MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776 plasmid

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022046	CAAGA	2	10	833	842	60 %	0 %	20 %	20 %	530314052
2	NC_022046	TCAAT	2	10	3699	3708	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_022046	TTTCT	2	10	4251	4260	0 %	80 %	0 %	20 %	530314055
4	NC_022046	TACTT	2	10	5185	5194	20 %	60 %	0 %	20 %	530314057
5	NC_022046	TTATT	2	10	5460	5469	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022046	CTTTG	2	10	11908	11917	0 %	60 %	20 %	20 %	530314039
7	NC_022046	TATAC	2	10	12592	12601	40 %	40 %	0 %	20 %	530314063
8	NC_022046	TGTTA	2	10	12741	12750	20 %	60 %	20 %	0 %	530314063
9	NC_022046	TAGTA	2	10	13321	13330	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022046	TGAAA	2	10	16305	16314	60 %	20 %	20 %	0 %	530314042
11	NC_022046	TTGGA	2	10	17105	17114	20 %	40 %	40 %	0 %	530314066
12	NC_022046	TCTAT	2	10	18276	18285	20 %	60 %	0 %	20 %	530314043
13	NC_022046	TTTTA	2	10	21698	21707	20 %	80 %	0 %	0 %	530314071
14	NC_022046	ATGTT	2	10	22108	22117	20 %	60 %	20 %	0 %	530314071
15	NC_022046	CTGAA	2	10	22204	22213	40 %	20 %	20 %	20 %	530314071
16	NC_022046	AATTC	2	10	24992	25001	40 %	40 %	0 %	20 %	530314074
17	NC_022046	CCACT	2	10	27047	27056	20 %	20 %	0 %	60 %	530314076
18	NC_022046	TTATC	2	10	27308	27317	20 %	60 %	0 %	20 %	530314077
19	NC_022046	GTATT	2	10	29196	29205	20 %	60 %	20 %	0 %	530314080
20	NC_022046	GAAAA	2	10	29456	29465	80 %	0 %	20 %	0 %	530314080
21	NC_022046	AAAAG	2	10	32738	32747	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022046	AAATA	2	10	32795	32804	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022046	GATCG	2	10	32897	32906	20 %	20 %	40 %	20 %	530314085
24	NC_022046	CAAGA	2	10	34182	34191	60 %	0 %	20 %	20 %	530314086
25	NC_022046	AAACA	2	10	34407	34416	80 %	0 %	0 %	20 %	530314086
26	NC_022046	GGGTG	2	10	34622	34631	0 %	20 %	80 %	0 %	530314086
27	NC_022046	GAATT	2	10	36124	36133	40 %	40 %	20 %	0 %	530314088
28	NC_022046	CATAA	2	10	37844	37853	60 %	20 %	0 %	20 %	530314090
29	NC_022046	GATTT	2	10	38757	38766	20 %	60 %	20 %	0 %	530314045
30	NC_022046	ACAAA	2	10	41354	41363	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_022046	CTTTT	2	10	41758	41767	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_022046	AGAAA	2	10	43620	43629	80 %	0 %	20 %	0 %	530314095
33	NC_022046	TAAAC	2	10	43866	43875	60 %	20 %	0 %	20 %	530314095
34	NC_022046	TTAAT	2	10	46441	46450	40 %	60 %	0 %	0 %	530314100
35	NC_022046	TTAAC	2	10	47528	47537	40 %	40 %	0 %	20 %	530314102
36	NC_022046	TTAGT	2	10	50237	50246	20 %	60 %	20 %	0 %	530314104
37	NC_022046	AGATG	2	10	52363	52372	40 %	20 %	40 %	0 %	530314106
38	NC_022046	AAATC	2	10	52492	52501	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_022046	GTTTT	2	10	53918	53927	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022046	CATAC	2	10	55333	55342	40 %	20 %	0 %	40 %	530314050

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.