MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1817 plasmid

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022047	TAAA	2	8	92	99	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022047	TTGA	2	8	121	128	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022047	ATTA	2	8	776	783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022047	GAAC	2	8	1500	1507	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_022047	ATTT	3	12	6575	6586	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022047	TTCT	2	8	6637	6644	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_022047	GATA	2	8	6669	6676	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022047	GACT	2	8	6742	6749	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_022047	GAGG	2	8	7003	7010	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022047	CTAC	2	8	7058	7065	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_022047	TAAA	2	8	9291	9298	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022047	TGTT	2	8	12947	12954	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022047	CATC	2	8	12974	12981	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_022047	GTTT	2	8	13855	13862	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022047	TAAT	2	8	18165	18172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022047	TAAA	2	8	18179	18186	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022047	CTAA	2	8	19568	19575	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_022047	TAGT	2	8	22141	22148	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022047	AATC	2	8	22162	22169	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_022047	GAAC	2	8	22262	22269	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_022047	TTTG	2	8	22335	22342	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022047	AATT	2	8	25476	25483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022047	AATT	2	8	27748	27755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022047	CAAG	2	8	31302	31309	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_022047	ATTA	2	8	31320	31327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022047	ATAA	2	8	31335	31342	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022047	GTAA	2	8	32976	32983	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022047	TTTA	2	8	37498	37505	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022047	TCAA	2	8	44579	44586	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_022047	ATTG	2	8	46088	46095	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022047	CTTT	2	8	46290	46297	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_022047	TTGA	2	8	46654	46661	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022047	TCTT	2	8	49372	49379	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_022047	GTAT	2	8	55111	55118	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022047	ATTT	2	8	55208	55215	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022047	TTAA	2	8	55364	55371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022047	ATGT	2	8	55472	55479	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022047	TCAT	2	8	55502	55509	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_022047	AAAT	2	8	55629	55636	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022047	GGAA	2	8	55762	55769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.