MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1926 plasmid

Total Repeats: 173

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022051	T	6	6	432	437	0 %	100 %	0 %	0 %	530341461
2	NC_022051	T	7	7	949	955	0 %	100 %	0 %	0 %	530341462
3	NC_022051	A	6	6	1309	1314	100 %	0 %	0 %	0 %	530341463
4	NC_022051	T	6	6	1390	1395	0 %	100 %	0 %	0 %	530341463
5	NC_022051	T	6	6	1404	1409	0 %	100 %	0 %	0 %	530341463
6	NC_022051	A	7	7	2453	2459	100 %	0 %	0 %	0 %	530341464
7	NC_022051	A	6	6	2743	2748	100 %	0 %	0 %	0 %	530341464
8	NC_022051	T	7	7	2830	2836	0 %	100 %	0 %	0 %	530341464
9	NC_022051	A	6	6	3340	3345	100 %	0 %	0 %	0 %	530341464
10	NC_022051	T	6	6	3494	3499	0 %	100 %	0 %	0 %	530341464
11	NC_022051	A	8	8	4639	4646	100 %	0 %	0 %	0 %	530341466
12	NC_022051	A	6	6	4701	4706	100 %	0 %	0 %	0 %	530341466
13	NC_022051	A	6	6	5111	5116	100 %	0 %	0 %	0 %	530341467
14	NC_022051	A	8	8	5133	5140	100 %	0 %	0 %	0 %	530341467
15	NC_022051	T	6	6	6710	6715	0 %	100 %	0 %	0 %	530341468
16	NC_022051	T	7	7	6991	6997	0 %	100 %	0 %	0 %	530341468
17	NC_022051	T	6	6	7146	7151	0 %	100 %	0 %	0 %	530341468
18	NC_022051	T	7	7	7757	7763	0 %	100 %	0 %	0 %	530341468
19	NC_022051	T	6	6	7812	7817	0 %	100 %	0 %	0 %	530341468
20	NC_022051	T	7	7	7950	7956	0 %	100 %	0 %	0 %	530341469
21	NC_022051	T	6	6	8978	8983	0 %	100 %	0 %	0 %	530341470
22	NC_022051	A	7	7	9233	9239	100 %	0 %	0 %	0 %	530341471
23	NC_022051	A	7	7	9280	9286	100 %	0 %	0 %	0 %	530341471
24	NC_022051	A	7	7	9310	9316	100 %	0 %	0 %	0 %	530341471
25	NC_022051	A	6	6	9392	9397	100 %	0 %	0 %	0 %	530341471
26	NC_022051	T	6	6	9927	9932	0 %	100 %	0 %	0 %	530341471
27	NC_022051	T	6	6	10052	10057	0 %	100 %	0 %	0 %	530341471
28	NC_022051	T	7	7	11918	11924	0 %	100 %	0 %	0 %	530341449
29	NC_022051	A	7	7	12316	12322	100 %	0 %	0 %	0 %	530341473
30	NC_022051	T	6	6	12407	12412	0 %	100 %	0 %	0 %	530341473
31	NC_022051	T	6	6	12461	12466	0 %	100 %	0 %	0 %	530341473
32	NC_022051	T	6	6	12565	12570	0 %	100 %	0 %	0 %	530341473
33	NC_022051	A	6	6	12683	12688	100 %	0 %	0 %	0 %	530341473
34	NC_022051	A	7	7	13025	13031	100 %	0 %	0 %	0 %	530341473
35	NC_022051	A	6	6	13807	13812	100 %	0 %	0 %	0 %	530341474
36	NC_022051	A	6	6	14249	14254	100 %	0 %	0 %	0 %	530341474
37	NC_022051	A	6	6	14690	14695	100 %	0 %	0 %	0 %	530341474
38	NC_022051	T	7	7	15952	15958	0 %	100 %	0 %	0 %	530341451
39	NC_022051	T	7	7	15994	16000	0 %	100 %	0 %	0 %	530341451
40	NC_022051	T	6	6	16349	16354	0 %	100 %	0 %	0 %	530341452
41	NC_022051	A	6	6	16376	16381	100 %	0 %	0 %	0 %	530341475
42	NC_022051	T	7	7	16825	16831	0 %	100 %	0 %	0 %	530341476
43	NC_022051	T	6	6	16833	16838	0 %	100 %	0 %	0 %	530341476
44	NC_022051	T	7	7	16923	16929	0 %	100 %	0 %	0 %	530341476
45	NC_022051	T	6	6	16968	16973	0 %	100 %	0 %	0 %	530341476
46	NC_022051	T	7	7	17108	17114	0 %	100 %	0 %	0 %	530341476
47	NC_022051	A	6	6	17162	17167	100 %	0 %	0 %	0 %	530341476
48	NC_022051	T	6	6	17382	17387	0 %	100 %	0 %	0 %	530341476
49	NC_022051	T	6	6	18063	18068	0 %	100 %	0 %	0 %	530341453
50	NC_022051	T	6	6	18113	18118	0 %	100 %	0 %	0 %	530341453
51	NC_022051	A	6	6	18180	18185	100 %	0 %	0 %	0 %	530341453
52	NC_022051	A	6	6	18413	18418	100 %	0 %	0 %	0 %	530341453
53	NC_022051	A	7	7	18967	18973	100 %	0 %	0 %	0 %	530341453
54	NC_022051	T	8	8	19523	19530	0 %	100 %	0 %	0 %	530341478
55	NC_022051	A	6	6	19676	19681	100 %	0 %	0 %	0 %	530341479
56	NC_022051	T	6	6	19904	19909	0 %	100 %	0 %	0 %	530341479
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60	NC_022051	T	6	6	20538	20543	0 %	100 %	0 %	0 %	530341479
61	NC_022051	A	11	11	20956	20966	100 %	0 %	0 %	0 %	530341480
62	NC_022051	A	6	6	20997	21002	100 %	0 %	0 %	0 %	530341480
63	NC_022051	T	6	6	21266	21271	0 %	100 %	0 %	0 %	530341481
64	NC_022051	A	6	6	22450	22455	100 %	0 %	0 %	0 %	530341481
65	NC_022051	A	6	6	22606	22611	100 %	0 %	0 %	0 %	530341481
66	NC_022051	A	8	8	22730	22737	100 %	0 %	0 %	0 %	530341481
67	NC_022051	A	8	8	23230	23237	100 %	0 %	0 %	0 %	530341483
68	NC_022051	A	6	6	23243	23248	100 %	0 %	0 %	0 %	530341483
69	NC_022051	A	6	6	23653	23658	100 %	0 %	0 %	0 %	530341483
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72	NC_022051	T	6	6	24848	24853	0 %	100 %	0 %	0 %	530341484
73	NC_022051	T	7	7	24926	24932	0 %	100 %	0 %	0 %	530341484
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81	NC_022051	T	6	6	27120	27125	0 %	100 %	0 %	0 %	530341486
82	NC_022051	T	6	6	27176	27181	0 %	100 %	0 %	0 %	530341486
83	NC_022051	A	6	6	27297	27302	100 %	0 %	0 %	0 %	530341487
84	NC_022051	A	7	7	27326	27332	100 %	0 %	0 %	0 %	530341487
85	NC_022051	A	6	6	27714	27719	100 %	0 %	0 %	0 %	530341487
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87	NC_022051	A	6	6	27842	27847	100 %	0 %	0 %	0 %	530341487
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89	NC_022051	A	7	7	27966	27972	100 %	0 %	0 %	0 %	530341487
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91	NC_022051	A	6	6	28726	28731	100 %	0 %	0 %	0 %	530341488
92	NC_022051	A	6	6	29028	29033	100 %	0 %	0 %	0 %	530341489
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96	NC_022051	A	6	6	29526	29531	100 %	0 %	0 %	0 %	530341490
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107	NC_022051	A	6	6	32252	32257	100 %	0 %	0 %	0 %	530341493
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110	NC_022051	T	7	7	32706	32712	0 %	100 %	0 %	0 %	530341494
111	NC_022051	T	7	7	33190	33196	0 %	100 %	0 %	0 %	530341495
112	NC_022051	A	6	6	33346	33351	100 %	0 %	0 %	0 %	530341496
113	NC_022051	A	7	7	33353	33359	100 %	0 %	0 %	0 %	530341496
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119	NC_022051	A	7	7	36320	36326	100 %	0 %	0 %	0 %	530341498
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121	NC_022051	A	7	7	36618	36624	100 %	0 %	0 %	0 %	530341498
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124	NC_022051	A	6	6	38101	38106	100 %	0 %	0 %	0 %	530341500
125	NC_022051	A	6	6	38147	38152	100 %	0 %	0 %	0 %	530341500
126	NC_022051	T	6	6	38218	38223	0 %	100 %	0 %	0 %	530341500
127	NC_022051	T	6	6	38439	38444	0 %	100 %	0 %	0 %	530341500
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136	NC_022051	A	7	7	41669	41675	100 %	0 %	0 %	0 %	530341502
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139	NC_022051	A	6	6	44045	44050	100 %	0 %	0 %	0 %	530341505
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.