MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes strain J1817 plasmid

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022047	AGATG	2	10	1354	1363	40 %	20 %	40 %	0 %	530314124
2	NC_022047	AAATC	2	10	1483	1492	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_022047	GTTTT	2	10	2909	2918	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022047	CATAC	2	10	4324	4333	40 %	20 %	0 %	40 %	530314111
5	NC_022047	CAAGA	2	10	5628	5637	60 %	0 %	20 %	20 %	530314129
6	NC_022047	TCAAT	2	10	8494	8503	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_022047	TTTCT	2	10	9046	9055	0 %	80 %	0 %	20 %	530314132
8	NC_022047	TACTT	2	10	9980	9989	20 %	60 %	0 %	20 %	530314134
9	NC_022047	TTATT	2	10	10255	10264	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022047	CTTTG	2	10	16703	16712	0 %	60 %	20 %	20 %	530314112
11	NC_022047	TATAC	2	10	17387	17396	40 %	40 %	0 %	20 %	530314140
12	NC_022047	TGTTA	2	10	17536	17545	20 %	60 %	20 %	0 %	530314140
13	NC_022047	TAGTA	2	10	18116	18125	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022047	TGAAA	2	10	21100	21109	60 %	20 %	20 %	0 %	530314115
15	NC_022047	TTGGA	2	10	21900	21909	20 %	40 %	40 %	0 %	530314143
16	NC_022047	TCTAT	2	10	23071	23080	20 %	60 %	0 %	20 %	530314116
17	NC_022047	TTTTA	2	10	26493	26502	20 %	80 %	0 %	0 %	530314148
18	NC_022047	ATGTT	2	10	26903	26912	20 %	60 %	20 %	0 %	530314148
19	NC_022047	CTGAA	2	10	26999	27008	40 %	20 %	20 %	20 %	530314148
20	NC_022047	AATTC	2	10	29787	29796	40 %	40 %	0 %	20 %	530314151
21	NC_022047	CCACT	2	10	31842	31851	20 %	20 %	0 %	60 %	530314153
22	NC_022047	TTATC	2	10	32103	32112	20 %	60 %	0 %	20 %	530314154
23	NC_022047	GTATT	2	10	33991	34000	20 %	60 %	20 %	0 %	530314157
24	NC_022047	GAAAA	2	10	34251	34260	80 %	0 %	20 %	0 %	530314157
25	NC_022047	AAAAG	2	10	37533	37542	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022047	AAATA	2	10	37590	37599	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022047	GATCG	2	10	37692	37701	20 %	20 %	40 %	20 %	530314162
28	NC_022047	CAAGA	2	10	38977	38986	60 %	0 %	20 %	20 %	530314163
29	NC_022047	AAACA	2	10	39202	39211	80 %	0 %	0 %	20 %	530314163
30	NC_022047	GGGTG	2	10	39417	39426	0 %	20 %	80 %	0 %	530314163
31	NC_022047	GAATT	2	10	40919	40928	40 %	40 %	20 %	0 %	530314165
32	NC_022047	CATAA	2	10	42639	42648	60 %	20 %	0 %	20 %	530314167
33	NC_022047	GATTT	2	10	43552	43561	20 %	60 %	20 %	0 %	530314118
34	NC_022047	ACAAA	2	10	46149	46158	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_022047	CTTTT	2	10	46553	46562	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_022047	AGAAA	2	10	48415	48424	80 %	0 %	20 %	0 %	530314172
37	NC_022047	TAAAC	2	10	48661	48670	60 %	20 %	0 %	20 %	530314172
38	NC_022047	TTAAT	2	10	51236	51245	40 %	60 %	0 %	0 %	530314177
39	NC_022047	TTAAC	2	10	52323	52332	40 %	40 %	0 %	20 %	530314179
40	NC_022047	TTAGT	2	10	55032	55041	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.