MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes strain N1-011A plasmid

Total Repeats: 514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022045	CTTT	2	8	156	163	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_022045	CGAT	2	8	1572	1579	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_022045	TTTC	2	8	1685	1692	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_022045	AGTT	2	8	2373	2380	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022045	TTAC	2	8	2416	2423	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_022045	AAAT	2	8	2475	2482	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022045	CTGT	2	8	2680	2687	0 %	50 %	25 %	25 %	530313891
8	NC_022045	ATCA	2	8	2934	2941	50 %	25 %	0 %	25 %	530313892
9	NC_022045	GATA	2	8	2993	3000	50 %	25 %	25 %	0 %	530313892
10	NC_022045	CCAT	2	8	3107	3114	25 %	25 %	0 %	50 %	530313892
11	NC_022045	GCTT	2	8	3212	3219	0 %	50 %	25 %	25 %	530313893
12	NC_022045	TATT	2	8	3501	3508	25 %	75 %	0 %	0 %	530313894
13	NC_022045	AAAG	2	8	3594	3601	75 %	0 %	25 %	0 %	530313894
14	NC_022045	TTGT	2	8	3738	3745	0 %	75 %	25 %	0 %	530313894
15	NC_022045	TGGT	2	8	4758	4765	0 %	50 %	50 %	0 %	530313873
16	NC_022045	ATTC	2	8	4847	4854	25 %	50 %	0 %	25 %	530313873
17	NC_022045	TGGT	2	8	5023	5030	0 %	50 %	50 %	0 %	530313873
18	NC_022045	AAGA	2	8	6530	6537	75 %	0 %	25 %	0 %	530313895
19	NC_022045	ATTT	2	8	6688	6695	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022045	GAAA	2	8	7153	7160	75 %	0 %	25 %	0 %	530313896
21	NC_022045	AAAC	2	8	7466	7473	75 %	0 %	0 %	25 %	530313897
22	NC_022045	TTTC	2	8	8043	8050	0 %	75 %	0 %	25 %	530313898
23	NC_022045	TCAT	2	8	8387	8394	25 %	50 %	0 %	25 %	530313898
24	NC_022045	GTTT	2	8	8872	8879	0 %	75 %	25 %	0 %	530313899
25	NC_022045	AAAT	2	8	8887	8894	75 %	25 %	0 %	0 %	530313899
26	NC_022045	TCGG	2	8	9046	9053	0 %	25 %	50 %	25 %	530313899
27	NC_022045	CTTT	2	8	9058	9065	0 %	75 %	0 %	25 %	530313899
28	NC_022045	TTTC	2	8	9179	9186	0 %	75 %	0 %	25 %	530313899
29	NC_022045	CTTT	2	8	9739	9746	0 %	75 %	0 %	25 %	530313899
30	NC_022045	GCTT	2	8	10282	10289	0 %	50 %	25 %	25 %	530313900
31	NC_022045	ACTA	2	8	10354	10361	50 %	25 %	0 %	25 %	530313900
32	NC_022045	TAAA	2	8	10576	10583	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022045	GGAG	2	8	10584	10591	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022045	ACTT	2	8	10761	10768	25 %	50 %	0 %	25 %	530313901
35	NC_022045	AATA	2	8	11820	11827	75 %	25 %	0 %	0 %	530313903
36	NC_022045	ATGG	2	8	11869	11876	25 %	25 %	50 %	0 %	530313903
37	NC_022045	TTCT	2	8	11936	11943	0 %	75 %	0 %	25 %	530313903
38	NC_022045	CTTT	2	8	12228	12235	0 %	75 %	0 %	25 %	530313903
39	NC_022045	GCGA	2	8	12276	12283	25 %	0 %	50 %	25 %	530313903
40	NC_022045	TCTT	2	8	12740	12747	0 %	75 %	0 %	25 %	530313904
41	NC_022045	ATTG	2	8	14453	14460	25 %	50 %	25 %	0 %	530313906
42	NC_022045	TTCT	2	8	14486	14493	0 %	75 %	0 %	25 %	530313906
43	NC_022045	CTTA	2	8	15106	15113	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_022045	TTTA	2	8	15199	15206	25 %	75 %	0 %	0 %	530313908
45	NC_022045	TCTT	2	8	15450	15457	0 %	75 %	0 %	25 %	530313908
46	NC_022045	ACTT	2	8	15797	15804	25 %	50 %	0 %	25 %	530313908
47	NC_022045	TGTT	2	8	16045	16052	0 %	75 %	25 %	0 %	530313908
48	NC_022045	TCTT	2	8	16068	16075	0 %	75 %	0 %	25 %	530313908
49	NC_022045	CTTC	2	8	16104	16111	0 %	50 %	0 %	50 %	530313908
50	NC_022045	TAAT	2	8	16794	16801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022045	CTTG	2	8	16812	16819	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_022045	ATGA	2	8	17091	17098	50 %	25 %	25 %	0 %	530313911
53	NC_022045	GAAA	2	8	17435	17442	75 %	0 %	25 %	0 %	530313911
54	NC_022045	CAAA	2	8	17751	17758	75 %	0 %	0 %	25 %	530313911
55	NC_022045	CATC	2	8	17945	17952	25 %	25 %	0 %	50 %	530313911
56	NC_022045	TTTG	2	8	18105	18112	0 %	75 %	25 %	0 %	530313911
57	NC_022045	GAAA	2	8	18345	18352	75 %	0 %	25 %	0 %	530313912
58	NC_022045	ATCG	2	8	18661	18668	25 %	25 %	25 %	25 %	530313912
59	NC_022045	ACTT	2	8	18830	18837	25 %	50 %	0 %	25 %	530313912
60	NC_022045	GAAA	2	8	18862	18869	75 %	0 %	25 %	0 %	530313912
61	NC_022045	TCTT	2	8	19541	19548	0 %	75 %	0 %	25 %	530313874
62	NC_022045	TCCA	2	8	20123	20130	25 %	25 %	0 %	50 %	530313913
63	NC_022045	AATT	2	8	20713	20720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022045	CAAG	2	8	21538	21545	50 %	0 %	25 %	25 %	530313915
65	NC_022045	GTTC	2	8	21833	21840	0 %	50 %	25 %	25 %	530313915
66	NC_022045	CAAA	2	8	22461	22468	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_022045	TCCC	2	8	22480	22487	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
68	NC_022045	AATT	2	8	22985	22992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022045	ATTG	2	8	23331	23338	25 %	50 %	25 %	0 %	530313917
70	NC_022045	ATCA	2	8	24511	24518	50 %	25 %	0 %	25 %	530313875
71	NC_022045	GCAT	2	8	24527	24534	25 %	25 %	25 %	25 %	530313875
72	NC_022045	ATGA	2	8	24820	24827	50 %	25 %	25 %	0 %	530313875
73	NC_022045	GAAG	2	8	25425	25432	50 %	0 %	50 %	0 %	530313875
74	NC_022045	CTAC	2	8	25849	25856	25 %	25 %	0 %	50 %	530313919
75	NC_022045	ACAA	2	8	26125	26132	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_022045	CAAA	2	8	26215	26222	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_022045	TCAG	2	8	26248	26255	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_022045	ATTC	2	8	27032	27039	25 %	50 %	0 %	25 %	530313920
79	NC_022045	ATTT	2	8	27079	27086	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022045	GAAA	2	8	27131	27138	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022045	CATT	2	8	27943	27950	25 %	50 %	0 %	25 %	530313921
82	NC_022045	TTAA	2	8	28060	28067	50 %	50 %	0 %	0 %	530313921
83	NC_022045	TTAT	2	8	28779	28786	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022045	AATT	2	8	29423	29430	50 %	50 %	0 %	0 %	530313876
85	NC_022045	TCGA	2	8	29823	29830	25 %	25 %	25 %	25 %	530313876
86	NC_022045	AATC	2	8	30436	30443	50 %	25 %	0 %	25 %	530313876
87	NC_022045	ATTG	2	8	30853	30860	25 %	50 %	25 %	0 %	530313876
88	NC_022045	AAAT	2	8	32151	32158	75 %	25 %	0 %	0 %	530313923
89	NC_022045	TTTC	2	8	32326	32333	0 %	75 %	0 %	25 %	530313878
90	NC_022045	AATA	2	8	32656	32663	75 %	25 %	0 %	0 %	530313878
91	NC_022045	GACC	2	8	32721	32728	25 %	0 %	25 %	50 %	530313878
92	NC_022045	TTCG	2	8	32861	32868	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_022045	TTTA	2	8	33330	33337	25 %	75 %	0 %	0 %	530313924
94	NC_022045	GTTT	2	8	33469	33476	0 %	75 %	25 %	0 %	530313924
95	NC_022045	ATTA	2	8	33899	33906	50 %	50 %	0 %	0 %	530313925
96	NC_022045	ATTT	2	8	34187	34194	25 %	75 %	0 %	0 %	530313925
97	NC_022045	CATA	2	8	34441	34448	50 %	25 %	0 %	25 %	530313925
98	NC_022045	AATT	2	8	34591	34598	50 %	50 %	0 %	0 %	530313925
99	NC_022045	TTGA	2	8	34810	34817	25 %	50 %	25 %	0 %	530313925
100	NC_022045	ACAA	2	8	35266	35273	75 %	0 %	0 %	25 %	530313925
101	NC_022045	AAGG	2	8	36080	36087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022045	AAAC	2	8	36123	36130	75 %	0 %	0 %	25 %	530313879
103	NC_022045	GAAA	2	8	36287	36294	75 %	0 %	25 %	0 %	530313879
104	NC_022045	AAAG	2	8	36471	36478	75 %	0 %	25 %	0 %	530313880
105	NC_022045	TCAA	2	8	36741	36748	50 %	25 %	0 %	25 %	530313880
106	NC_022045	AAAG	2	8	37072	37079	75 %	0 %	25 %	0 %	530313880
107	NC_022045	TTAT	2	8	37189	37196	25 %	75 %	0 %	0 %	530313880
108	NC_022045	AAAT	2	8	37379	37386	75 %	25 %	0 %	0 %	530313881
109	NC_022045	ACCT	2	8	37434	37441	25 %	25 %	0 %	50 %	530313881
110	NC_022045	AACA	2	8	37503	37510	75 %	0 %	0 %	25 %	530313881
111	NC_022045	ATTT	2	8	37564	37571	25 %	75 %	0 %	0 %	530313881
112	NC_022045	TTTC	2	8	37822	37829	0 %	75 %	0 %	25 %	530313881
113	NC_022045	CATT	2	8	38910	38917	25 %	50 %	0 %	25 %	530313927
114	NC_022045	ATGT	2	8	39728	39735	25 %	50 %	25 %	0 %	530313929
115	NC_022045	GCAA	2	8	39882	39889	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_022045	AAAG	2	8	39917	39924	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022045	TCTT	2	8	40536	40543	0 %	75 %	0 %	25 %	530313882
118	NC_022045	AAAT	2	8	40562	40569	75 %	25 %	0 %	0 %	530313882
119	NC_022045	TAAT	2	8	40622	40629	50 %	50 %	0 %	0 %	530313930
120	NC_022045	TTTC	2	8	40648	40655	0 %	75 %	0 %	25 %	530313930
121	NC_022045	CAAA	2	8	40806	40813	75 %	0 %	0 %	25 %	530313930
122	NC_022045	ATTC	2	8	41004	41011	25 %	50 %	0 %	25 %	530313930
123	NC_022045	GTTT	2	8	41551	41558	0 %	75 %	25 %	0 %	530313931
124	NC_022045	CAAG	2	8	41809	41816	50 %	0 %	25 %	25 %	530313932
125	NC_022045	AATC	2	8	41848	41855	50 %	25 %	0 %	25 %	530313932
126	NC_022045	CGAT	2	8	42511	42518	25 %	25 %	25 %	25 %	530313934
127	NC_022045	CAAC	2	8	42619	42626	50 %	0 %	0 %	50 %	530313934
128	NC_022045	TAAT	2	8	42819	42826	50 %	50 %	0 %	0 %	530313935
129	NC_022045	TTGC	2	8	43256	43263	0 %	50 %	25 %	25 %	530313935
130	NC_022045	TCAC	2	8	43435	43442	25 %	25 %	0 %	50 %	530313935
131	NC_022045	GATG	2	8	43554	43561	25 %	25 %	50 %	0 %	530313935
132	NC_022045	CCAT	2	8	44254	44261	25 %	25 %	0 %	50 %	530313935
133	NC_022045	TCCT	2	8	44556	44563	0 %	50 %	0 %	50 %	530313935
134	NC_022045	AAAT	2	8	44597	44604	75 %	25 %	0 %	0 %	530313935
135	NC_022045	AATA	2	8	44664	44671	75 %	25 %	0 %	0 %	530313935
136	NC_022045	TTCT	2	8	44748	44755	0 %	75 %	0 %	25 %	530313935
137	NC_022045	GAGT	2	8	45615	45622	25 %	25 %	50 %	0 %	530313883
138	NC_022045	TTAT	2	8	45771	45778	25 %	75 %	0 %	0 %	530313883
139	NC_022045	TTGA	2	8	45812	45819	25 %	50 %	25 %	0 %	530313883
140	NC_022045	TCAA	2	8	46027	46034	50 %	25 %	0 %	25 %	530313883
141	NC_022045	GGAA	2	8	46136	46143	50 %	0 %	50 %	0 %	530313883
142	NC_022045	AACT	2	8	46145	46152	50 %	25 %	0 %	25 %	530313883
143	NC_022045	TCCA	2	8	46361	46368	25 %	25 %	0 %	50 %	530313937
144	NC_022045	CAAT	2	8	46519	46526	50 %	25 %	0 %	25 %	530313937
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