MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776 plasmid

Total Repeats: 175

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022046	T	6	6	368	373	0 %	100 %	0 %	0 %	530314051
2	NC_022046	T	7	7	885	891	0 %	100 %	0 %	0 %	530314052
3	NC_022046	A	6	6	1245	1250	100 %	0 %	0 %	0 %	530314053
4	NC_022046	T	6	6	1326	1331	0 %	100 %	0 %	0 %	530314053
5	NC_022046	T	6	6	1340	1345	0 %	100 %	0 %	0 %	530314053
6	NC_022046	A	7	7	2389	2395	100 %	0 %	0 %	0 %	530314054
7	NC_022046	A	6	6	2679	2684	100 %	0 %	0 %	0 %	530314054
8	NC_022046	T	7	7	2766	2772	0 %	100 %	0 %	0 %	530314054
9	NC_022046	A	6	6	3276	3281	100 %	0 %	0 %	0 %	530314054
10	NC_022046	T	6	6	3430	3435	0 %	100 %	0 %	0 %	530314054
11	NC_022046	A	8	8	4575	4582	100 %	0 %	0 %	0 %	530314056
12	NC_022046	A	6	6	4637	4642	100 %	0 %	0 %	0 %	530314056
13	NC_022046	A	6	6	5047	5052	100 %	0 %	0 %	0 %	530314057
14	NC_022046	A	8	8	5069	5076	100 %	0 %	0 %	0 %	530314057
15	NC_022046	T	6	6	6646	6651	0 %	100 %	0 %	0 %	530314058
16	NC_022046	T	7	7	6927	6933	0 %	100 %	0 %	0 %	530314058
17	NC_022046	T	6	6	7082	7087	0 %	100 %	0 %	0 %	530314058
18	NC_022046	T	7	7	7693	7699	0 %	100 %	0 %	0 %	530314058
19	NC_022046	T	6	6	7748	7753	0 %	100 %	0 %	0 %	530314058
20	NC_022046	T	7	7	7886	7892	0 %	100 %	0 %	0 %	530314059
21	NC_022046	T	6	6	8914	8919	0 %	100 %	0 %	0 %	530314060
22	NC_022046	A	7	7	9169	9175	100 %	0 %	0 %	0 %	530314061
23	NC_022046	A	7	7	9216	9222	100 %	0 %	0 %	0 %	530314061
24	NC_022046	A	7	7	9246	9252	100 %	0 %	0 %	0 %	530314061
25	NC_022046	A	6	6	9328	9333	100 %	0 %	0 %	0 %	530314061
26	NC_022046	T	6	6	9863	9868	0 %	100 %	0 %	0 %	530314061
27	NC_022046	T	6	6	9988	9993	0 %	100 %	0 %	0 %	530314061
28	NC_022046	T	7	7	11854	11860	0 %	100 %	0 %	0 %	530314039
29	NC_022046	A	7	7	12252	12258	100 %	0 %	0 %	0 %	530314063
30	NC_022046	T	6	6	12343	12348	0 %	100 %	0 %	0 %	530314063
31	NC_022046	T	6	6	12397	12402	0 %	100 %	0 %	0 %	530314063
32	NC_022046	T	6	6	12501	12506	0 %	100 %	0 %	0 %	530314063
33	NC_022046	A	6	6	12619	12624	100 %	0 %	0 %	0 %	530314063
34	NC_022046	A	7	7	12961	12967	100 %	0 %	0 %	0 %	530314063
35	NC_022046	A	6	6	13743	13748	100 %	0 %	0 %	0 %	530314064
36	NC_022046	A	6	6	14185	14190	100 %	0 %	0 %	0 %	530314064
37	NC_022046	A	6	6	14626	14631	100 %	0 %	0 %	0 %	530314064
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39	NC_022046	T	7	7	15930	15936	0 %	100 %	0 %	0 %	530314041
40	NC_022046	T	6	6	16285	16290	0 %	100 %	0 %	0 %	530314042
41	NC_022046	A	6	6	16312	16317	100 %	0 %	0 %	0 %	530314065
42	NC_022046	T	7	7	16761	16767	0 %	100 %	0 %	0 %	530314066
43	NC_022046	T	6	6	16769	16774	0 %	100 %	0 %	0 %	530314066
44	NC_022046	T	7	7	16859	16865	0 %	100 %	0 %	0 %	530314066
45	NC_022046	T	6	6	16904	16909	0 %	100 %	0 %	0 %	530314066
46	NC_022046	T	7	7	17044	17050	0 %	100 %	0 %	0 %	530314066
47	NC_022046	A	6	6	17098	17103	100 %	0 %	0 %	0 %	530314066
48	NC_022046	T	6	6	17318	17323	0 %	100 %	0 %	0 %	530314066
49	NC_022046	T	6	6	17999	18004	0 %	100 %	0 %	0 %	530314043
50	NC_022046	T	6	6	18049	18054	0 %	100 %	0 %	0 %	530314043
51	NC_022046	A	6	6	18116	18121	100 %	0 %	0 %	0 %	530314043
52	NC_022046	A	6	6	18349	18354	100 %	0 %	0 %	0 %	530314043
53	NC_022046	A	7	7	18903	18909	100 %	0 %	0 %	0 %	530314043
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63	NC_022046	T	6	6	21202	21207	0 %	100 %	0 %	0 %	530314071
64	NC_022046	A	6	6	22386	22391	100 %	0 %	0 %	0 %	530314071
65	NC_022046	A	6	6	22542	22547	100 %	0 %	0 %	0 %	530314071
66	NC_022046	A	8	8	22666	22673	100 %	0 %	0 %	0 %	530314071
67	NC_022046	A	8	8	23166	23173	100 %	0 %	0 %	0 %	530314073
68	NC_022046	A	6	6	23179	23184	100 %	0 %	0 %	0 %	530314073
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111	NC_022046	T	7	7	33127	33133	0 %	100 %	0 %	0 %	530314085
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.