MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes strain J1817 plasmid

Total Repeats: 211

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022047	A	6	6	165	170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022047	G	6	6	427	432	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022047	A	8	8	614	621	100 %	0 %	0 %	0 %	530314123
4	NC_022047	T	6	6	624	629	0 %	100 %	0 %	0 %	530314123
5	NC_022047	A	6	6	729	734	100 %	0 %	0 %	0 %	530314123
6	NC_022047	A	6	6	1850	1855	100 %	0 %	0 %	0 %	530314125
7	NC_022047	T	6	6	2079	2084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022047	T	6	6	2355	2360	0 %	100 %	0 %	0 %	530314126
9	NC_022047	T	7	7	2503	2509	0 %	100 %	0 %	0 %	530314127
10	NC_022047	T	6	6	2951	2956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022047	T	7	7	2962	2968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022047	A	7	7	2971	2977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022047	T	6	6	4176	4181	0 %	100 %	0 %	0 %	530314111
14	NC_022047	T	6	6	4399	4404	0 %	100 %	0 %	0 %	530314111
15	NC_022047	T	6	6	5115	5120	0 %	100 %	0 %	0 %	530314111
16	NC_022047	T	6	6	5163	5168	0 %	100 %	0 %	0 %	530314128
17	NC_022047	T	7	7	5680	5686	0 %	100 %	0 %	0 %	530314129
18	NC_022047	A	6	6	6040	6045	100 %	0 %	0 %	0 %	530314130
19	NC_022047	T	6	6	6121	6126	0 %	100 %	0 %	0 %	530314130
20	NC_022047	T	6	6	6135	6140	0 %	100 %	0 %	0 %	530314130
21	NC_022047	A	7	7	6463	6469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022047	T	6	6	6472	6477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022047	T	7	7	6710	6716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022047	A	6	6	6813	6818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022047	A	6	6	6896	6901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022047	A	7	7	7094	7100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022047	A	6	6	7109	7114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022047	A	7	7	7184	7190	100 %	0 %	0 %	0 %	530314131
29	NC_022047	A	6	6	7474	7479	100 %	0 %	0 %	0 %	530314131
30	NC_022047	T	7	7	7561	7567	0 %	100 %	0 %	0 %	530314131
31	NC_022047	A	6	6	8071	8076	100 %	0 %	0 %	0 %	530314131
32	NC_022047	T	6	6	8225	8230	0 %	100 %	0 %	0 %	530314131
33	NC_022047	T	7	7	8435	8441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022047	A	8	8	9370	9377	100 %	0 %	0 %	0 %	530314133
35	NC_022047	A	6	6	9432	9437	100 %	0 %	0 %	0 %	530314133
36	NC_022047	T	6	6	9808	9813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022047	A	6	6	9842	9847	100 %	0 %	0 %	0 %	530314134
38	NC_022047	A	8	8	9864	9871	100 %	0 %	0 %	0 %	530314134
39	NC_022047	A	7	7	10384	10390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022047	T	6	6	11441	11446	0 %	100 %	0 %	0 %	530314135
41	NC_022047	T	7	7	11722	11728	0 %	100 %	0 %	0 %	530314135
42	NC_022047	T	6	6	11877	11882	0 %	100 %	0 %	0 %	530314135
43	NC_022047	T	7	7	12488	12494	0 %	100 %	0 %	0 %	530314135
44	NC_022047	T	6	6	12543	12548	0 %	100 %	0 %	0 %	530314135
45	NC_022047	T	7	7	12681	12687	0 %	100 %	0 %	0 %	530314136
46	NC_022047	T	6	6	13709	13714	0 %	100 %	0 %	0 %	530314137
47	NC_022047	A	7	7	13964	13970	100 %	0 %	0 %	0 %	530314138
48	NC_022047	A	7	7	14011	14017	100 %	0 %	0 %	0 %	530314138
49	NC_022047	A	7	7	14041	14047	100 %	0 %	0 %	0 %	530314138
50	NC_022047	A	6	6	14123	14128	100 %	0 %	0 %	0 %	530314138
51	NC_022047	T	6	6	14658	14663	0 %	100 %	0 %	0 %	530314138
52	NC_022047	T	6	6	14783	14788	0 %	100 %	0 %	0 %	530314138
53	NC_022047	T	7	7	16649	16655	0 %	100 %	0 %	0 %	530314112
54	NC_022047	A	6	6	16841	16846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022047	A	7	7	17047	17053	100 %	0 %	0 %	0 %	530314140
56	NC_022047	T	6	6	17138	17143	0 %	100 %	0 %	0 %	530314140
57	NC_022047	T	6	6	17192	17197	0 %	100 %	0 %	0 %	530314140
58	NC_022047	T	6	6	17296	17301	0 %	100 %	0 %	0 %	530314140
59	NC_022047	A	6	6	17414	17419	100 %	0 %	0 %	0 %	530314140
60	NC_022047	A	7	7	17756	17762	100 %	0 %	0 %	0 %	530314140
61	NC_022047	T	6	6	17849	17854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022047	A	6	6	18538	18543	100 %	0 %	0 %	0 %	530314141
63	NC_022047	A	6	6	18980	18985	100 %	0 %	0 %	0 %	530314141
64	NC_022047	A	6	6	19421	19426	100 %	0 %	0 %	0 %	530314141
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70	NC_022047	T	6	6	21564	21569	0 %	100 %	0 %	0 %	530314143
71	NC_022047	T	7	7	21654	21660	0 %	100 %	0 %	0 %	530314143
72	NC_022047	T	6	6	21699	21704	0 %	100 %	0 %	0 %	530314143
73	NC_022047	T	7	7	21839	21845	0 %	100 %	0 %	0 %	530314143
74	NC_022047	A	6	6	21893	21898	100 %	0 %	0 %	0 %	530314143
75	NC_022047	T	6	6	22113	22118	0 %	100 %	0 %	0 %	530314143
76	NC_022047	T	9	9	22189	22197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022047	A	6	6	22219	22224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022047	A	6	6	22238	22243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022047	T	6	6	22303	22308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022047	T	6	6	22794	22799	0 %	100 %	0 %	0 %	530314116
81	NC_022047	T	6	6	22844	22849	0 %	100 %	0 %	0 %	530314116
82	NC_022047	A	6	6	22911	22916	100 %	0 %	0 %	0 %	530314116
83	NC_022047	A	6	6	23144	23149	100 %	0 %	0 %	0 %	530314116
84	NC_022047	A	7	7	23698	23704	100 %	0 %	0 %	0 %	530314116
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89	NC_022047	A	6	6	24949	24954	100 %	0 %	0 %	0 %	530314146
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91	NC_022047	T	6	6	25269	25274	0 %	100 %	0 %	0 %	530314146
92	NC_022047	A	6	6	25410	25415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022047	A	7	7	25534	25540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022047	A	11	11	25687	25697	100 %	0 %	0 %	0 %	530314147
95	NC_022047	A	6	6	25728	25733	100 %	0 %	0 %	0 %	530314147
96	NC_022047	A	7	7	25831	25837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022047	T	6	6	25997	26002	0 %	100 %	0 %	0 %	530314148
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100	NC_022047	A	8	8	27461	27468	100 %	0 %	0 %	0 %	530314148
101	NC_022047	A	8	8	27961	27968	100 %	0 %	0 %	0 %	530314150
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113	NC_022047	T	7	7	31639	31645	0 %	100 %	0 %	0 %	530314153
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121	NC_022047	A	6	6	32573	32578	100 %	0 %	0 %	0 %	530314154
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123	NC_022047	A	7	7	32697	32703	100 %	0 %	0 %	0 %	530314154
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132	NC_022047	A	6	6	34387	34392	100 %	0 %	0 %	0 %	530314157
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146	NC_022047	G	7	7	37136	37142	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.