MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1817 plasmid

Total Repeats: 666

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022047	GTA	2	6	687	692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314123
2	NC_022047	AAG	2	6	702	707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314123
3	NC_022047	GAT	2	6	808	813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314124
4	NC_022047	ATT	2	6	839	844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314124
5	NC_022047	AAT	2	6	881	886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314124
6	NC_022047	CTT	2	6	972	977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314124
7	NC_022047	TGC	2	6	988	993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314124
8	NC_022047	TAC	2	6	1090	1095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314124
9	NC_022047	ATC	2	6	1146	1151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314124
10	NC_022047	GTA	2	6	1157	1162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314124
11	NC_022047	GAT	2	6	1240	1245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314124
12	NC_022047	GTT	2	6	1292	1297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314124
13	NC_022047	AAG	3	9	1320	1328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314124
14	NC_022047	AAT	2	6	1376	1381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314124
15	NC_022047	TTA	2	6	1709	1714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314125
16	NC_022047	CTT	2	6	1798	1803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314125
17	NC_022047	AGG	2	6	1886	1891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530314125
18	NC_022047	TCG	2	6	1925	1930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314125
19	NC_022047	CGA	2	6	2294	2299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314126
20	NC_022047	TTC	2	6	2516	2521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314127
21	NC_022047	TCT	3	9	2801	2809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314127
22	NC_022047	TTC	3	9	2824	2832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314127
23	NC_022047	GAA	2	6	2833	2838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314127
24	NC_022047	ACT	2	6	3191	3196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314111
25	NC_022047	AAT	2	6	3219	3224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314111
26	NC_022047	ACA	2	6	3237	3242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314111
27	NC_022047	ACA	2	6	3414	3419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314111
28	NC_022047	CAT	2	6	3523	3528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314111
29	NC_022047	TGT	2	6	3582	3587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314111
30	NC_022047	ATC	2	6	3635	3640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314111
31	NC_022047	AGC	2	6	3719	3724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314111
32	NC_022047	ATT	2	6	3768	3773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314111
33	NC_022047	ATC	2	6	3842	3847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314111
34	NC_022047	TGA	2	6	4016	4021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314111
35	NC_022047	CAG	2	6	4033	4038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314111
36	NC_022047	TTC	2	6	4066	4071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314111
37	NC_022047	ATA	2	6	4080	4085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314111
38	NC_022047	GAC	2	6	4133	4138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314111
39	NC_022047	AAT	2	6	4265	4270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314111
40	NC_022047	ATC	2	6	4290	4295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314111
41	NC_022047	ACA	2	6	4456	4461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314111
42	NC_022047	TTA	2	6	4509	4514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314111
43	NC_022047	CAA	2	6	4606	4611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314111
44	NC_022047	AAT	2	6	4667	4672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314111
45	NC_022047	TTC	2	6	4673	4678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314111
46	NC_022047	TAA	2	6	4690	4695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314111
47	NC_022047	CAG	2	6	4753	4758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314111
48	NC_022047	TAA	3	9	4813	4821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314111
49	NC_022047	CAA	2	6	4906	4911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314111
50	NC_022047	ATG	2	6	4928	4933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314111
51	NC_022047	CAA	2	6	5397	5402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314128
52	NC_022047	TAT	2	6	5415	5420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314128
53	NC_022047	TGA	3	9	5487	5495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314129
54	NC_022047	CTG	2	6	5697	5702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314129
55	NC_022047	TCC	2	6	5710	5715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530314129
56	NC_022047	TAG	2	6	5727	5732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314129
57	NC_022047	ACC	2	6	5793	5798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530314129
58	NC_022047	AAT	2	6	5827	5832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314129
59	NC_022047	ATT	2	6	5871	5876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314130
60	NC_022047	CAA	2	6	5881	5886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314130
61	NC_022047	CAA	2	6	5921	5926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314130
62	NC_022047	CTT	2	6	5957	5962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314130
63	NC_022047	CAG	2	6	5969	5974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314130
64	NC_022047	TAC	2	6	5978	5983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314130
65	NC_022047	AAT	2	6	6127	6132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314130
66	NC_022047	CTG	2	6	6218	6223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314130
67	NC_022047	ATA	2	6	6253	6258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314130
68	NC_022047	AAG	2	6	7125	7130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314131
69	NC_022047	TTA	2	6	7139	7144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314131
70	NC_022047	TGC	2	6	7591	7596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314131
71	NC_022047	TGC	2	6	7641	7646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314131
72	NC_022047	GCA	2	6	7742	7747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314131
73	NC_022047	TAA	2	6	7762	7767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314131
74	NC_022047	CTA	2	6	7890	7895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314131
75	NC_022047	CTA	2	6	8061	8066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314131
76	NC_022047	AGA	2	6	8141	8146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314131
77	NC_022047	ATT	2	6	8221	8226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314131
78	NC_022047	AGA	2	6	8254	8259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314131
79	NC_022047	AAT	2	6	8339	8344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314131
80	NC_022047	ATC	2	6	8357	8362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314131
81	NC_022047	ATT	2	6	8583	8588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314132
82	NC_022047	ATT	2	6	8751	8756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314132
83	NC_022047	GCC	2	6	8905	8910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530314132
84	NC_022047	AAT	2	6	8978	8983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314132
85	NC_022047	AGT	2	6	9179	9184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314132
86	NC_022047	ATG	2	6	9199	9204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314132
87	NC_022047	CAA	2	6	9473	9478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314133
88	NC_022047	CAA	2	6	9509	9514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314133
89	NC_022047	TTA	2	6	9710	9715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314133
90	NC_022047	ATA	2	6	9802	9807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314133
91	NC_022047	GAT	2	6	9893	9898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314134
92	NC_022047	TAG	2	6	9910	9915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314134
93	NC_022047	ATC	2	6	9942	9947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314134
94	NC_022047	TCC	2	6	10018	10023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530314134
95	NC_022047	CCA	2	6	10034	10039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530314134
96	NC_022047	GCA	2	6	10071	10076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314134
97	NC_022047	TGA	2	6	10106	10111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314134
98	NC_022047	CTT	2	6	10129	10134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314134
99	NC_022047	TTG	2	6	10135	10140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314134
100	NC_022047	GTA	2	6	10149	10154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314134
101	NC_022047	TGG	2	6	10177	10182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530314134
102	NC_022047	ATA	2	6	10214	10219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314134
103	NC_022047	TCA	2	6	10461	10466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314135
104	NC_022047	TAG	3	9	10552	10560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314135
105	NC_022047	TCG	2	6	10658	10663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314135
106	NC_022047	CAG	2	6	10680	10685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314135
107	NC_022047	CAT	2	6	10755	10760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314135
108	NC_022047	CCA	2	6	10773	10778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530314135
109	NC_022047	TAT	2	6	10788	10793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314135
110	NC_022047	TAT	2	6	10899	10904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314135
111	NC_022047	ATA	2	6	10916	10921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314135
112	NC_022047	GCA	2	6	10961	10966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314135
113	NC_022047	TTC	2	6	11086	11091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314135
114	NC_022047	TTC	2	6	11404	11409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314135
115	NC_022047	CAC	2	6	11556	11561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530314135
116	NC_022047	GGA	2	6	11573	11578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530314135
117	NC_022047	ATA	2	6	11600	11605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314135
118	NC_022047	CTT	2	6	11676	11681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314135
119	NC_022047	CTT	2	6	11751	11756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314135
120	NC_022047	TCA	2	6	11780	11785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314135
121	NC_022047	TGC	2	6	11824	11829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314135
122	NC_022047	GAA	2	6	11840	11845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314135
123	NC_022047	ATA	2	6	11900	11905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314135
124	NC_022047	TCG	2	6	11906	11911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314135
125	NC_022047	CTT	2	6	11967	11972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314135
126	NC_022047	TAC	2	6	12061	12066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314135
127	NC_022047	AAT	2	6	12106	12111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314135
128	NC_022047	CTT	2	6	12168	12173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314135
129	NC_022047	CCA	2	6	12188	12193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530314135
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133	NC_022047	TAA	2	6	12312	12317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314135
134	NC_022047	TCA	2	6	12341	12346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314135
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242	NC_022047	AGT	2	6	21582	21587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314143
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249	NC_022047	GCA	2	6	21820	21825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314143
250	NC_022047	CAA	2	6	21848	21853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314143
251	NC_022047	ACC	3	9	21867	21875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530314143
252	NC_022047	TCA	3	9	21958	21966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314143
253	NC_022047	ATC	2	6	21999	22004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314143
254	NC_022047	TCT	2	6	22024	22029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314143
255	NC_022047	AAC	2	6	22457	22462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314144
256	NC_022047	GAA	2	6	22507	22512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314144
257	NC_022047	AGC	2	6	22547	22552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314144
258	NC_022047	AGA	2	6	22578	22583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314144
259	NC_022047	GTC	2	6	22851	22856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314116
260	NC_022047	GGA	2	6	22878	22883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530314116
261	NC_022047	GCA	2	6	22893	22898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314116
262	NC_022047	CAT	2	6	22973	22978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314116
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267	NC_022047	ATT	2	6	23577	23582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314116
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275	NC_022047	TAG	2	6	23950	23955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314116
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279	NC_022047	TAA	2	6	24200	24205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314145
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282	NC_022047	ATT	2	6	24685	24690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314146
283	NC_022047	ATC	2	6	24714	24719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314146
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287	NC_022047	CTT	2	6	24923	24928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314146
288	NC_022047	ATA	2	6	24988	24993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314146
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327	NC_022047	TCT	2	6	29297	29302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314151
328	NC_022047	TCG	2	6	29327	29332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314151
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357	NC_022047	ATT	2	6	32160	32165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314154
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360	NC_022047	GAT	2	6	32465	32470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314154
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362	NC_022047	TGA	2	6	32524	32529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314154
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365	NC_022047	ACA	2	6	32655	32660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314154
366	NC_022047	GAA	2	6	32665	32670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314154
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371	NC_022047	ATA	2	6	32817	32822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314154
372	NC_022047	AAG	2	6	32841	32846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314154
373	NC_022047	GCT	2	6	32855	32860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314154
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376	NC_022047	ATT	2	6	33283	33288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314155
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378	NC_022047	GGA	2	6	33413	33418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530314155
379	NC_022047	ATC	2	6	33424	33429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314155
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381	NC_022047	ATC	2	6	33474	33479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314155
382	NC_022047	ATT	2	6	33503	33508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314155
383	NC_022047	TAT	2	6	33640	33645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314156
384	NC_022047	AAC	2	6	33663	33668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314156
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494	NC_022047	AAC	2	6	41876	41881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314166
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