MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes strain J1926 plasmid

Total Repeats: 211

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022051	T	6	6	384	389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022051	T	6	6	432	437	0 %	100 %	0 %	0 %	530341461
3	NC_022051	T	7	7	949	955	0 %	100 %	0 %	0 %	530341462
4	NC_022051	A	6	6	1309	1314	100 %	0 %	0 %	0 %	530341463
5	NC_022051	T	6	6	1390	1395	0 %	100 %	0 %	0 %	530341463
6	NC_022051	T	6	6	1404	1409	0 %	100 %	0 %	0 %	530341463
7	NC_022051	A	7	7	1732	1738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022051	T	6	6	1741	1746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022051	T	7	7	1979	1985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022051	A	6	6	2082	2087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022051	A	6	6	2165	2170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022051	A	7	7	2363	2369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022051	A	6	6	2378	2383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022051	A	7	7	2453	2459	100 %	0 %	0 %	0 %	530341464
15	NC_022051	A	6	6	2743	2748	100 %	0 %	0 %	0 %	530341464
16	NC_022051	T	7	7	2830	2836	0 %	100 %	0 %	0 %	530341464
17	NC_022051	A	6	6	3340	3345	100 %	0 %	0 %	0 %	530341464
18	NC_022051	T	6	6	3494	3499	0 %	100 %	0 %	0 %	530341464
19	NC_022051	T	7	7	3704	3710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022051	A	8	8	4639	4646	100 %	0 %	0 %	0 %	530341466
21	NC_022051	A	6	6	4701	4706	100 %	0 %	0 %	0 %	530341466
22	NC_022051	T	6	6	5077	5082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022051	A	6	6	5111	5116	100 %	0 %	0 %	0 %	530341467
24	NC_022051	A	8	8	5133	5140	100 %	0 %	0 %	0 %	530341467
25	NC_022051	A	7	7	5653	5659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022051	T	6	6	6710	6715	0 %	100 %	0 %	0 %	530341468
27	NC_022051	T	7	7	6991	6997	0 %	100 %	0 %	0 %	530341468
28	NC_022051	T	6	6	7146	7151	0 %	100 %	0 %	0 %	530341468
29	NC_022051	T	7	7	7757	7763	0 %	100 %	0 %	0 %	530341468
30	NC_022051	T	6	6	7812	7817	0 %	100 %	0 %	0 %	530341468
31	NC_022051	T	7	7	7950	7956	0 %	100 %	0 %	0 %	530341469
32	NC_022051	T	6	6	8978	8983	0 %	100 %	0 %	0 %	530341470
33	NC_022051	A	7	7	9233	9239	100 %	0 %	0 %	0 %	530341471
34	NC_022051	A	7	7	9280	9286	100 %	0 %	0 %	0 %	530341471
35	NC_022051	A	7	7	9310	9316	100 %	0 %	0 %	0 %	530341471
36	NC_022051	A	6	6	9392	9397	100 %	0 %	0 %	0 %	530341471
37	NC_022051	T	6	6	9927	9932	0 %	100 %	0 %	0 %	530341471
38	NC_022051	T	6	6	10052	10057	0 %	100 %	0 %	0 %	530341471
39	NC_022051	T	7	7	11918	11924	0 %	100 %	0 %	0 %	530341449
40	NC_022051	A	6	6	12110	12115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022051	A	7	7	12316	12322	100 %	0 %	0 %	0 %	530341473
42	NC_022051	T	6	6	12407	12412	0 %	100 %	0 %	0 %	530341473
43	NC_022051	T	6	6	12461	12466	0 %	100 %	0 %	0 %	530341473
44	NC_022051	T	6	6	12565	12570	0 %	100 %	0 %	0 %	530341473
45	NC_022051	A	6	6	12683	12688	100 %	0 %	0 %	0 %	530341473
46	NC_022051	A	7	7	13025	13031	100 %	0 %	0 %	0 %	530341473
47	NC_022051	T	6	6	13118	13123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022051	A	6	6	13807	13812	100 %	0 %	0 %	0 %	530341474
49	NC_022051	A	6	6	14249	14254	100 %	0 %	0 %	0 %	530341474
50	NC_022051	A	6	6	14690	14695	100 %	0 %	0 %	0 %	530341474
51	NC_022051	T	7	7	15952	15958	0 %	100 %	0 %	0 %	530341451
52	NC_022051	T	7	7	15994	16000	0 %	100 %	0 %	0 %	530341451
53	NC_022051	T	6	6	16349	16354	0 %	100 %	0 %	0 %	530341452
54	NC_022051	A	6	6	16376	16381	100 %	0 %	0 %	0 %	530341475
55	NC_022051	T	7	7	16825	16831	0 %	100 %	0 %	0 %	530341476
56	NC_022051	T	6	6	16833	16838	0 %	100 %	0 %	0 %	530341476
57	NC_022051	T	7	7	16923	16929	0 %	100 %	0 %	0 %	530341476
58	NC_022051	T	6	6	16968	16973	0 %	100 %	0 %	0 %	530341476
59	NC_022051	T	7	7	17108	17114	0 %	100 %	0 %	0 %	530341476
60	NC_022051	A	6	6	17162	17167	100 %	0 %	0 %	0 %	530341476
61	NC_022051	T	6	6	17382	17387	0 %	100 %	0 %	0 %	530341476
62	NC_022051	T	9	9	17458	17466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022051	A	6	6	17488	17493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022051	A	6	6	17507	17512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022051	T	6	6	17572	17577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022051	T	6	6	18063	18068	0 %	100 %	0 %	0 %	530341453
67	NC_022051	T	6	6	18113	18118	0 %	100 %	0 %	0 %	530341453
68	NC_022051	A	6	6	18180	18185	100 %	0 %	0 %	0 %	530341453
69	NC_022051	A	6	6	18413	18418	100 %	0 %	0 %	0 %	530341453
70	NC_022051	A	7	7	18967	18973	100 %	0 %	0 %	0 %	530341453
71	NC_022051	T	8	8	19523	19530	0 %	100 %	0 %	0 %	530341478
72	NC_022051	A	6	6	19676	19681	100 %	0 %	0 %	0 %	530341479
73	NC_022051	T	6	6	19904	19909	0 %	100 %	0 %	0 %	530341479
74	NC_022051	T	7	7	19922	19928	0 %	100 %	0 %	0 %	530341479
75	NC_022051	A	6	6	20218	20223	100 %	0 %	0 %	0 %	530341479
76	NC_022051	T	6	6	20412	20417	0 %	100 %	0 %	0 %	530341479
77	NC_022051	T	6	6	20538	20543	0 %	100 %	0 %	0 %	530341479
78	NC_022051	A	6	6	20679	20684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022051	A	7	7	20803	20809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022051	A	11	11	20956	20966	100 %	0 %	0 %	0 %	530341480
81	NC_022051	A	6	6	20997	21002	100 %	0 %	0 %	0 %	530341480
82	NC_022051	A	7	7	21100	21106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022051	T	6	6	21266	21271	0 %	100 %	0 %	0 %	530341481
84	NC_022051	A	6	6	22450	22455	100 %	0 %	0 %	0 %	530341481
85	NC_022051	A	6	6	22606	22611	100 %	0 %	0 %	0 %	530341481
86	NC_022051	A	8	8	22730	22737	100 %	0 %	0 %	0 %	530341481
87	NC_022051	A	8	8	23230	23237	100 %	0 %	0 %	0 %	530341483
88	NC_022051	A	6	6	23243	23248	100 %	0 %	0 %	0 %	530341483
89	NC_022051	A	6	6	23653	23658	100 %	0 %	0 %	0 %	530341483
90	NC_022051	T	7	7	24114	24120	0 %	100 %	0 %	0 %	530341454
91	NC_022051	T	7	7	24628	24634	0 %	100 %	0 %	0 %	530341484
92	NC_022051	T	6	6	24848	24853	0 %	100 %	0 %	0 %	530341484
93	NC_022051	T	7	7	24926	24932	0 %	100 %	0 %	0 %	530341484
94	NC_022051	T	6	6	24940	24945	0 %	100 %	0 %	0 %	530341484
95	NC_022051	T	6	6	26075	26080	0 %	100 %	0 %	0 %	530341485
96	NC_022051	T	6	6	26753	26758	0 %	100 %	0 %	0 %	530341486
97	NC_022051	A	7	7	26805	26811	100 %	0 %	0 %	0 %	530341486
98	NC_022051	A	9	9	26893	26901	100 %	0 %	0 %	0 %	530341486
99	NC_022051	T	7	7	26908	26914	0 %	100 %	0 %	0 %	530341486
100	NC_022051	T	6	6	26922	26927	0 %	100 %	0 %	0 %	530341486
101	NC_022051	T	6	6	27120	27125	0 %	100 %	0 %	0 %	530341486
102	NC_022051	T	6	6	27176	27181	0 %	100 %	0 %	0 %	530341486
103	NC_022051	A	6	6	27297	27302	100 %	0 %	0 %	0 %	530341487
104	NC_022051	A	7	7	27326	27332	100 %	0 %	0 %	0 %	530341487
105	NC_022051	A	6	6	27714	27719	100 %	0 %	0 %	0 %	530341487
106	NC_022051	A	6	6	27804	27809	100 %	0 %	0 %	0 %	530341487
107	NC_022051	A	6	6	27842	27847	100 %	0 %	0 %	0 %	530341487
108	NC_022051	A	6	6	27884	27889	100 %	0 %	0 %	0 %	530341487
109	NC_022051	A	7	7	27966	27972	100 %	0 %	0 %	0 %	530341487
110	NC_022051	T	6	6	28458	28463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022051	A	7	7	28624	28630	100 %	0 %	0 %	0 %	530341488
112	NC_022051	A	6	6	28726	28731	100 %	0 %	0 %	0 %	530341488
113	NC_022051	A	6	6	29028	29033	100 %	0 %	0 %	0 %	530341489
114	NC_022051	A	6	6	29204	29209	100 %	0 %	0 %	0 %	530341489
115	NC_022051	A	6	6	29439	29444	100 %	0 %	0 %	0 %	530341490
116	NC_022051	A	6	6	29470	29475	100 %	0 %	0 %	0 %	530341490
117	NC_022051	A	6	6	29526	29531	100 %	0 %	0 %	0 %	530341490
118	NC_022051	A	6	6	29656	29661	100 %	0 %	0 %	0 %	530341490
119	NC_022051	A	6	6	29823	29828	100 %	0 %	0 %	0 %	530341490
120	NC_022051	T	6	6	29944	29949	0 %	100 %	0 %	0 %	530341490
121	NC_022051	T	6	6	30042	30047	0 %	100 %	0 %	0 %	530341490
122	NC_022051	A	6	6	30116	30121	100 %	0 %	0 %	0 %	530341490
123	NC_022051	A	7	7	30323	30329	100 %	0 %	0 %	0 %	530341490
124	NC_022051	A	6	6	30596	30601	100 %	0 %	0 %	0 %	530341491
125	NC_022051	A	6	6	31708	31713	100 %	0 %	0 %	0 %	530341492
126	NC_022051	T	7	7	31763	31769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022051	T	8	8	31813	31820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022051	G	6	6	32006	32011	0 %	0 %	100 %	0 %	530341493
129	NC_022051	A	6	6	32141	32146	100 %	0 %	0 %	0 %	530341493
130	NC_022051	A	6	6	32252	32257	100 %	0 %	0 %	0 %	530341493
131	NC_022051	A	6	6	32354	32359	100 %	0 %	0 %	0 %	530341493
132	NC_022051	G	6	6	32405	32410	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022051	T	6	6	32414	32419	0 %	100 %	0 %	0 %	530341494
134	NC_022051	T	7	7	32706	32712	0 %	100 %	0 %	0 %	530341494
135	NC_022051	A	6	6	32828	32833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022051	T	7	7	33190	33196	0 %	100 %	0 %	0 %	530341495
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145	NC_022051	A	6	6	36399	36404	100 %	0 %	0 %	0 %	530341498
146	NC_022051	A	7	7	36618	36624	100 %	0 %	0 %	0 %	530341498
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.