MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1817 plasmid

Total Repeats: 173

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022047	A	8	8	614	621	100 %	0 %	0 %	0 %	530314123
2	NC_022047	T	6	6	624	629	0 %	100 %	0 %	0 %	530314123
3	NC_022047	A	6	6	729	734	100 %	0 %	0 %	0 %	530314123
4	NC_022047	A	6	6	1850	1855	100 %	0 %	0 %	0 %	530314125
5	NC_022047	T	6	6	2355	2360	0 %	100 %	0 %	0 %	530314126
6	NC_022047	T	7	7	2503	2509	0 %	100 %	0 %	0 %	530314127
7	NC_022047	T	6	6	4176	4181	0 %	100 %	0 %	0 %	530314111
8	NC_022047	T	6	6	4399	4404	0 %	100 %	0 %	0 %	530314111
9	NC_022047	T	6	6	5115	5120	0 %	100 %	0 %	0 %	530314111
10	NC_022047	T	6	6	5163	5168	0 %	100 %	0 %	0 %	530314128
11	NC_022047	T	7	7	5680	5686	0 %	100 %	0 %	0 %	530314129
12	NC_022047	A	6	6	6040	6045	100 %	0 %	0 %	0 %	530314130
13	NC_022047	T	6	6	6121	6126	0 %	100 %	0 %	0 %	530314130
14	NC_022047	T	6	6	6135	6140	0 %	100 %	0 %	0 %	530314130
15	NC_022047	A	7	7	7184	7190	100 %	0 %	0 %	0 %	530314131
16	NC_022047	A	6	6	7474	7479	100 %	0 %	0 %	0 %	530314131
17	NC_022047	T	7	7	7561	7567	0 %	100 %	0 %	0 %	530314131
18	NC_022047	A	6	6	8071	8076	100 %	0 %	0 %	0 %	530314131
19	NC_022047	T	6	6	8225	8230	0 %	100 %	0 %	0 %	530314131
20	NC_022047	A	8	8	9370	9377	100 %	0 %	0 %	0 %	530314133
21	NC_022047	A	6	6	9432	9437	100 %	0 %	0 %	0 %	530314133
22	NC_022047	A	6	6	9842	9847	100 %	0 %	0 %	0 %	530314134
23	NC_022047	A	8	8	9864	9871	100 %	0 %	0 %	0 %	530314134
24	NC_022047	T	6	6	11441	11446	0 %	100 %	0 %	0 %	530314135
25	NC_022047	T	7	7	11722	11728	0 %	100 %	0 %	0 %	530314135
26	NC_022047	T	6	6	11877	11882	0 %	100 %	0 %	0 %	530314135
27	NC_022047	T	7	7	12488	12494	0 %	100 %	0 %	0 %	530314135
28	NC_022047	T	6	6	12543	12548	0 %	100 %	0 %	0 %	530314135
29	NC_022047	T	7	7	12681	12687	0 %	100 %	0 %	0 %	530314136
30	NC_022047	T	6	6	13709	13714	0 %	100 %	0 %	0 %	530314137
31	NC_022047	A	7	7	13964	13970	100 %	0 %	0 %	0 %	530314138
32	NC_022047	A	7	7	14011	14017	100 %	0 %	0 %	0 %	530314138
33	NC_022047	A	7	7	14041	14047	100 %	0 %	0 %	0 %	530314138
34	NC_022047	A	6	6	14123	14128	100 %	0 %	0 %	0 %	530314138
35	NC_022047	T	6	6	14658	14663	0 %	100 %	0 %	0 %	530314138
36	NC_022047	T	6	6	14783	14788	0 %	100 %	0 %	0 %	530314138
37	NC_022047	T	7	7	16649	16655	0 %	100 %	0 %	0 %	530314112
38	NC_022047	A	7	7	17047	17053	100 %	0 %	0 %	0 %	530314140
39	NC_022047	T	6	6	17138	17143	0 %	100 %	0 %	0 %	530314140
40	NC_022047	T	6	6	17192	17197	0 %	100 %	0 %	0 %	530314140
41	NC_022047	T	6	6	17296	17301	0 %	100 %	0 %	0 %	530314140
42	NC_022047	A	6	6	17414	17419	100 %	0 %	0 %	0 %	530314140
43	NC_022047	A	7	7	17756	17762	100 %	0 %	0 %	0 %	530314140
44	NC_022047	A	6	6	18538	18543	100 %	0 %	0 %	0 %	530314141
45	NC_022047	A	6	6	18980	18985	100 %	0 %	0 %	0 %	530314141
46	NC_022047	A	6	6	19421	19426	100 %	0 %	0 %	0 %	530314141
47	NC_022047	T	7	7	20683	20689	0 %	100 %	0 %	0 %	530314114
48	NC_022047	T	7	7	20725	20731	0 %	100 %	0 %	0 %	530314114
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50	NC_022047	A	6	6	21107	21112	100 %	0 %	0 %	0 %	530314142
51	NC_022047	T	7	7	21556	21562	0 %	100 %	0 %	0 %	530314143
52	NC_022047	T	6	6	21564	21569	0 %	100 %	0 %	0 %	530314143
53	NC_022047	T	7	7	21654	21660	0 %	100 %	0 %	0 %	530314143
54	NC_022047	T	6	6	21699	21704	0 %	100 %	0 %	0 %	530314143
55	NC_022047	T	7	7	21839	21845	0 %	100 %	0 %	0 %	530314143
56	NC_022047	A	6	6	21893	21898	100 %	0 %	0 %	0 %	530314143
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60	NC_022047	A	6	6	22911	22916	100 %	0 %	0 %	0 %	530314116
61	NC_022047	A	6	6	23144	23149	100 %	0 %	0 %	0 %	530314116
62	NC_022047	A	7	7	23698	23704	100 %	0 %	0 %	0 %	530314116
63	NC_022047	T	8	8	24254	24261	0 %	100 %	0 %	0 %	530314145
64	NC_022047	A	6	6	24407	24412	100 %	0 %	0 %	0 %	530314146
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68	NC_022047	T	6	6	25143	25148	0 %	100 %	0 %	0 %	530314146
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75	NC_022047	A	8	8	27461	27468	100 %	0 %	0 %	0 %	530314148
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82	NC_022047	T	7	7	29657	29663	0 %	100 %	0 %	0 %	530314151
83	NC_022047	T	6	6	29671	29676	0 %	100 %	0 %	0 %	530314151
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107	NC_022047	A	6	6	34554	34559	100 %	0 %	0 %	0 %	530314157
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.