MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes strain J1817 plasmid

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022047	AT	3	6	112	117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022047	AT	3	6	203	208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022047	TA	3	6	1391	1396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022047	AG	3	6	1553	1558	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022047	GA	3	6	2558	2563	50 %	0 %	50 %	0 %	530314127
6	NC_022047	TA	3	6	2758	2763	50 %	50 %	0 %	0 %	530314127
7	NC_022047	TA	3	6	3343	3348	50 %	50 %	0 %	0 %	530314111
8	NC_022047	AT	3	6	5527	5532	50 %	50 %	0 %	0 %	530314129
9	NC_022047	CT	3	6	6960	6965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_022047	TA	3	6	7311	7316	50 %	50 %	0 %	0 %	530314131
11	NC_022047	AT	3	6	7460	7465	50 %	50 %	0 %	0 %	530314131
12	NC_022047	AT	3	6	8394	8399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022047	AG	3	6	8615	8620	50 %	0 %	50 %	0 %	530314132
14	NC_022047	AT	3	6	9004	9009	50 %	50 %	0 %	0 %	530314132
15	NC_022047	TG	3	6	9108	9113	0 %	50 %	50 %	0 %	530314132
16	NC_022047	GA	3	6	9771	9776	50 %	0 %	50 %	0 %	530314133
17	NC_022047	AT	3	6	10007	10012	50 %	50 %	0 %	0 %	530314134
18	NC_022047	AT	3	6	10028	10033	50 %	50 %	0 %	0 %	530314134
19	NC_022047	CT	3	6	10195	10200	0 %	50 %	0 %	50 %	530314134
20	NC_022047	GT	3	6	10922	10927	0 %	50 %	50 %	0 %	530314135
21	NC_022047	AT	3	6	12207	12212	50 %	50 %	0 %	0 %	530314135
22	NC_022047	AG	3	6	12284	12289	50 %	0 %	50 %	0 %	530314135
23	NC_022047	CT	3	6	13295	13300	0 %	50 %	0 %	50 %	530314137
24	NC_022047	CT	3	6	13414	13419	0 %	50 %	0 %	50 %	530314137
25	NC_022047	CA	3	6	13827	13832	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_022047	AT	3	6	13917	13922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022047	AT	4	8	14378	14385	50 %	50 %	0 %	0 %	530314138
28	NC_022047	AG	3	6	15263	15268	50 %	0 %	50 %	0 %	530314138
29	NC_022047	GA	3	6	15713	15718	50 %	0 %	50 %	0 %	530314139
30	NC_022047	TG	3	6	16201	16206	0 %	50 %	50 %	0 %	530314112
31	NC_022047	AT	3	6	16894	16899	50 %	50 %	0 %	0 %	530314140
32	NC_022047	AT	3	6	17830	17835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022047	TC	3	6	17856	17861	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_022047	AC	3	6	18028	18033	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_022047	TA	3	6	19002	19007	50 %	50 %	0 %	0 %	530314141
36	NC_022047	AT	3	6	19466	19471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022047	TA	3	6	19481	19486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022047	TA	3	6	19501	19506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022047	TA	3	6	19613	19618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022047	GA	3	6	19757	19762	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022047	CT	3	6	20943	20948	0 %	50 %	0 %	50 %	530314115
42	NC_022047	GA	3	6	21094	21099	50 %	0 %	50 %	0 %	530314115
43	NC_022047	TA	3	6	21113	21118	50 %	50 %	0 %	0 %	530314142
44	NC_022047	TA	3	6	21480	21485	50 %	50 %	0 %	0 %	530314142
45	NC_022047	TA	3	6	21671	21676	50 %	50 %	0 %	0 %	530314143
46	NC_022047	TC	3	6	22297	22302	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_022047	GA	3	6	22667	22672	50 %	0 %	50 %	0 %	530314144
48	NC_022047	AT	3	6	24593	24598	50 %	50 %	0 %	0 %	530314146
49	NC_022047	AG	3	6	24903	24908	50 %	0 %	50 %	0 %	530314146
50	NC_022047	TA	3	6	25284	25289	50 %	50 %	0 %	0 %	530314146
51	NC_022047	TC	3	6	25308	25313	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_022047	AT	3	6	25324	25329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022047	TA	3	6	25433	25438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022047	AT	3	6	25524	25529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022047	AT	3	6	25556	25561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022047	TA	4	8	25595	25602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022047	TA	3	6	25645	25650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022047	AG	3	6	26028	26033	50 %	0 %	50 %	0 %	530314148
59	NC_022047	GA	3	6	26034	26039	50 %	0 %	50 %	0 %	530314148
60	NC_022047	GT	3	6	27164	27169	0 %	50 %	50 %	0 %	530314148
61	NC_022047	AG	3	6	27558	27563	50 %	0 %	50 %	0 %	530314148
62	NC_022047	GA	3	6	28805	28810	50 %	0 %	50 %	0 %	530314117
63	NC_022047	AT	3	6	30057	30062	50 %	50 %	0 %	0 %	530314152
64	NC_022047	AT	3	6	30269	30274	50 %	50 %	0 %	0 %	530314152
65	NC_022047	TG	3	6	30450	30455	0 %	50 %	50 %	0 %	530314152
66	NC_022047	TC	4	8	30911	30918	0 %	50 %	0 %	50 %	530314152
67	NC_022047	AG	4	8	31522	31529	50 %	0 %	50 %	0 %	530314153
68	NC_022047	GA	3	6	32190	32195	50 %	0 %	50 %	0 %	530314154
69	NC_022047	CG	3	6	33367	33372	0 %	0 %	50 %	50 %	530314155
70	NC_022047	CA	3	6	33862	33867	50 %	0 %	0 %	50 %	530314156
71	NC_022047	AT	3	6	34070	34075	50 %	50 %	0 %	0 %	530314157
72	NC_022047	GA	3	6	34963	34968	50 %	0 %	50 %	0 %	530314157
73	NC_022047	AC	3	6	34985	34990	50 %	0 %	0 %	50 %	530314157
74	NC_022047	AG	3	6	34997	35002	50 %	0 %	50 %	0 %	530314157
75	NC_022047	TA	3	6	35017	35022	50 %	50 %	0 %	0 %	530314157
76	NC_022047	GA	3	6	35160	35165	50 %	0 %	50 %	0 %	530314157
77	NC_022047	TG	3	6	36924	36929	0 %	50 %	50 %	0 %	530314160
78	NC_022047	AT	3	6	37684	37689	50 %	50 %	0 %	0 %	530314162
79	NC_022047	AT	3	6	38353	38358	50 %	50 %	0 %	0 %	530314163
80	NC_022047	AT	3	6	39397	39402	50 %	50 %	0 %	0 %	530314163
81	NC_022047	AG	4	8	39796	39803	50 %	0 %	50 %	0 %	530314164
82	NC_022047	CA	3	6	40260	40265	50 %	0 %	0 %	50 %	530314164
83	NC_022047	AT	3	6	40441	40446	50 %	50 %	0 %	0 %	530314164
84	NC_022047	AT	3	6	40653	40658	50 %	50 %	0 %	0 %	530314164
85	NC_022047	AC	3	6	43138	43143	50 %	0 %	0 %	50 %	530314167
86	NC_022047	AG	3	6	44047	44052	50 %	0 %	50 %	0 %	530314118
87	NC_022047	TA	4	8	44602	44609	50 %	50 %	0 %	0 %	530314119
88	NC_022047	TA	3	6	46103	46108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022047	TA	3	6	46679	46684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022047	AT	4	8	46850	46857	50 %	50 %	0 %	0 %	530314170
91	NC_022047	CA	3	6	47182	47187	50 %	0 %	0 %	50 %	530314171
92	NC_022047	AT	3	6	47286	47291	50 %	50 %	0 %	0 %	530314171
93	NC_022047	TC	3	6	47674	47679	0 %	50 %	0 %	50 %	530314171
94	NC_022047	AT	3	6	48787	48792	50 %	50 %	0 %	0 %	530314172
95	NC_022047	GT	3	6	48989	48994	0 %	50 %	50 %	0 %	530314172
96	NC_022047	GT	3	6	50171	50176	0 %	50 %	50 %	0 %	530314176
97	NC_022047	TC	3	6	51081	51086	0 %	50 %	0 %	50 %	530314121
98	NC_022047	AT	3	6	52641	52646	50 %	50 %	0 %	0 %	530314179
99	NC_022047	TA	3	6	52648	52653	50 %	50 %	0 %	0 %	530314179
100	NC_022047	AT	3	6	52754	52759	50 %	50 %	0 %	0 %	530314180
101	NC_022047	TA	3	6	53962	53967	50 %	50 %	0 %	0 %	530314180
102	NC_022047	AT	3	6	54199	54204	50 %	50 %	0 %	0 %	530314180

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.