MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1926 plasmid

Total Repeats: 656

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022051	CAA	2	6	666	671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341461
2	NC_022051	TAT	2	6	684	689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341461
3	NC_022051	TGA	3	9	756	764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341462
4	NC_022051	CTG	2	6	966	971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530341462
5	NC_022051	TCC	2	6	979	984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530341462
6	NC_022051	TAG	2	6	996	1001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341462
7	NC_022051	ACC	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530341462
8	NC_022051	AAT	2	6	1096	1101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341462
9	NC_022051	ATT	2	6	1140	1145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341463
10	NC_022051	CAA	2	6	1150	1155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341463
11	NC_022051	CAA	2	6	1190	1195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341463
12	NC_022051	CTT	2	6	1226	1231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341463
13	NC_022051	CAG	2	6	1238	1243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530341463
14	NC_022051	TAC	2	6	1247	1252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341463
15	NC_022051	AAT	2	6	1396	1401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341463
16	NC_022051	CTG	2	6	1487	1492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530341463
17	NC_022051	ATA	2	6	1522	1527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341463
18	NC_022051	AAG	2	6	2394	2399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341464
19	NC_022051	TTA	2	6	2408	2413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341464
20	NC_022051	TGC	2	6	2860	2865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530341464
21	NC_022051	TGC	2	6	2910	2915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530341464
22	NC_022051	GCA	2	6	3011	3016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530341464
23	NC_022051	TAA	2	6	3031	3036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341464
24	NC_022051	CTA	2	6	3159	3164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341464
25	NC_022051	CTA	2	6	3330	3335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341464
26	NC_022051	AGA	2	6	3410	3415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341464
27	NC_022051	ATT	2	6	3490	3495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341464
28	NC_022051	AGA	2	6	3523	3528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341464
29	NC_022051	AAT	2	6	3608	3613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341464
30	NC_022051	ATC	2	6	3626	3631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341464
31	NC_022051	ATT	2	6	3852	3857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341465
32	NC_022051	ATT	2	6	4020	4025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341465
33	NC_022051	GCC	2	6	4174	4179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530341465
34	NC_022051	AAT	2	6	4247	4252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341465
35	NC_022051	AGT	2	6	4448	4453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341465
36	NC_022051	ATG	2	6	4468	4473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341465
37	NC_022051	CAA	2	6	4742	4747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341466
38	NC_022051	CAA	2	6	4778	4783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341466
39	NC_022051	TTA	2	6	4979	4984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341466
40	NC_022051	ATA	2	6	5071	5076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341466
41	NC_022051	GAT	2	6	5162	5167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341467
42	NC_022051	TAG	2	6	5179	5184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341467
43	NC_022051	ATC	2	6	5211	5216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341467
44	NC_022051	TCC	2	6	5287	5292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530341467
45	NC_022051	CCA	2	6	5303	5308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530341467
46	NC_022051	GCA	2	6	5340	5345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530341467
47	NC_022051	TGA	2	6	5375	5380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341467
48	NC_022051	CTT	2	6	5398	5403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341467
49	NC_022051	TTG	2	6	5404	5409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530341467
50	NC_022051	GTA	2	6	5418	5423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341467
51	NC_022051	TGG	2	6	5446	5451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530341467
52	NC_022051	ATA	2	6	5483	5488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341467
53	NC_022051	TCA	2	6	5730	5735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341468
54	NC_022051	TAG	3	9	5821	5829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341468
55	NC_022051	TCG	2	6	5927	5932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530341468
56	NC_022051	CAG	2	6	5949	5954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530341468
57	NC_022051	CAT	2	6	6024	6029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341468
58	NC_022051	CCA	2	6	6042	6047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530341468
59	NC_022051	TAT	2	6	6057	6062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341468
60	NC_022051	TAT	2	6	6168	6173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341468
61	NC_022051	ATA	2	6	6185	6190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341468
62	NC_022051	GCA	2	6	6230	6235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530341468
63	NC_022051	TTC	2	6	6355	6360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341468
64	NC_022051	TTC	2	6	6673	6678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341468
65	NC_022051	CAC	2	6	6825	6830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530341468
66	NC_022051	GGA	2	6	6842	6847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530341468
67	NC_022051	ATA	2	6	6869	6874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341468
68	NC_022051	CTT	2	6	6945	6950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341468
69	NC_022051	CTT	2	6	7020	7025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341468
70	NC_022051	TCA	2	6	7049	7054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341468
71	NC_022051	TGC	2	6	7093	7098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530341468
72	NC_022051	GAA	2	6	7109	7114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341468
73	NC_022051	ATA	2	6	7169	7174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341468
74	NC_022051	TCG	2	6	7175	7180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530341468
75	NC_022051	CTT	2	6	7236	7241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341468
76	NC_022051	TAC	2	6	7330	7335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341468
77	NC_022051	AAT	2	6	7375	7380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341468
78	NC_022051	CTT	2	6	7437	7442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341468
79	NC_022051	CCA	2	6	7457	7462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530341468
80	NC_022051	ATT	3	9	7463	7471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341468
81	NC_022051	TAA	2	6	7495	7500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341468
82	NC_022051	CAA	2	6	7536	7541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341468
83	NC_022051	TAA	2	6	7581	7586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341468
84	NC_022051	TCA	2	6	7610	7615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341468
85	NC_022051	ATC	2	6	7624	7629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341468
86	NC_022051	CTT	2	6	7659	7664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341468
87	NC_022051	TTC	2	6	7669	7674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341468
88	NC_022051	TTG	2	6	7677	7682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530341468
89	NC_022051	CTT	2	6	7847	7852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341469
90	NC_022051	TAA	2	6	7898	7903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341469
91	NC_022051	TAG	2	6	7906	7911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341469
92	NC_022051	ACT	2	6	7939	7944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341469
93	NC_022051	GTT	2	6	7978	7983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530341469
94	NC_022051	ATT	2	6	8184	8189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341469
95	NC_022051	TTA	2	6	8463	8468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341470
96	NC_022051	TTC	2	6	8514	8519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341470
97	NC_022051	TAA	2	6	8738	8743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341470
98	NC_022051	AAT	2	6	8752	8757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341470
99	NC_022051	ATA	2	6	8779	8784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341470
100	NC_022051	TAA	2	6	8795	8800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341470
101	NC_022051	GAT	2	6	8841	8846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341470
102	NC_022051	TCA	2	6	8848	8853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341470
103	NC_022051	CAC	2	6	8897	8902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530341470
104	NC_022051	CTT	2	6	8921	8926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341470
105	NC_022051	TAA	2	6	9229	9234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341471
106	NC_022051	GAA	2	6	9341	9346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341471
107	NC_022051	TGG	2	6	9405	9410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530341471
108	NC_022051	ATA	2	6	9555	9560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341471
109	NC_022051	CTT	2	6	9570	9575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341471
110	NC_022051	ATT	2	6	9593	9598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341471
111	NC_022051	ATT	2	6	9724	9729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341471
112	NC_022051	AAT	3	9	9781	9789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341471
113	NC_022051	CTG	2	6	9981	9986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530341471
114	NC_022051	TAC	2	6	10077	10082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341471
115	NC_022051	GGA	2	6	10135	10140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530341471
116	NC_022051	GTT	2	6	10165	10170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530341471
117	NC_022051	GGA	2	6	10267	10272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530341471
118	NC_022051	TCT	2	6	10279	10284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341471
119	NC_022051	TAA	2	6	10287	10292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341471
120	NC_022051	GGT	2	6	10309	10314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530341471
121	NC_022051	TAA	2	6	10564	10569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341471
122	NC_022051	TAG	2	6	10606	10611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341471
123	NC_022051	AAT	2	6	10622	10627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341471
124	NC_022051	GAG	2	6	10639	10644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530341471
125	NC_022051	TCT	2	6	11011	11016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341472
126	NC_022051	ATC	2	6	11178	11183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341449
127	NC_022051	AAT	2	6	11187	11192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341449
128	NC_022051	TCT	2	6	11206	11211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341449
129	NC_022051	CTT	2	6	11372	11377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341449
130	NC_022051	CAT	2	6	11388	11393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341449
131	NC_022051	TAA	2	6	11439	11444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341449
132	NC_022051	CTC	2	6	11513	11518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530341449
133	NC_022051	GTT	2	6	11700	11705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530341449
134	NC_022051	TCC	2	6	11716	11721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530341449
135	NC_022051	CTT	2	6	11759	11764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341449
136	NC_022051	ATA	2	6	11778	11783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341449
137	NC_022051	TAA	2	6	11910	11915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341449
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140	NC_022051	TCT	2	6	12292	12297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341473
141	NC_022051	ATT	2	6	12370	12375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341473
142	NC_022051	TGT	2	6	12450	12455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530341473
143	NC_022051	TTA	2	6	12477	12482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341473
144	NC_022051	AGC	2	6	12507	12512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530341473
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155	NC_022051	AGT	2	6	13822	13827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341474
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159	NC_022051	TAT	2	6	14061	14066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341474
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162	NC_022051	GTT	2	6	14372	14377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530341474
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240	NC_022051	CAT	2	6	20348	20353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341479
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249	NC_022051	AGC	2	6	21447	21452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530341481
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252	NC_022051	CAA	2	6	21664	21669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341481
253	NC_022051	ACA	2	6	21699	21704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341481
254	NC_022051	TAC	2	6	21774	21779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341481
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256	NC_022051	CTT	2	6	21972	21977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341481
257	NC_022051	TGA	2	6	22010	22015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341481
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261	NC_022051	ATT	2	6	22633	22638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341481
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381	NC_022051	AGA	2	6	31567	31572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341492
382	NC_022051	GAT	2	6	31721	31726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341492
383	NC_022051	GAA	3	9	31861	31869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341493
384	NC_022051	ATT	2	6	31878	31883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341493
385	NC_022051	AAG	2	6	31889	31894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341493
386	NC_022051	ATA	2	6	32042	32047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341493
387	NC_022051	ACT	2	6	32219	32224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341493
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390	NC_022051	CAC	2	6	32627	32632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530341494
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392	NC_022051	TAA	2	6	32667	32672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341494
393	NC_022051	TGA	2	6	32683	32688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341494
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395	NC_022051	TGG	2	6	33086	33091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530341495
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397	NC_022051	TAT	2	6	33250	33255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341495
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400	NC_022051	GAA	2	6	33335	33340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341496
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402	NC_022051	TGA	2	6	33469	33474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341496
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409	NC_022051	AAT	2	6	34004	34009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341496
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412	NC_022051	TGA	2	6	34183	34188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341496
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452	NC_022051	TAA	2	6	37533	37538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341500
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455	NC_022051	AAG	2	6	37766	37771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341500
456	NC_022051	CAA	2	6	37966	37971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341500
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459	NC_022051	CAA	2	6	38184	38189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341500
460	NC_022051	TAC	2	6	38332	38337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341500
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469	NC_022051	TAA	2	6	39073	39078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341455
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471	NC_022051	TCT	2	6	39130	39135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341455
472	NC_022051	CTT	2	6	39185	39190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341455
473	NC_022051	TCC	2	6	39216	39221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530341455
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490	NC_022051	TCC	2	6	40559	40564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530341457
491	NC_022051	CTT	2	6	40656	40661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341501
492	NC_022051	ATC	2	6	40678	40683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341501
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495	NC_022051	ATA	2	6	40915	40920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341501
496	NC_022051	TGA	2	6	40956	40961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341501
497	NC_022051	CAA	2	6	40977	40982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341501
498	NC_022051	AAC	2	6	41029	41034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341501
499	NC_022051	AAT	2	6	41041	41046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341501
500	NC_022051	TCC	2	6	41072	41077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530341501

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