MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776 plasmid

Total Repeats: 680

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022046	CAA	2	6	602	607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314051
2	NC_022046	TAT	2	6	620	625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314051
3	NC_022046	TGA	3	9	692	700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314052
4	NC_022046	CTG	2	6	902	907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314052
5	NC_022046	TCC	2	6	915	920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530314052
6	NC_022046	TAG	2	6	932	937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314052
7	NC_022046	ACC	2	6	998	1003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530314052
8	NC_022046	AAT	2	6	1032	1037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314052
9	NC_022046	ATT	2	6	1076	1081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314053
10	NC_022046	CAA	2	6	1086	1091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314053
11	NC_022046	CAA	2	6	1126	1131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314053
12	NC_022046	CTT	2	6	1162	1167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314053
13	NC_022046	CAG	2	6	1174	1179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314053
14	NC_022046	TAC	2	6	1183	1188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314053
15	NC_022046	AAT	2	6	1332	1337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314053
16	NC_022046	CTG	2	6	1423	1428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314053
17	NC_022046	ATA	2	6	1458	1463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314053
18	NC_022046	AAG	2	6	2330	2335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314054
19	NC_022046	TTA	2	6	2344	2349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314054
20	NC_022046	TGC	2	6	2796	2801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314054
21	NC_022046	TGC	2	6	2846	2851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314054
22	NC_022046	GCA	2	6	2947	2952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314054
23	NC_022046	TAA	2	6	2967	2972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314054
24	NC_022046	CTA	2	6	3095	3100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314054
25	NC_022046	CTA	2	6	3266	3271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314054
26	NC_022046	AGA	2	6	3346	3351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314054
27	NC_022046	ATT	2	6	3426	3431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314054
28	NC_022046	AGA	2	6	3459	3464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314054
29	NC_022046	AAT	2	6	3544	3549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314054
30	NC_022046	ATC	2	6	3562	3567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314054
31	NC_022046	ATT	2	6	3788	3793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314055
32	NC_022046	ATT	2	6	3956	3961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314055
33	NC_022046	GCC	2	6	4110	4115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530314055
34	NC_022046	AAT	2	6	4183	4188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314055
35	NC_022046	AGT	2	6	4384	4389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314055
36	NC_022046	ATG	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314055
37	NC_022046	CAA	2	6	4678	4683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314056
38	NC_022046	CAA	2	6	4714	4719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314056
39	NC_022046	TTA	2	6	4915	4920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314056
40	NC_022046	ATA	2	6	5007	5012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314056
41	NC_022046	GAT	2	6	5098	5103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314057
42	NC_022046	TAG	2	6	5115	5120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314057
43	NC_022046	ATC	2	6	5147	5152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314057
44	NC_022046	TCC	2	6	5223	5228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530314057
45	NC_022046	CCA	2	6	5239	5244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530314057
46	NC_022046	GCA	2	6	5276	5281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314057
47	NC_022046	TGA	2	6	5311	5316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314057
48	NC_022046	CTT	2	6	5334	5339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314057
49	NC_022046	TTG	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314057
50	NC_022046	GTA	2	6	5354	5359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314057
51	NC_022046	TGG	2	6	5382	5387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530314057
52	NC_022046	ATA	2	6	5419	5424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314057
53	NC_022046	TCA	2	6	5666	5671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314058
54	NC_022046	TAG	3	9	5757	5765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314058
55	NC_022046	TCG	2	6	5863	5868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314058
56	NC_022046	CAG	2	6	5885	5890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314058
57	NC_022046	CAT	2	6	5960	5965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314058
58	NC_022046	CCA	2	6	5978	5983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530314058
59	NC_022046	TAT	2	6	5993	5998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314058
60	NC_022046	TAT	2	6	6104	6109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314058
61	NC_022046	ATA	2	6	6121	6126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314058
62	NC_022046	GCA	2	6	6166	6171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314058
63	NC_022046	TTC	2	6	6291	6296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314058
64	NC_022046	TTC	2	6	6609	6614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314058
65	NC_022046	CAC	2	6	6761	6766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530314058
66	NC_022046	GGA	2	6	6778	6783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530314058
67	NC_022046	ATA	2	6	6805	6810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314058
68	NC_022046	CTT	2	6	6881	6886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314058
69	NC_022046	CTT	2	6	6956	6961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314058
70	NC_022046	TCA	2	6	6985	6990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314058
71	NC_022046	TGC	2	6	7029	7034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314058
72	NC_022046	GAA	2	6	7045	7050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314058
73	NC_022046	ATA	2	6	7105	7110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314058
74	NC_022046	TCG	2	6	7111	7116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314058
75	NC_022046	CTT	2	6	7172	7177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314058
76	NC_022046	TAC	2	6	7266	7271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314058
77	NC_022046	AAT	2	6	7311	7316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314058
78	NC_022046	CTT	2	6	7373	7378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314058
79	NC_022046	CCA	2	6	7393	7398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530314058
80	NC_022046	ATT	3	9	7399	7407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314058
81	NC_022046	TAA	2	6	7431	7436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314058
82	NC_022046	CAA	2	6	7472	7477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314058
83	NC_022046	TAA	2	6	7517	7522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314058
84	NC_022046	TCA	2	6	7546	7551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314058
85	NC_022046	ATC	2	6	7560	7565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314058
86	NC_022046	CTT	2	6	7595	7600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314058
87	NC_022046	TTC	2	6	7605	7610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314058
88	NC_022046	TTG	2	6	7613	7618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314058
89	NC_022046	CTT	2	6	7783	7788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314059
90	NC_022046	TAA	2	6	7834	7839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314059
91	NC_022046	TAG	2	6	7842	7847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314059
92	NC_022046	ACT	2	6	7875	7880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314059
93	NC_022046	GTT	2	6	7914	7919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314059
94	NC_022046	ATT	2	6	8120	8125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314059
95	NC_022046	TTA	2	6	8399	8404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314060
96	NC_022046	TTC	2	6	8450	8455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314060
97	NC_022046	TAA	2	6	8674	8679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314060
98	NC_022046	AAT	2	6	8688	8693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314060
99	NC_022046	ATA	2	6	8715	8720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314060
100	NC_022046	TAA	2	6	8731	8736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314060
101	NC_022046	GAT	2	6	8777	8782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314060
102	NC_022046	TCA	2	6	8784	8789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314060
103	NC_022046	CAC	2	6	8833	8838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530314060
104	NC_022046	CTT	2	6	8857	8862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314060
105	NC_022046	TAA	2	6	9165	9170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314061
106	NC_022046	GAA	2	6	9277	9282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314061
107	NC_022046	TGG	2	6	9341	9346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530314061
108	NC_022046	ATA	2	6	9491	9496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314061
109	NC_022046	CTT	2	6	9506	9511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314061
110	NC_022046	ATT	2	6	9529	9534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314061
111	NC_022046	ATT	2	6	9660	9665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314061
112	NC_022046	AAT	3	9	9717	9725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314061
113	NC_022046	CTG	2	6	9917	9922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314061
114	NC_022046	TAC	2	6	10013	10018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314061
115	NC_022046	GGA	2	6	10071	10076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530314061
116	NC_022046	GTT	2	6	10101	10106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314061
117	NC_022046	GGA	2	6	10203	10208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530314061
118	NC_022046	TCT	2	6	10215	10220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314061
119	NC_022046	TAA	2	6	10223	10228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314061
120	NC_022046	GGT	2	6	10245	10250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530314061
121	NC_022046	TAA	2	6	10500	10505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314061
122	NC_022046	TAG	2	6	10542	10547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314061
123	NC_022046	AAT	2	6	10558	10563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314061
124	NC_022046	GAG	2	6	10575	10580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530314061
125	NC_022046	TCT	2	6	10947	10952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314062
126	NC_022046	ATC	2	6	11114	11119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314039
127	NC_022046	AAT	2	6	11123	11128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314039
128	NC_022046	TCT	2	6	11142	11147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314039
129	NC_022046	CTT	2	6	11308	11313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314039
130	NC_022046	CAT	2	6	11324	11329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314039
131	NC_022046	TAA	2	6	11375	11380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314039
132	NC_022046	CTC	2	6	11449	11454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530314039
133	NC_022046	GTT	2	6	11636	11641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314039
134	NC_022046	TCC	2	6	11652	11657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530314039
135	NC_022046	CTT	2	6	11695	11700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314039
136	NC_022046	ATA	2	6	11714	11719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314039
137	NC_022046	TAA	2	6	11846	11851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314039
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140	NC_022046	TCT	2	6	12228	12233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314063
141	NC_022046	ATT	2	6	12306	12311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314063
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143	NC_022046	TTA	2	6	12413	12418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314063
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146	NC_022046	TAT	2	6	12552	12557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314063
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155	NC_022046	AGT	2	6	13758	13763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314064
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159	NC_022046	TAT	2	6	13997	14002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314064
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161	NC_022046	GGT	2	6	14263	14268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530314064
162	NC_022046	GTT	2	6	14308	14313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314064
163	NC_022046	GAT	2	6	14317	14322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314064
164	NC_022046	ATT	2	6	14368	14373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314064
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170	NC_022046	ATT	2	6	15046	15051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314040
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240	NC_022046	CAT	2	6	20284	20289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314069
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242	NC_022046	AAT	2	6	20372	20377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314069
243	NC_022046	GTG	2	6	20388	20393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530314069
244	NC_022046	TAA	3	9	20431	20439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314069
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246	NC_022046	TTG	2	6	20904	20909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314070
247	NC_022046	ACA	2	6	20920	20925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314070
248	NC_022046	AGC	2	6	21282	21287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314071
249	NC_022046	AGC	2	6	21383	21388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314071
250	NC_022046	AAG	2	6	21481	21486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314071
251	NC_022046	GCT	2	6	21488	21493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314071
252	NC_022046	CAA	2	6	21600	21605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314071
253	NC_022046	ACA	2	6	21635	21640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314071
254	NC_022046	TAC	2	6	21710	21715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314071
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256	NC_022046	CTT	2	6	21908	21913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314071
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381	NC_022046	AGA	2	6	31503	31508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314082
382	NC_022046	GAT	2	6	31657	31662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314082
383	NC_022046	GAA	3	9	31797	31805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314083
384	NC_022046	ATT	2	6	31814	31819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314083
385	NC_022046	AAG	2	6	31825	31830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314083
386	NC_022046	ATA	2	6	31978	31983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314083
387	NC_022046	ACT	2	6	32155	32160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314083
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390	NC_022046	CAC	2	6	32564	32569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530314084
391	NC_022046	GTA	2	6	32574	32579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314084
392	NC_022046	TAA	2	6	32604	32609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314084
393	NC_022046	TGA	2	6	32620	32625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314084
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395	NC_022046	TGG	2	6	33023	33028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530314085
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397	NC_022046	TAT	2	6	33187	33192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314085
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400	NC_022046	GAA	2	6	33272	33277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314086
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402	NC_022046	TGA	2	6	33406	33411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314086
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409	NC_022046	AAT	2	6	33941	33946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314086
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412	NC_022046	TGA	2	6	34120	34125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314086
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459	NC_022046	CAA	2	6	38121	38126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314090
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473	NC_022046	TCC	2	6	39153	39158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530314045
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492	NC_022046	ATC	2	6	40615	40620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314091
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499	NC_022046	AAT	2	6	40978	40983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314091
500	NC_022046	TCC	2	6	41009	41014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530314091

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