MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776 plasmid

Total Repeats: 211

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022046	T	6	6	320	325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022046	T	6	6	368	373	0 %	100 %	0 %	0 %	530314051
3	NC_022046	T	7	7	885	891	0 %	100 %	0 %	0 %	530314052
4	NC_022046	A	6	6	1245	1250	100 %	0 %	0 %	0 %	530314053
5	NC_022046	T	6	6	1326	1331	0 %	100 %	0 %	0 %	530314053
6	NC_022046	T	6	6	1340	1345	0 %	100 %	0 %	0 %	530314053
7	NC_022046	A	7	7	1668	1674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022046	T	6	6	1677	1682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022046	T	7	7	1915	1921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022046	A	6	6	2018	2023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022046	A	6	6	2101	2106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022046	A	7	7	2299	2305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022046	A	6	6	2314	2319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022046	A	7	7	2389	2395	100 %	0 %	0 %	0 %	530314054
15	NC_022046	A	6	6	2679	2684	100 %	0 %	0 %	0 %	530314054
16	NC_022046	T	7	7	2766	2772	0 %	100 %	0 %	0 %	530314054
17	NC_022046	A	6	6	3276	3281	100 %	0 %	0 %	0 %	530314054
18	NC_022046	T	6	6	3430	3435	0 %	100 %	0 %	0 %	530314054
19	NC_022046	T	7	7	3640	3646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022046	A	8	8	4575	4582	100 %	0 %	0 %	0 %	530314056
21	NC_022046	A	6	6	4637	4642	100 %	0 %	0 %	0 %	530314056
22	NC_022046	T	6	6	5013	5018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022046	A	6	6	5047	5052	100 %	0 %	0 %	0 %	530314057
24	NC_022046	A	8	8	5069	5076	100 %	0 %	0 %	0 %	530314057
25	NC_022046	A	7	7	5589	5595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022046	T	6	6	6646	6651	0 %	100 %	0 %	0 %	530314058
27	NC_022046	T	7	7	6927	6933	0 %	100 %	0 %	0 %	530314058
28	NC_022046	T	6	6	7082	7087	0 %	100 %	0 %	0 %	530314058
29	NC_022046	T	7	7	7693	7699	0 %	100 %	0 %	0 %	530314058
30	NC_022046	T	6	6	7748	7753	0 %	100 %	0 %	0 %	530314058
31	NC_022046	T	7	7	7886	7892	0 %	100 %	0 %	0 %	530314059
32	NC_022046	T	6	6	8914	8919	0 %	100 %	0 %	0 %	530314060
33	NC_022046	A	7	7	9169	9175	100 %	0 %	0 %	0 %	530314061
34	NC_022046	A	7	7	9216	9222	100 %	0 %	0 %	0 %	530314061
35	NC_022046	A	7	7	9246	9252	100 %	0 %	0 %	0 %	530314061
36	NC_022046	A	6	6	9328	9333	100 %	0 %	0 %	0 %	530314061
37	NC_022046	T	6	6	9863	9868	0 %	100 %	0 %	0 %	530314061
38	NC_022046	T	6	6	9988	9993	0 %	100 %	0 %	0 %	530314061
39	NC_022046	T	7	7	11854	11860	0 %	100 %	0 %	0 %	530314039
40	NC_022046	A	6	6	12046	12051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022046	A	7	7	12252	12258	100 %	0 %	0 %	0 %	530314063
42	NC_022046	T	6	6	12343	12348	0 %	100 %	0 %	0 %	530314063
43	NC_022046	T	6	6	12397	12402	0 %	100 %	0 %	0 %	530314063
44	NC_022046	T	6	6	12501	12506	0 %	100 %	0 %	0 %	530314063
45	NC_022046	A	6	6	12619	12624	100 %	0 %	0 %	0 %	530314063
46	NC_022046	A	7	7	12961	12967	100 %	0 %	0 %	0 %	530314063
47	NC_022046	T	6	6	13054	13059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022046	A	6	6	13743	13748	100 %	0 %	0 %	0 %	530314064
49	NC_022046	A	6	6	14185	14190	100 %	0 %	0 %	0 %	530314064
50	NC_022046	A	6	6	14626	14631	100 %	0 %	0 %	0 %	530314064
51	NC_022046	T	7	7	15888	15894	0 %	100 %	0 %	0 %	530314041
52	NC_022046	T	7	7	15930	15936	0 %	100 %	0 %	0 %	530314041
53	NC_022046	T	6	6	16285	16290	0 %	100 %	0 %	0 %	530314042
54	NC_022046	A	6	6	16312	16317	100 %	0 %	0 %	0 %	530314065
55	NC_022046	T	7	7	16761	16767	0 %	100 %	0 %	0 %	530314066
56	NC_022046	T	6	6	16769	16774	0 %	100 %	0 %	0 %	530314066
57	NC_022046	T	7	7	16859	16865	0 %	100 %	0 %	0 %	530314066
58	NC_022046	T	6	6	16904	16909	0 %	100 %	0 %	0 %	530314066
59	NC_022046	T	7	7	17044	17050	0 %	100 %	0 %	0 %	530314066
60	NC_022046	A	6	6	17098	17103	100 %	0 %	0 %	0 %	530314066
61	NC_022046	T	6	6	17318	17323	0 %	100 %	0 %	0 %	530314066
62	NC_022046	T	9	9	17394	17402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022046	A	6	6	17424	17429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022046	A	6	6	17443	17448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022046	T	6	6	17508	17513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022046	T	6	6	17999	18004	0 %	100 %	0 %	0 %	530314043
67	NC_022046	T	6	6	18049	18054	0 %	100 %	0 %	0 %	530314043
68	NC_022046	A	6	6	18116	18121	100 %	0 %	0 %	0 %	530314043
69	NC_022046	A	6	6	18349	18354	100 %	0 %	0 %	0 %	530314043
70	NC_022046	A	7	7	18903	18909	100 %	0 %	0 %	0 %	530314043
71	NC_022046	T	8	8	19459	19466	0 %	100 %	0 %	0 %	530314068
72	NC_022046	A	6	6	19612	19617	100 %	0 %	0 %	0 %	530314069
73	NC_022046	T	6	6	19840	19845	0 %	100 %	0 %	0 %	530314069
74	NC_022046	T	7	7	19858	19864	0 %	100 %	0 %	0 %	530314069
75	NC_022046	A	6	6	20154	20159	100 %	0 %	0 %	0 %	530314069
76	NC_022046	T	6	6	20348	20353	0 %	100 %	0 %	0 %	530314069
77	NC_022046	T	6	6	20474	20479	0 %	100 %	0 %	0 %	530314069
78	NC_022046	A	6	6	20615	20620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022046	A	7	7	20739	20745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022046	A	11	11	20892	20902	100 %	0 %	0 %	0 %	530314070
81	NC_022046	A	6	6	20933	20938	100 %	0 %	0 %	0 %	530314070
82	NC_022046	A	7	7	21036	21042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022046	T	6	6	21202	21207	0 %	100 %	0 %	0 %	530314071
84	NC_022046	A	6	6	22386	22391	100 %	0 %	0 %	0 %	530314071
85	NC_022046	A	6	6	22542	22547	100 %	0 %	0 %	0 %	530314071
86	NC_022046	A	8	8	22666	22673	100 %	0 %	0 %	0 %	530314071
87	NC_022046	A	8	8	23166	23173	100 %	0 %	0 %	0 %	530314073
88	NC_022046	A	6	6	23179	23184	100 %	0 %	0 %	0 %	530314073
89	NC_022046	A	6	6	23589	23594	100 %	0 %	0 %	0 %	530314073
90	NC_022046	T	7	7	24050	24056	0 %	100 %	0 %	0 %	530314044
91	NC_022046	T	7	7	24564	24570	0 %	100 %	0 %	0 %	530314074
92	NC_022046	T	6	6	24784	24789	0 %	100 %	0 %	0 %	530314074
93	NC_022046	T	7	7	24862	24868	0 %	100 %	0 %	0 %	530314074
94	NC_022046	T	6	6	24876	24881	0 %	100 %	0 %	0 %	530314074
95	NC_022046	T	6	6	26011	26016	0 %	100 %	0 %	0 %	530314075
96	NC_022046	T	6	6	26689	26694	0 %	100 %	0 %	0 %	530314076
97	NC_022046	A	7	7	26741	26747	100 %	0 %	0 %	0 %	530314076
98	NC_022046	A	9	9	26829	26837	100 %	0 %	0 %	0 %	530314076
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103	NC_022046	A	6	6	27233	27238	100 %	0 %	0 %	0 %	530314077
104	NC_022046	A	7	7	27262	27268	100 %	0 %	0 %	0 %	530314077
105	NC_022046	A	6	6	27650	27655	100 %	0 %	0 %	0 %	530314077
106	NC_022046	A	6	6	27740	27745	100 %	0 %	0 %	0 %	530314077
107	NC_022046	A	6	6	27778	27783	100 %	0 %	0 %	0 %	530314077
108	NC_022046	A	6	6	27820	27825	100 %	0 %	0 %	0 %	530314077
109	NC_022046	A	7	7	27902	27908	100 %	0 %	0 %	0 %	530314077
110	NC_022046	T	6	6	28394	28399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022046	A	7	7	28560	28566	100 %	0 %	0 %	0 %	530314078
112	NC_022046	A	6	6	28662	28667	100 %	0 %	0 %	0 %	530314078
113	NC_022046	A	6	6	28964	28969	100 %	0 %	0 %	0 %	530314079
114	NC_022046	A	6	6	29140	29145	100 %	0 %	0 %	0 %	530314079
115	NC_022046	A	6	6	29375	29380	100 %	0 %	0 %	0 %	530314080
116	NC_022046	A	6	6	29406	29411	100 %	0 %	0 %	0 %	530314080
117	NC_022046	A	6	6	29462	29467	100 %	0 %	0 %	0 %	530314080
118	NC_022046	A	6	6	29592	29597	100 %	0 %	0 %	0 %	530314080
119	NC_022046	A	6	6	29759	29764	100 %	0 %	0 %	0 %	530314080
120	NC_022046	T	6	6	29880	29885	0 %	100 %	0 %	0 %	530314080
121	NC_022046	T	6	6	29978	29983	0 %	100 %	0 %	0 %	530314080
122	NC_022046	A	6	6	30052	30057	100 %	0 %	0 %	0 %	530314080
123	NC_022046	A	7	7	30259	30265	100 %	0 %	0 %	0 %	530314080
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125	NC_022046	A	6	6	31644	31649	100 %	0 %	0 %	0 %	530314082
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127	NC_022046	T	8	8	31749	31756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022046	G	6	6	31942	31947	0 %	0 %	100 %	0 %	530314083
129	NC_022046	A	6	6	32077	32082	100 %	0 %	0 %	0 %	530314083
130	NC_022046	A	6	6	32188	32193	100 %	0 %	0 %	0 %	530314083
131	NC_022046	A	6	6	32290	32295	100 %	0 %	0 %	0 %	530314083
132	NC_022046	G	7	7	32341	32347	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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134	NC_022046	T	7	7	32643	32649	0 %	100 %	0 %	0 %	530314084
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136	NC_022046	T	7	7	33127	33133	0 %	100 %	0 %	0 %	530314085
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.