	68182	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022078	TCCG	2	8	68447	68454	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_022078	GCTG	2	8	68567	68574	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_022078	TTTA	2	8	70954	70961	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022078	GCCG	2	8	72728	72735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_022078	CGCC	2	8	73631	73638	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
69	NC_022078	GTAA	2	8	73742	73749	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022078	CAGG	2	8	75449	75456	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_022078	AGCG	2	8	76070	76077	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_022078	CGGC	2	8	76079	76086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_022078	CTGC	2	8	76332	76339	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_022078	ACCT	2	8	76492	76499	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_022078	AGTG	2	8	76763	76770	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022078	GCCG	2	8	78117	78124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_022078	CGCT	2	8	78147	78154	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_022078	GCCG	2	8	78235	78242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_022078	GATG	2	8	78450	78457	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022078	TGCT	2	8	78477	78484	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_022078	GCAA	2	8	78511	78518	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_022078	CAGG	2	8	78526	78533	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_022078	CTGC	2	8	78691	78698	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_022078	CCAG	2	8	78839	78846	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_022078	CCCG	2	8	79398	79405	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
86	NC_022078	GCGT	2	8	79652	79659	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_022078	GCCG	2	8	80200	80207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_022078	GCCG	2	8	80272	80279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_022078	CCAG	2	8	80691	80698	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_022078	CGGC	2	8	81246	81253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_022078	CGTG	2	8	81409	81416	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_022078	GATT	2	8	82004	82011	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022078	AAGC	2	8	82185	82192	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_022078	TTAC	2	8	82292	82299	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_022078	ATAC	2	8	83153	83160	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_022078	TTTG	2	8	83230	83237	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022078	GCGG	2	8	83272	83279	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
98	NC_022078	CTTA	2	8	87241	87248	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_022078	TAAT	2	8	95934	95941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022078	AAAT	2	8	96176	96183	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022078	ATTC	2	8	96228	96235	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_022078	TCTT	2	8	96473	96480	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_022078	TCTT	2	8	101259	101266	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_022078	TTTC	2	8	101422	101429	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_022078	TCGC	2	8	101800	101807	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_022078	ATTA	2	8	102146	102153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022078	AATC	2	8	102181	102188	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_022078	TTTG	2	8	104223	104230	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022078	TTTG	2	8	104458	104465	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022078	CGGG	2	8	105380	105387	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
111	NC_022078	AGCA	2	8	105452	105459	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_022078	CGGT	2	8	108720	108727	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_022078	GGCT	2	8	108758	108765	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_022078	AGAA	2	8	109025	109032	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022078	CCTG	2	8	114082	114089	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_022078	GCTG	2	8	116218	116225	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_022078	CAGC	2	8	116416	116423	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_022078	GCGG	2	8	117093	117100	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119	NC_022078	ACCA	2	8	117109	117116	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_022078	GGTT	2	8	118370	118377	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022078	TCAA	2	8	118672	118679	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_022078	CGTA	2	8	119887	119894	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_022078	TCAC	2	8	120238	120245	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_022078	TCGC	2	8	120821	120828	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_022078	GCAA	2	8	121055	121062	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_022078	CAGG	2	8	121114	121121	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_022078	AGCG	2	8	121735	121742	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_022078	CGGC	2	8	121744	121751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_022078	CGGG	2	8	125595	125602	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
130	NC_022078	GGGT	2	8	126174	126181	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022078	TTTC	2	8	129947	129954	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_022078	AGCG	2	8	130760	130767	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_022078	ACTT	2	8	131115	131122	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_022078	ATGA	2	8	131358	131365	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022078	TAAA	2	8	132462	132469	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022078	AGCG	2	8	136856	136863	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_022078	GAGT	2	8	139153	139160	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022078	AACA	2	8	139225	139232	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_022078	ATCA	2	8	139291	139298	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_022078	AGCA	2	8	139873	139880	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_022078	CGCT	2	8	139949	139956	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_022078	GATT	2	8	142486	142493	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022078	GCCG	2	8	144030	144037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_022078	CGCT	2	8	144812	144819	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_022078	GGCT	2	8	145391	145398	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_022078	ATGG	2	8	145454	145461	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022078	GCTG	2	8	145508	145515	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_022078	TGCG	2	8	145863	145870	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_022078	GCCG	2	8	146723	146730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_022078	CTTG	2	8	147265	147272	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_022078	CCAT	2	8	147358	147365	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_022078	GCCC	2	8	147836	147843	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
153	NC_022078	GCTT	2	8	149176	149183	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
154	NC_022078	CGGC	2	8	151420	151427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.