MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes strain J1926 plasmid

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022051	AT	3	6	796	801	50 %	50 %	0 %	0 %	530341462
2	NC_022051	CT	3	6	2229	2234	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_022051	TA	3	6	2580	2585	50 %	50 %	0 %	0 %	530341464
4	NC_022051	AT	3	6	2729	2734	50 %	50 %	0 %	0 %	530341464
5	NC_022051	AT	3	6	3663	3668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022051	AG	3	6	3884	3889	50 %	0 %	50 %	0 %	530341465
7	NC_022051	AT	3	6	4273	4278	50 %	50 %	0 %	0 %	530341465
8	NC_022051	TG	3	6	4377	4382	0 %	50 %	50 %	0 %	530341465
9	NC_022051	GA	3	6	5040	5045	50 %	0 %	50 %	0 %	530341466
10	NC_022051	AT	3	6	5276	5281	50 %	50 %	0 %	0 %	530341467
11	NC_022051	AT	3	6	5297	5302	50 %	50 %	0 %	0 %	530341467
12	NC_022051	CT	3	6	5464	5469	0 %	50 %	0 %	50 %	530341467
13	NC_022051	GT	3	6	6191	6196	0 %	50 %	50 %	0 %	530341468
14	NC_022051	AT	3	6	7476	7481	50 %	50 %	0 %	0 %	530341468
15	NC_022051	AG	3	6	7553	7558	50 %	0 %	50 %	0 %	530341468
16	NC_022051	CT	3	6	8564	8569	0 %	50 %	0 %	50 %	530341470
17	NC_022051	CT	3	6	8683	8688	0 %	50 %	0 %	50 %	530341470
18	NC_022051	CA	3	6	9096	9101	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_022051	AT	3	6	9186	9191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022051	AT	4	8	9647	9654	50 %	50 %	0 %	0 %	530341471
21	NC_022051	AG	3	6	10532	10537	50 %	0 %	50 %	0 %	530341471
22	NC_022051	GA	3	6	10982	10987	50 %	0 %	50 %	0 %	530341472
23	NC_022051	TG	3	6	11470	11475	0 %	50 %	50 %	0 %	530341449
24	NC_022051	AT	3	6	12163	12168	50 %	50 %	0 %	0 %	530341473
25	NC_022051	AT	3	6	13099	13104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022051	TC	3	6	13125	13130	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_022051	AC	3	6	13297	13302	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_022051	TA	3	6	14271	14276	50 %	50 %	0 %	0 %	530341474
29	NC_022051	AT	3	6	14735	14740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022051	TA	3	6	14750	14755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022051	TA	3	6	14770	14775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022051	TA	3	6	14882	14887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022051	GA	3	6	15026	15031	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022051	CT	3	6	16212	16217	0 %	50 %	0 %	50 %	530341452
35	NC_022051	GA	3	6	16363	16368	50 %	0 %	50 %	0 %	530341452
36	NC_022051	TA	3	6	16382	16387	50 %	50 %	0 %	0 %	530341475
37	NC_022051	TA	3	6	16749	16754	50 %	50 %	0 %	0 %	530341475
38	NC_022051	TA	3	6	16940	16945	50 %	50 %	0 %	0 %	530341476
39	NC_022051	TC	3	6	17566	17571	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_022051	GA	3	6	17936	17941	50 %	0 %	50 %	0 %	530341477
41	NC_022051	AT	3	6	19862	19867	50 %	50 %	0 %	0 %	530341479
42	NC_022051	AG	3	6	20172	20177	50 %	0 %	50 %	0 %	530341479
43	NC_022051	TA	3	6	20553	20558	50 %	50 %	0 %	0 %	530341479
44	NC_022051	TC	3	6	20577	20582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_022051	AT	3	6	20593	20598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022051	TA	3	6	20702	20707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022051	AT	3	6	20793	20798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022051	AT	3	6	20825	20830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022051	TA	4	8	20864	20871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022051	TA	3	6	20914	20919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022051	AG	3	6	21297	21302	50 %	0 %	50 %	0 %	530341481
52	NC_022051	GA	3	6	21303	21308	50 %	0 %	50 %	0 %	530341481
53	NC_022051	GT	3	6	22433	22438	0 %	50 %	50 %	0 %	530341481
54	NC_022051	AG	3	6	22827	22832	50 %	0 %	50 %	0 %	530341481
55	NC_022051	GA	3	6	24074	24079	50 %	0 %	50 %	0 %	530341454
56	NC_022051	AT	3	6	25326	25331	50 %	50 %	0 %	0 %	530341485
57	NC_022051	AT	3	6	25538	25543	50 %	50 %	0 %	0 %	530341485
58	NC_022051	TG	3	6	25719	25724	0 %	50 %	50 %	0 %	530341485
59	NC_022051	TC	4	8	26180	26187	0 %	50 %	0 %	50 %	530341485
60	NC_022051	AG	4	8	26791	26798	50 %	0 %	50 %	0 %	530341486
61	NC_022051	GA	3	6	27459	27464	50 %	0 %	50 %	0 %	530341487
62	NC_022051	CG	3	6	28636	28641	0 %	0 %	50 %	50 %	530341488
63	NC_022051	CA	3	6	29131	29136	50 %	0 %	0 %	50 %	530341489
64	NC_022051	AT	3	6	29339	29344	50 %	50 %	0 %	0 %	530341490
65	NC_022051	GA	3	6	30232	30237	50 %	0 %	50 %	0 %	530341490
66	NC_022051	AC	3	6	30254	30259	50 %	0 %	0 %	50 %	530341490
67	NC_022051	AG	3	6	30266	30271	50 %	0 %	50 %	0 %	530341490
68	NC_022051	TA	3	6	30286	30291	50 %	50 %	0 %	0 %	530341490
69	NC_022051	GA	3	6	30429	30434	50 %	0 %	50 %	0 %	530341490
70	NC_022051	TG	3	6	32193	32198	0 %	50 %	50 %	0 %	530341493
71	NC_022051	AT	3	6	32952	32957	50 %	50 %	0 %	0 %	530341495
72	NC_022051	AT	3	6	33621	33626	50 %	50 %	0 %	0 %	530341496
73	NC_022051	AT	3	6	34665	34670	50 %	50 %	0 %	0 %	530341496
74	NC_022051	AG	4	8	35064	35071	50 %	0 %	50 %	0 %	530341497
75	NC_022051	CA	3	6	35528	35533	50 %	0 %	0 %	50 %	530341497
76	NC_022051	AT	3	6	35709	35714	50 %	50 %	0 %	0 %	530341497
77	NC_022051	AT	3	6	35921	35926	50 %	50 %	0 %	0 %	530341497
78	NC_022051	AC	3	6	38406	38411	50 %	0 %	0 %	50 %	530341500
79	NC_022051	AG	3	6	39315	39320	50 %	0 %	50 %	0 %	530341455
80	NC_022051	TA	4	8	39870	39877	50 %	50 %	0 %	0 %	530341456
81	NC_022051	TA	3	6	41371	41376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022051	TA	3	6	41947	41952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022051	AT	4	8	42118	42125	50 %	50 %	0 %	0 %	530341503
84	NC_022051	CA	3	6	42450	42455	50 %	0 %	0 %	50 %	530341504
85	NC_022051	AT	3	6	42554	42559	50 %	50 %	0 %	0 %	530341504
86	NC_022051	TC	3	6	42942	42947	0 %	50 %	0 %	50 %	530341504
87	NC_022051	AT	3	6	44055	44060	50 %	50 %	0 %	0 %	530341505
88	NC_022051	GT	3	6	44257	44262	0 %	50 %	50 %	0 %	530341505
89	NC_022051	GT	3	6	45439	45444	0 %	50 %	50 %	0 %	530341509
90	NC_022051	TC	3	6	46349	46354	0 %	50 %	0 %	50 %	530341458
91	NC_022051	AT	3	6	47909	47914	50 %	50 %	0 %	0 %	530341512
92	NC_022051	TA	3	6	47916	47921	50 %	50 %	0 %	0 %	530341512
93	NC_022051	AT	3	6	48022	48027	50 %	50 %	0 %	0 %	530341513
94	NC_022051	TA	3	6	49230	49235	50 %	50 %	0 %	0 %	530341513
95	NC_022051	AT	3	6	49467	49472	50 %	50 %	0 %	0 %	530341513
96	NC_022051	AT	3	6	51184	51189	50 %	50 %	0 %	0 %	530341514
97	NC_022051	AT	3	6	51275	51280	50 %	50 %	0 %	0 %	530341514
98	NC_022051	TA	3	6	52463	52468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022051	AG	3	6	52625	52630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022051	GA	3	6	53630	53635	50 %	0 %	50 %	0 %	530341519
101	NC_022051	TA	3	6	53830	53835	50 %	50 %	0 %	0 %	530341519
102	NC_022051	TA	3	6	54415	54420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.