MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi CA382

Total Repeats: 589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022048	ATAAAG	2	12	3528	3539	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	530320929
2	NC_022048	AAGAAA	2	12	7151	7162	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	530320931
3	NC_022048	CAATAG	2	12	8653	8664	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	530320933
4	NC_022048	CAATAA	2	12	9076	9087	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	530320933
5	NC_022048	TCTATT	2	12	9108	9119	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	530320933
6	NC_022048	AATAAA	2	12	9516	9527	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	530320934
7	NC_022048	TAAAGA	2	12	9942	9953	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	530320934
8	NC_022048	TAAAAA	2	12	9986	9997	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	530320934
9	NC_022048	TAAGCA	2	12	11827	11838	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	530320937
10	NC_022048	AAAACA	2	12	13952	13963	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	530320939
11	NC_022048	GAAAAA	2	12	15847	15858	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	530320942
12	NC_022048	TACTAA	2	12	15903	15914	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	530320942
13	NC_022048	CTTGGG	2	12	16292	16303	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	530320942
14	NC_022048	TTAAAA	2	12	16801	16812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530320942
15	NC_022048	AAATTA	2	12	22621	22632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530320949
16	NC_022048	TTCAAA	2	12	22659	22670	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	530320949
17	NC_022048	CAAATA	2	12	27132	27143	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	530320954
18	NC_022048	TCAAAC	2	12	28724	28735	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	530320957
19	NC_022048	ATTTAA	2	12	32159	32170	50 %	50 %	0 %	0 %	530320961
20	NC_022048	TCAATT	2	12	32236	32247	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	530320961
21	NC_022048	TATCAA	2	12	32819	32830	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	530320961
22	NC_022048	AGAAGC	2	12	33729	33740	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	530320961
23	NC_022048	TAAATT	2	12	37839	37850	50 %	50 %	0 %	0 %	530320964
24	NC_022048	ATTTTT	2	12	38688	38699	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	530320965
25	NC_022048	TAAATT	2	12	38952	38963	50 %	50 %	0 %	0 %	530320965
26	NC_022048	GAAAGA	2	12	39010	39021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530320965
27	NC_022048	AATATA	2	12	39856	39867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530320966
28	NC_022048	AAAATC	2	12	41079	41090	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	530320967
29	NC_022048	TAAATT	2	12	43774	43785	50 %	50 %	0 %	0 %	530320970
30	NC_022048	AAATAA	2	12	48377	48388	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	530320975
31	NC_022048	TAAAAA	2	12	49648	49659	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	530320977
32	NC_022048	TAAAAA	2	12	50447	50458	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	530320978
33	NC_022048	TCAAAT	2	12	51458	51469	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	530320980
34	NC_022048	TTTAAA	2	12	54465	54476	50 %	50 %	0 %	0 %	530320982
35	NC_022048	TTAAAA	2	12	57343	57354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530320986
36	NC_022048	AAATTT	2	12	57364	57375	50 %	50 %	0 %	0 %	530320986
37	NC_022048	AAAAAT	2	12	57684	57695	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	530320986
38	NC_022048	AGAAAA	2	12	57846	57857	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	530320986
39	NC_022048	TGAAAA	2	12	65866	65877	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	530320995
40	NC_022048	ATTCAA	2	12	67790	67801	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	530320996
41	NC_022048	AAAAAT	2	12	67877	67888	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	530320996
42	NC_022048	ACTATC	2	12	68534	68545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530320996
43	NC_022048	ATTCAA	2	12	68884	68895	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	530320996
44	NC_022048	ATAAAA	2	12	69638	69649	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	530320997
45	NC_022048	ACCAAA	2	12	71531	71542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530320999
46	NC_022048	AATTGA	2	12	72187	72198	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	530320999
47	NC_022048	TAGAAA	2	12	72285	72296	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	530320999
48	NC_022048	AATAGA	2	12	73321	73332	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	530321000
49	NC_022048	GAAAAC	2	12	73846	73857	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	530321001
50	NC_022048	CAATGA	2	12	74409	74420	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	530321001
51	NC_022048	TTGCTA	2	12	76234	76245	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	530321002
52	NC_022048	ATTCCA	2	12	77118	77129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530321003
53	NC_022048	TGGAAT	2	12	77428	77439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530321003
54	NC_022048	AAAAGA	2	12	77677	77688	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	530321003
55	NC_022048	TCAATG	2	12	78078	78089	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	530321004
56	NC_022048	CCATTC	2	12	78489	78500	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	530321004
57	NC_022048	TAAATC	2	12	78620	78631	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	530321004
58	NC_022048	AGGAAT	2	12	80224	80235	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	530321006
59	NC_022048	TTTTAT	2	12	80696	80707	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	530321006
60	NC_022048	TACAAA	2	12	81312	81323	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	530321007
61	NC_022048	ATTTTC	2	12	81565	81576	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	530321008
62	NC_022048	AGATAA	2	12	87979	87990	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	530321013
63	NC_022048	CAATTT	2	12	88687	88698	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	530321013
64	NC_022048	CAGAAA	2	12	90668	90679	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	530321015
65	NC_022048	ACATCA	2	12	92089	92100	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	530321016
66	NC_022048	TCTTTT	2	12	95362	95373	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	530321020
67	NC_022048	GAAATA	2	12	96292	96303	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	530321020
68	NC_022048	CAAAAT	2	12	97961	97972	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	530321022
69	NC_022048	AACATA	2	12	98541	98552	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	530321022
70	NC_022048	TTAAAC	2	12	100032	100043	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	530321023
71	NC_022048	TGGACT	2	12	100106	100117	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	530321023
72	NC_022048	AAATTC	2	12	103771	103782	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	530321027
73	NC_022048	GAAATA	2	12	105354	105365	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	530321028
74	NC_022048	AAAATC	2	12	111723	111734	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	530321035
75	NC_022048	CAATAT	2	12	111924	111935	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	530321036
76	NC_022048	AAATAG	2	12	114525	114536	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	530321038
77	NC_022048	TAAAAA	2	12	116452	116463	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	530321040
78	NC_022048	CATTAA	2	12	117200	117211	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	530321041
79	NC_022048	AATTTT	2	12	117495	117506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530321041
80	NC_022048	AAGATC	2	12	117843	117854	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	530321042
81	NC_022048	AAATCA	2	12	117910	117921	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	530321042
82	NC_022048	AATTTC	2	12	119849	119860	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	530321045
83	NC_022048	ACACAA	2	12	122437	122448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530321048
84	NC_022048	TTTCTC	2	12	122882	122893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530321049
85	NC_022048	AATTCT	2	12	124909	124920	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	530321051
86	NC_022048	CATCAA	2	12	125283	125294	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	530321051
87	NC_022048	ATCCGA	2	12	128213	128224	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	530321054
88	NC_022048	TGATAT	2	12	132308	132319	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	530321056
89	NC_022048	ATTTTT	2	12	132670	132681	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	530321057
90	NC_022048	ATCAAA	2	12	133465	133476	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	530321057
91	NC_022048	TTAAAA	2	12	135377	135388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530321058
92	NC_022048	ACAAAA	2	12	135680	135691	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	530321058
93	NC_022048	AAAATA	2	12	135766	135777	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	530321058
94	NC_022048	AAACTA	2	12	137138	137149	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	530321059
95	NC_022048	ATTTCA	2	12	137957	137968	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	530321060
96	NC_022048	ATTTTA	2	12	139910	139921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530321062
97	NC_022048	TAGAAT	2	12	141060	141071	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	530321062
98	NC_022048	AACTAA	2	12	142864	142875	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	530321063
99	NC_022048	AAAAGA	2	12	144159	144170	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	530321064
100	NC_022048	AAAAAT	2	12	145436	145447	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	530321066
101	NC_022048	AAATCA	2	12	146621	146632	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	530321068
102	NC_022048	TTTCAT	2	12	147312	147323	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	530321068
103	NC_022048	CATTGC	2	12	147700	147711	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	530321069
104	NC_022048	TCAACT	2	12	149753	149764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530321070
105	NC_022048	CAAGAA	2	12	152672	152683	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	530321072
106	NC_022048	TTGGAA	2	12	152771	152782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530321072
107	NC_022048	AATTCA	2	12	153572	153583	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	530321073
108	NC_022048	TTTGCT	2	12	154164	154175	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	530321074
109	NC_022048	TTAAAT	2	12	155085	155096	50 %	50 %	0 %	0 %	530321074
110	NC_022048	AACTAC	2	12	155156	155167	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	530321074
111	NC_022048	CGAAAA	2	12	159454	159465	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	530321078
112	NC_022048	CTAGAA	2	12	160570	160581	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	530321079
113	NC_022048	ATTTTT	2	12	160985	160996	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	530321079
114	NC_022048	TCATAT	2	12	161453	161464	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	530321080
115	NC_022048	ATCTTT	2	12	161974	161985	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	530321080
116	NC_022048	AAATAT	2	12	165044	165055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530321083
117	NC_022048	ATAAAA	2	12	165449	165460	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	530321083
118	NC_022048	AATCAA	2	12	168247	168258	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	530321085
119	NC_022048	CTTTTT	2	12	169356	169367	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	530321085
120	NC_022048	AAAGAC	2	12	170595	170606	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	530321086
121	NC_022048	TTTTAT	2	12	172362	172373	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	530321089
122	NC_022048	AACTTC	2	12	173194	173205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530321089
123	NC_022048	ATTGGA	2	12	173344	173355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530321089
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238	NC_022048	AATTTA	2	12	331859	331870	50 %	50 %	0 %	0 %	530321242
239	NC_022048	AAACTA	2	12	332564	332575	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	530321242
240	NC_022048	GCAATT	2	12	332821	332832	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	530321242
241	NC_022048	TAACAT	2	12	335424	335435	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	530321244
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351	NC_022048	TTATGT	2	12	528781	528792	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	530321423
352	NC_022048	AACTTT	2	12	531156	531167	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	530321425
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464	NC_022048	ATTGCA	2	12	742273	742284	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	530321604
465	NC_022048	CAAAAT	2	12	742502	742513	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	530321604
466	NC_022048	TTTAAA	2	12	743970	743981	50 %	50 %	0 %	0 %	530321605
467	NC_022048	ATCTTG	2	12	744679	744690	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	530321606
468	NC_022048	TTAATT	2	12	744780	744791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530321606
469	NC_022048	AAGAGG	2	12	748358	748369	50 %	0 %	50 %	0 %	530321608
470	NC_022048	ATTTTC	2	12	751242	751253	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	530321610
471	NC_022048	TTATTT	2	12	754148	754159	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	530321613
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