MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi CA382

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022048	AAAACC	2	12	3255	3266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_022048	AATTAA	2	12	45365	45376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022048	ATTTCC	2	12	75506	75517	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_022048	AATACT	2	12	85832	85843	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_022048	AAATTT	2	12	148679	148690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022048	ATAGCA	2	12	148758	148769	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_022048	TAAAAA	2	12	156757	156768	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022048	AATACT	2	12	156890	156901	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_022048	AATTAA	2	12	157235	157246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022048	ATTATA	2	12	157595	157606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022048	TAAAAA	2	12	158491	158502	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022048	TTTTAA	2	12	250133	250144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022048	TTTAAA	2	12	291033	291044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022048	TTAAAA	2	12	334840	334851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022048	TAATTT	2	12	338337	338348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022048	ATTAAA	2	12	374191	374202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022048	AAATTT	2	12	390365	390376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022048	TTCAAA	2	12	416624	416635	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_022048	AATTAA	2	12	418363	418374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022048	ATTTTT	2	12	422242	422253	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022048	AAAAAC	2	12	435199	435210	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_022048	ATTAGT	2	12	435363	435374	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022048	TCGCTT	2	12	437559	437570	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_022048	ATAAAA	2	12	438416	438427	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022048	TAAAAA	2	12	438443	438454	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022048	ATTAGT	2	12	438608	438619	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022048	TCGCTT	2	12	440804	440815	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_022048	AATAAA	2	12	443336	443347	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022048	TTCGCC	2	12	445395	445406	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_022048	ATTTTT	2	12	492226	492237	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022048	ATTTAA	2	12	516292	516303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022048	TGTTTT	2	12	527327	527338	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022048	ATTTGA	2	12	532718	532729	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022048	AATAAG	2	12	547826	547837	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022048	ATTTTT	2	12	553864	553875	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022048	CTTTTC	2	12	573754	573765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_022048	TAATTA	2	12	590247	590258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022048	TTATTT	2	12	611214	611225	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022048	TTTATA	2	12	615897	615908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022048	TTAGTT	2	12	628992	629003	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022048	ATTTAT	2	12	648369	648380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022048	AATTTT	2	12	668528	668539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022048	TATTTT	2	12	669111	669122	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022048	TTTTTC	2	12	670039	670050	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_022048	TTTTTG	2	12	671025	671036	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022048	TCAAAA	2	12	671105	671116	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_022048	AATTTC	2	12	671185	671196	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_022048	CCCCAA	2	12	674878	674889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_022048	TTGTTT	2	12	682570	682581	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022048	AATTTA	2	12	699986	699997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022048	GAATTT	2	12	712368	712379	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022048	TATTAG	2	12	712834	712845	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022048	AATTTT	2	12	757801	757812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022048	TTTAAG	2	12	775524	775535	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022048	AAATTT	2	12	777705	777716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022048	TTAATT	2	12	793712	793723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022048	TTTAAA	2	12	802831	802842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022048	TTTTTA	2	12	820561	820572	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022048	AATTAA	2	12	822715	822726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022048	TAATGT	2	12	829162	829173	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022048	ATTTTA	2	12	848367	848378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022048	TTCTAT	2	12	904965	904976	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_022048	ATTTTT	2	12	905082	905093	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022048	TAATTT	2	12	905573	905584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022048	CATTTT	2	12	905682	905693	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_022048	TTATAA	2	12	907015	907026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022048	ATTTAT	2	12	910262	910273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.