MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1817 plasmid

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022047	GA	3	6	2558	2563	50 %	0 %	50 %	0 %	530314127
2	NC_022047	TA	3	6	2758	2763	50 %	50 %	0 %	0 %	530314127
3	NC_022047	TA	3	6	3343	3348	50 %	50 %	0 %	0 %	530314111
4	NC_022047	AT	3	6	5527	5532	50 %	50 %	0 %	0 %	530314129
5	NC_022047	TA	3	6	7311	7316	50 %	50 %	0 %	0 %	530314131
6	NC_022047	AT	3	6	7460	7465	50 %	50 %	0 %	0 %	530314131
7	NC_022047	AG	3	6	8615	8620	50 %	0 %	50 %	0 %	530314132
8	NC_022047	AT	3	6	9004	9009	50 %	50 %	0 %	0 %	530314132
9	NC_022047	TG	3	6	9108	9113	0 %	50 %	50 %	0 %	530314132
10	NC_022047	GA	3	6	9771	9776	50 %	0 %	50 %	0 %	530314133
11	NC_022047	AT	3	6	10007	10012	50 %	50 %	0 %	0 %	530314134
12	NC_022047	AT	3	6	10028	10033	50 %	50 %	0 %	0 %	530314134
13	NC_022047	CT	3	6	10195	10200	0 %	50 %	0 %	50 %	530314134
14	NC_022047	GT	3	6	10922	10927	0 %	50 %	50 %	0 %	530314135
15	NC_022047	AT	3	6	12207	12212	50 %	50 %	0 %	0 %	530314135
16	NC_022047	AG	3	6	12284	12289	50 %	0 %	50 %	0 %	530314135
17	NC_022047	CT	3	6	13295	13300	0 %	50 %	0 %	50 %	530314137
18	NC_022047	CT	3	6	13414	13419	0 %	50 %	0 %	50 %	530314137
19	NC_022047	AT	4	8	14378	14385	50 %	50 %	0 %	0 %	530314138
20	NC_022047	AG	3	6	15263	15268	50 %	0 %	50 %	0 %	530314138
21	NC_022047	GA	3	6	15713	15718	50 %	0 %	50 %	0 %	530314139
22	NC_022047	TG	3	6	16201	16206	0 %	50 %	50 %	0 %	530314112
23	NC_022047	AT	3	6	16894	16899	50 %	50 %	0 %	0 %	530314140
24	NC_022047	TA	3	6	19002	19007	50 %	50 %	0 %	0 %	530314141
25	NC_022047	CT	3	6	20943	20948	0 %	50 %	0 %	50 %	530314115
26	NC_022047	GA	3	6	21094	21099	50 %	0 %	50 %	0 %	530314115
27	NC_022047	TA	3	6	21113	21118	50 %	50 %	0 %	0 %	530314142
28	NC_022047	TA	3	6	21480	21485	50 %	50 %	0 %	0 %	530314142
29	NC_022047	TA	3	6	21671	21676	50 %	50 %	0 %	0 %	530314143
30	NC_022047	GA	3	6	22667	22672	50 %	0 %	50 %	0 %	530314144
31	NC_022047	AT	3	6	24593	24598	50 %	50 %	0 %	0 %	530314146
32	NC_022047	AG	3	6	24903	24908	50 %	0 %	50 %	0 %	530314146
33	NC_022047	TA	3	6	25284	25289	50 %	50 %	0 %	0 %	530314146
34	NC_022047	AG	3	6	26028	26033	50 %	0 %	50 %	0 %	530314148
35	NC_022047	GA	3	6	26034	26039	50 %	0 %	50 %	0 %	530314148
36	NC_022047	GT	3	6	27164	27169	0 %	50 %	50 %	0 %	530314148
37	NC_022047	AG	3	6	27558	27563	50 %	0 %	50 %	0 %	530314148
38	NC_022047	GA	3	6	28805	28810	50 %	0 %	50 %	0 %	530314117
39	NC_022047	AT	3	6	30057	30062	50 %	50 %	0 %	0 %	530314152
40	NC_022047	AT	3	6	30269	30274	50 %	50 %	0 %	0 %	530314152
41	NC_022047	TG	3	6	30450	30455	0 %	50 %	50 %	0 %	530314152
42	NC_022047	TC	4	8	30911	30918	0 %	50 %	0 %	50 %	530314152
43	NC_022047	AG	4	8	31522	31529	50 %	0 %	50 %	0 %	530314153
44	NC_022047	GA	3	6	32190	32195	50 %	0 %	50 %	0 %	530314154
45	NC_022047	CG	3	6	33367	33372	0 %	0 %	50 %	50 %	530314155
46	NC_022047	CA	3	6	33862	33867	50 %	0 %	0 %	50 %	530314156
47	NC_022047	AT	3	6	34070	34075	50 %	50 %	0 %	0 %	530314157
48	NC_022047	GA	3	6	34963	34968	50 %	0 %	50 %	0 %	530314157
49	NC_022047	AC	3	6	34985	34990	50 %	0 %	0 %	50 %	530314157
50	NC_022047	AG	3	6	34997	35002	50 %	0 %	50 %	0 %	530314157
51	NC_022047	TA	3	6	35017	35022	50 %	50 %	0 %	0 %	530314157
52	NC_022047	GA	3	6	35160	35165	50 %	0 %	50 %	0 %	530314157
53	NC_022047	TG	3	6	36924	36929	0 %	50 %	50 %	0 %	530314160
54	NC_022047	AT	3	6	37684	37689	50 %	50 %	0 %	0 %	530314162
55	NC_022047	AT	3	6	38353	38358	50 %	50 %	0 %	0 %	530314163
56	NC_022047	AT	3	6	39397	39402	50 %	50 %	0 %	0 %	530314163
57	NC_022047	AG	4	8	39796	39803	50 %	0 %	50 %	0 %	530314164
58	NC_022047	CA	3	6	40260	40265	50 %	0 %	0 %	50 %	530314164
59	NC_022047	AT	3	6	40441	40446	50 %	50 %	0 %	0 %	530314164
60	NC_022047	AT	3	6	40653	40658	50 %	50 %	0 %	0 %	530314164
61	NC_022047	AC	3	6	43138	43143	50 %	0 %	0 %	50 %	530314167
62	NC_022047	AG	3	6	44047	44052	50 %	0 %	50 %	0 %	530314118
63	NC_022047	TA	4	8	44602	44609	50 %	50 %	0 %	0 %	530314119
64	NC_022047	AT	4	8	46850	46857	50 %	50 %	0 %	0 %	530314170
65	NC_022047	CA	3	6	47182	47187	50 %	0 %	0 %	50 %	530314171
66	NC_022047	AT	3	6	47286	47291	50 %	50 %	0 %	0 %	530314171
67	NC_022047	TC	3	6	47674	47679	0 %	50 %	0 %	50 %	530314171
68	NC_022047	AT	3	6	48787	48792	50 %	50 %	0 %	0 %	530314172
69	NC_022047	GT	3	6	48989	48994	0 %	50 %	50 %	0 %	530314172
70	NC_022047	GT	3	6	50171	50176	0 %	50 %	50 %	0 %	530314176
71	NC_022047	TC	3	6	51081	51086	0 %	50 %	0 %	50 %	530314121
72	NC_022047	AT	3	6	52641	52646	50 %	50 %	0 %	0 %	530314179
73	NC_022047	TA	3	6	52648	52653	50 %	50 %	0 %	0 %	530314179
74	NC_022047	AT	3	6	52754	52759	50 %	50 %	0 %	0 %	530314180
75	NC_022047	TA	3	6	53962	53967	50 %	50 %	0 %	0 %	530314180
76	NC_022047	AT	3	6	54199	54204	50 %	50 %	0 %	0 %	530314180

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.