MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain N1-011A plasmid

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022045	AG	3	6	74	79	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022045	CT	4	8	215	222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_022045	CT	3	6	1360	1365	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_022045	TC	3	6	2797	2802	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_022045	AT	3	6	3449	3454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022045	GC	3	6	5073	5078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_022045	TA	3	6	5248	5253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022045	CT	3	6	22428	22433	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_022045	CT	3	6	22435	22440	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_022045	TA	3	6	22818	22823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022045	TA	4	8	22866	22873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022045	TA	3	6	22906	22911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022045	TA	3	6	22938	22943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022045	TA	3	6	23030	23035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022045	AT	3	6	23139	23144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022045	GA	3	6	23155	23160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022045	TA	3	6	26155	26160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022045	TA	3	6	27060	27065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022045	TA	3	6	28770	28775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022045	TA	3	6	35617	35622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022045	TA	4	8	35688	35695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022045	AT	4	8	35699	35706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022045	AG	3	6	36058	36063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022045	TC	3	6	37244	37249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_022045	CA	3	6	40062	40067	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_022045	TA	3	6	41628	41633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022045	TA	3	6	41996	42001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022045	TA	3	6	42007	42012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022045	TA	3	6	52423	52428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022045	AT	3	6	52489	52494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022045	AG	3	6	56930	56935	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022045	AG	3	6	57636	57641	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022045	AT	3	6	61003	61008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022045	GC	3	6	62626	62631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_022045	TA	3	6	62801	62806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022045	TG	3	6	65750	65755	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022045	TA	3	6	66964	66969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022045	GA	3	6	76227	76232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022045	GT	3	6	77742	77747	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022045	AT	3	6	77765	77770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022045	CT	3	6	77827	77832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_022045	TA	4	8	81407	81414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022045	CT	3	6	92331	92336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_022045	GA	3	6	103652	103657	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022045	CT	3	6	103667	103672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_022045	AT	3	6	106280	106285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022045	CT	3	6	118335	118340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_022045	CG	3	6	118651	118656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_022045	CA	3	6	119419	119424	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_022045	AT	3	6	119549	119554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022045	AT	3	6	122234	122239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022045	AT	3	6	122250	122255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022045	TA	3	6	122273	122278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022045	TA	3	6	122376	122381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022045	TA	3	6	122429	122434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022045	TA	4	8	122459	122466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022045	TA	3	6	123734	123739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022045	AT	3	6	123789	123794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022045	TA	4	8	123818	123825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022045	AT	3	6	123875	123880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022045	CT	3	6	123944	123949	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_022045	CA	3	6	132689	132694	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_022045	AT	3	6	132779	132784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022045	AG	3	6	135444	135449	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022045	AC	3	6	138438	138443	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_022045	AT	3	6	141455	141460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022045	TA	3	6	144862	144867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022045	CA	3	6	145319	145324	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_022045	TA	3	6	146993	146998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022045	AG	3	6	148322	148327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022045	TA	3	6	148785	148790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022045	AT	3	6	148931	148936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.