MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi CA382

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022048	TATAA	2	10	65	74	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022048	AATTT	2	10	8328	8337	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022048	TAAAT	2	10	20017	20026	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022048	AATTA	2	10	22742	22751	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022048	AATAA	2	10	46680	46689	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022048	AAATT	2	10	49265	49274	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022048	AATTA	2	10	56808	56817	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022048	TAAAA	2	10	75052	75061	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022048	AAAAT	2	10	75132	75141	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022048	AAAAT	2	10	80967	80976	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022048	ATTAA	2	10	83930	83939	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022048	ATAAA	2	10	94103	94112	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022048	AAAGT	2	10	98672	98681	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022048	ATAAA	2	10	101433	101442	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022048	TACAA	2	10	108207	108216	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_022048	TAAAA	2	10	131238	131247	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022048	TTATA	2	10	131250	131259	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022048	GAAAA	2	10	138249	138258	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022048	AAATA	2	10	138276	138285	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022048	TATAA	2	10	144284	144293	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022048	TAAAA	2	10	150903	150912	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022048	TAAAA	2	10	150946	150955	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022048	TAAAG	2	10	153067	153076	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022048	GACTT	2	10	158528	158537	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_022048	ATCAG	2	10	169465	169474	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_022048	TTTAA	2	10	189289	189298	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022048	TAAAA	2	10	193698	193707	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022048	GTCAA	2	10	202773	202782	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_022048	AAATT	2	10	208665	208674	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022048	TAAAA	2	10	244740	244749	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022048	AGAAA	2	10	245518	245527	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022048	TAAAA	2	10	245650	245659	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022048	AAAAT	2	10	245685	245694	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022048	AGAAA	2	10	248488	248497	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022048	TAAAA	2	10	253080	253089	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022048	AACAA	2	10	263742	263751	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_022048	CTTTG	2	10	273661	273670	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_022048	TATAA	3	15	273728	273742	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022048	TTTTA	2	10	273771	273780	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022048	AAACA	2	10	318141	318150	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_022048	AGATT	2	10	318197	318206	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022048	TAATT	2	10	327885	327894	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022048	AAAGC	2	10	340035	340044	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_022048	ATAAA	2	10	355440	355449	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022048	AAAGT	2	10	356933	356942	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022048	TAAAA	2	10	361179	361188	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022048	ATAAA	2	10	365697	365706	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022048	TAAAA	2	10	395272	395281	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022048	TTTCA	2	10	405644	405653	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_022048	AATTT	2	10	408551	408560	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022048	TTAAT	2	10	410721	410730	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022048	CTCCC	2	10	437704	437713	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
53	NC_022048	CTCCC	2	10	440949	440958	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
54	NC_022048	AAAAG	2	10	444533	444542	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022048	TCGCT	2	10	444873	444882	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_022048	TTATT	2	10	446122	446131	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022048	AAAAC	2	10	449397	449406	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_022048	ATTCA	2	10	463982	463991	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_022048	TTTTA	2	10	476228	476237	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022048	TATTT	2	10	481206	481215	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022048	TTATT	2	10	492067	492076	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022048	ATAAA	2	10	494594	494603	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022048	TTCTT	2	10	533645	533654	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_022048	ATTTA	2	10	534228	534237	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022048	TTTTA	2	10	539295	539304	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022048	ATTTT	2	10	553807	553816	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022048	TAATT	2	10	565935	565944	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022048	TATTT	2	10	575856	575865	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022048	ATTTA	2	10	577217	577226	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022048	TAAAT	2	10	577295	577304	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022048	TTTTA	2	10	587953	587962	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022048	ATTTA	2	10	590945	590954	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022048	TAAAT	5	25	590965	590989	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022048	ATTTG	2	10	591107	591116	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022048	GGATA	2	10	607032	607041	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022048	CAATT	2	10	607080	607089	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_022048	GTTTT	2	10	618786	618795	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022048	ATTGT	2	10	630726	630735	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022048	TATAT	2	10	634518	634527	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022048	TAAAT	2	10	634537	634546	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022048	ATTTA	2	10	634563	634572	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022048	ATTTT	2	10	636235	636244	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022048	TTTAT	2	10	645647	645656	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022048	TTAAA	2	10	662976	662985	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022048	TGCTT	2	10	668676	668685	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_022048	AATTT	2	10	669149	669158	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022048	ATTTT	2	10	669566	669575	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022048	ATTTG	2	10	670841	670850	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022048	ATAAA	2	10	671481	671490	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022048	TTGAT	2	10	674941	674950	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022048	TTAAA	2	10	686536	686545	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022048	TAATT	2	10	702986	702995	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022048	TAAAT	2	10	705510	705519	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022048	AGTTT	2	10	712290	712299	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022048	AGAAT	2	10	712514	712523	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022048	TTCTT	2	10	712847	712856	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_022048	TTTTA	2	10	714807	714816	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022048	TAGAA	2	10	714961	714970	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022048	TATAA	2	10	724192	724201	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022048	GATAT	2	10	734038	734047	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022048	ATTAT	2	10	742643	742652	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022048	ATTTT	2	10	744906	744915	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022048	TATTT	2	10	746941	746950	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022048	TTAAT	2	10	766727	766736	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022048	ATTTT	2	10	782842	782851	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022048	ATTAA	2	10	783339	783348	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022048	TTTTG	2	10	789294	789303	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022048	CTTAA	2	10	799127	799136	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_022048	ATTAT	2	10	799139	799148	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022048	ATTTT	2	10	809618	809627	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022048	AATTT	2	10	813326	813335	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022048	ATAAA	2	10	815479	815488	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022048	CTTTT	2	10	818570	818579	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_022048	GTTTA	2	10	842501	842510	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022048	AGTTT	2	10	870111	870120	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022048	TTTTA	2	10	888199	888208	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022048	TATAT	2	10	899412	899421	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022048	AAATT	2	10	901808	901817	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022048	TTTCT	2	10	903280	903289	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_022048	TATTG	2	10	903582	903591	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022048	TTTTA	2	10	906009	906018	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022048	TAAAT	2	10	906052	906061	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022048	ACTTA	2	10	907214	907223	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_022048	GAATT	2	10	907408	907417	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022048	AATTT	2	10	907586	907595	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022048	GGATA	2	10	907643	907652	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022048	TAAGG	2	10	908255	908264	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022048	AATAA	2	10	909696	909705	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.