MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain N1-011A plasmid

Total Repeats: 208

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022045	CT	3	6	3662	3667	0 %	50 %	0 %	50 %	530313894
2	NC_022045	AT	3	6	3781	3786	50 %	50 %	0 %	0 %	530313894
3	NC_022045	TG	3	6	3906	3911	0 %	50 %	50 %	0 %	530313894
4	NC_022045	AT	3	6	4546	4551	50 %	50 %	0 %	0 %	530313873
5	NC_022045	TG	3	6	5906	5911	0 %	50 %	50 %	0 %	530313895
6	NC_022045	AT	3	6	7573	7578	50 %	50 %	0 %	0 %	530313897
7	NC_022045	TA	3	6	7867	7872	50 %	50 %	0 %	0 %	530313897
8	NC_022045	CT	3	6	7894	7899	0 %	50 %	0 %	50 %	530313897
9	NC_022045	TC	4	8	8275	8282	0 %	50 %	0 %	50 %	530313898
10	NC_022045	AT	3	6	8679	8684	50 %	50 %	0 %	0 %	530313899
11	NC_022045	CT	3	6	9323	9328	0 %	50 %	0 %	50 %	530313899
12	NC_022045	AT	3	6	9723	9728	50 %	50 %	0 %	0 %	530313899
13	NC_022045	AT	3	6	10392	10397	50 %	50 %	0 %	0 %	530313900
14	NC_022045	AC	3	6	11151	11156	50 %	0 %	0 %	50 %	530313902
15	NC_022045	TC	3	6	12925	12930	0 %	50 %	0 %	50 %	530313905
16	NC_022045	TA	3	6	13068	13073	50 %	50 %	0 %	0 %	530313905
17	NC_022045	CT	3	6	13088	13093	0 %	50 %	0 %	50 %	530313905
18	NC_022045	GT	3	6	13100	13105	0 %	50 %	50 %	0 %	530313905
19	NC_022045	TC	3	6	13122	13127	0 %	50 %	0 %	50 %	530313905
20	NC_022045	AT	3	6	13910	13915	50 %	50 %	0 %	0 %	530313905
21	NC_022045	AT	3	6	14015	14020	50 %	50 %	0 %	0 %	530313905
22	NC_022045	TG	3	6	14223	14228	0 %	50 %	50 %	0 %	530313906
23	NC_022045	TG	3	6	14356	14361	0 %	50 %	50 %	0 %	530313906
24	NC_022045	CG	3	6	14718	14723	0 %	0 %	50 %	50 %	530313907
25	NC_022045	TC	3	6	15928	15933	0 %	50 %	0 %	50 %	530313908
26	NC_022045	TC	4	8	16591	16598	0 %	50 %	0 %	50 %	530313910
27	NC_022045	AG	4	8	17202	17209	50 %	0 %	50 %	0 %	530313911
28	NC_022045	CA	3	6	17666	17671	50 %	0 %	0 %	50 %	530313911
29	NC_022045	AT	3	6	17847	17852	50 %	50 %	0 %	0 %	530313911
30	NC_022045	AT	3	6	18059	18064	50 %	50 %	0 %	0 %	530313911
31	NC_022045	CT	3	6	20905	20910	0 %	50 %	0 %	50 %	530313915
32	NC_022045	AC	3	6	21299	21304	50 %	0 %	0 %	50 %	530313915
33	NC_022045	TA	3	6	23179	23184	50 %	50 %	0 %	0 %	530313917
34	NC_022045	TC	3	6	23559	23564	0 %	50 %	0 %	50 %	530313917
35	NC_022045	AT	3	6	23870	23875	50 %	50 %	0 %	0 %	530313917
36	NC_022045	TC	3	6	25796	25801	0 %	50 %	0 %	50 %	530313919
37	NC_022045	AT	3	6	26288	26293	50 %	50 %	0 %	0 %	530313920
38	NC_022045	CT	3	6	26647	26652	0 %	50 %	0 %	50 %	530313920
39	NC_022045	TA	3	6	26711	26716	50 %	50 %	0 %	0 %	530313920
40	NC_022045	TA	3	6	26933	26938	50 %	50 %	0 %	0 %	530313920
41	NC_022045	AT	3	6	27478	27483	50 %	50 %	0 %	0 %	530313921
42	NC_022045	TA	3	6	27905	27910	50 %	50 %	0 %	0 %	530313921
43	NC_022045	AT	3	6	28271	28276	50 %	50 %	0 %	0 %	530313921
44	NC_022045	TA	3	6	28292	28297	50 %	50 %	0 %	0 %	530313921
45	NC_022045	TC	3	6	28449	28454	0 %	50 %	0 %	50 %	530313921
46	NC_022045	TA	3	6	30011	30016	50 %	50 %	0 %	0 %	530313876
47	NC_022045	CG	3	6	31559	31564	0 %	0 %	50 %	50 %	530313877
48	NC_022045	TA	3	6	33066	33071	50 %	50 %	0 %	0 %	530313924
49	NC_022045	CT	3	6	34096	34101	0 %	50 %	0 %	50 %	530313925
50	NC_022045	AT	3	6	34477	34482	50 %	50 %	0 %	0 %	530313925
51	NC_022045	GC	3	6	34664	34669	0 %	0 %	50 %	50 %	530313925
52	NC_022045	AT	3	6	34749	34754	50 %	50 %	0 %	0 %	530313925
53	NC_022045	TC	3	6	37978	37983	0 %	50 %	0 %	50 %	530313881
54	NC_022045	AT	3	6	38875	38880	50 %	50 %	0 %	0 %	530313927
55	NC_022045	TA	3	6	39223	39228	50 %	50 %	0 %	0 %	530313928
56	NC_022045	TC	3	6	39231	39236	0 %	50 %	0 %	50 %	530313928
57	NC_022045	TC	4	8	39806	39813	0 %	50 %	0 %	50 %	530313929
58	NC_022045	CA	3	6	40498	40503	50 %	0 %	0 %	50 %	530313882
59	NC_022045	GC	3	6	40821	40826	0 %	0 %	50 %	50 %	530313930
60	NC_022045	TA	3	6	41014	41019	50 %	50 %	0 %	0 %	530313930
61	NC_022045	GA	3	6	42612	42617	50 %	0 %	50 %	0 %	530313934
62	NC_022045	TC	3	6	43597	43602	0 %	50 %	0 %	50 %	530313935
63	NC_022045	AC	3	6	43805	43810	50 %	0 %	0 %	50 %	530313935
64	NC_022045	AG	3	6	44567	44572	50 %	0 %	50 %	0 %	530313935
65	NC_022045	AC	3	6	46446	46451	50 %	0 %	0 %	50 %	530313937
66	NC_022045	AC	3	6	46512	46517	50 %	0 %	0 %	50 %	530313937
67	NC_022045	TA	3	6	46752	46757	50 %	50 %	0 %	0 %	530313937
68	NC_022045	AG	3	6	46816	46821	50 %	0 %	50 %	0 %	530313937
69	NC_022045	GA	3	6	48301	48306	50 %	0 %	50 %	0 %	530313937
70	NC_022045	AG	3	6	49068	49073	50 %	0 %	50 %	0 %	530313937
71	NC_022045	AT	3	6	49375	49380	50 %	50 %	0 %	0 %	530313938
72	NC_022045	TA	4	8	49644	49651	50 %	50 %	0 %	0 %	530313938
73	NC_022045	AG	3	6	51440	51445	50 %	0 %	50 %	0 %	530313939
74	NC_022045	TG	3	6	51900	51905	0 %	50 %	50 %	0 %	530313939
75	NC_022045	AT	3	6	54010	54015	50 %	50 %	0 %	0 %	530313940
76	NC_022045	AT	3	6	54043	54048	50 %	50 %	0 %	0 %	530313940
77	NC_022045	AT	3	6	54158	54163	50 %	50 %	0 %	0 %	530313940
78	NC_022045	TA	3	6	54723	54728	50 %	50 %	0 %	0 %	530313941
79	NC_022045	GA	3	6	54757	54762	50 %	0 %	50 %	0 %	530313941
80	NC_022045	AT	4	8	55192	55199	50 %	50 %	0 %	0 %	530313941
81	NC_022045	TA	3	6	56109	56114	50 %	50 %	0 %	0 %	530313941
82	NC_022045	AT	3	6	56152	56157	50 %	50 %	0 %	0 %	530313941
83	NC_022045	TG	3	6	56200	56205	0 %	50 %	50 %	0 %	530313941
84	NC_022045	TA	3	6	56301	56306	50 %	50 %	0 %	0 %	530313941
85	NC_022045	AT	3	6	56321	56326	50 %	50 %	0 %	0 %	530313941
86	NC_022045	TA	3	6	56475	56480	50 %	50 %	0 %	0 %	530313941
87	NC_022045	CT	3	6	56752	56757	0 %	50 %	0 %	50 %	530313942
88	NC_022045	TA	3	6	57389	57394	50 %	50 %	0 %	0 %	530313943
89	NC_022045	AT	3	6	57535	57540	50 %	50 %	0 %	0 %	530313943
90	NC_022045	CT	4	8	57776	57783	0 %	50 %	0 %	50 %	530313885
91	NC_022045	CT	3	6	58921	58926	0 %	50 %	0 %	50 %	530313885
92	NC_022045	TC	3	6	60353	60358	0 %	50 %	0 %	50 %	530313944
93	NC_022045	CT	3	6	61216	61221	0 %	50 %	0 %	50 %	530313945
94	NC_022045	AT	3	6	61335	61340	50 %	50 %	0 %	0 %	530313945
95	NC_022045	TG	3	6	61459	61464	0 %	50 %	50 %	0 %	530313946
96	NC_022045	AT	3	6	62099	62104	50 %	50 %	0 %	0 %	530313886
97	NC_022045	TG	3	6	63459	63464	0 %	50 %	50 %	0 %	530313947
98	NC_022045	AT	3	6	65126	65131	50 %	50 %	0 %	0 %	530313949
99	NC_022045	TA	3	6	65420	65425	50 %	50 %	0 %	0 %	530313949
100	NC_022045	CT	3	6	65447	65452	0 %	50 %	0 %	50 %	530313949
101	NC_022045	CA	3	6	66090	66095	50 %	0 %	0 %	50 %	530313950
102	NC_022045	TG	3	6	67066	67071	0 %	50 %	50 %	0 %	530313952
103	NC_022045	TA	3	6	67310	67315	50 %	50 %	0 %	0 %	530313952
104	NC_022045	AT	3	6	67641	67646	50 %	50 %	0 %	0 %	530313952
105	NC_022045	TA	4	8	67723	67730	50 %	50 %	0 %	0 %	530313952
106	NC_022045	GA	3	6	68554	68559	50 %	0 %	50 %	0 %	530313952
107	NC_022045	AT	3	6	71637	71642	50 %	50 %	0 %	0 %	530313953
108	NC_022045	AT	3	6	73371	73376	50 %	50 %	0 %	0 %	530313955
109	NC_022045	TA	3	6	73735	73740	50 %	50 %	0 %	0 %	530313955
110	NC_022045	TA	3	6	75226	75231	50 %	50 %	0 %	0 %	530313955
111	NC_022045	CT	3	6	75662	75667	0 %	50 %	0 %	50 %	530313955
112	NC_022045	AT	3	6	76160	76165	50 %	50 %	0 %	0 %	530313956
113	NC_022045	AC	3	6	76559	76564	50 %	0 %	0 %	50 %	530313958
114	NC_022045	AT	3	6	77306	77311	50 %	50 %	0 %	0 %	530313958
115	NC_022045	AT	3	6	79544	79549	50 %	50 %	0 %	0 %	530313961
116	NC_022045	AG	3	6	80252	80257	50 %	0 %	50 %	0 %	530313962
117	NC_022045	AT	3	6	80294	80299	50 %	50 %	0 %	0 %	530313962
118	NC_022045	AT	4	8	80674	80681	50 %	50 %	0 %	0 %	530313963
119	NC_022045	TG	3	6	82956	82961	0 %	50 %	50 %	0 %	530313887
120	NC_022045	CA	3	6	83482	83487	50 %	0 %	0 %	50 %	530313887
121	NC_022045	CA	3	6	83786	83791	50 %	0 %	0 %	50 %	530313887
122	NC_022045	CT	3	6	84414	84419	0 %	50 %	0 %	50 %	530313968
123	NC_022045	AT	3	6	84904	84909	50 %	50 %	0 %	0 %	530313969
124	NC_022045	TC	3	6	85059	85064	0 %	50 %	0 %	50 %	530313969
125	NC_022045	AT	3	6	86930	86935	50 %	50 %	0 %	0 %	530313970
126	NC_022045	AT	3	6	87025	87030	50 %	50 %	0 %	0 %	530313970
127	NC_022045	GA	3	6	87369	87374	50 %	0 %	50 %	0 %	530313970
128	NC_022045	GA	3	6	88951	88956	50 %	0 %	50 %	0 %	530313972
129	NC_022045	AT	3	6	89091	89096	50 %	50 %	0 %	0 %	530313972
130	NC_022045	TA	3	6	89709	89714	50 %	50 %	0 %	0 %	530313973
131	NC_022045	AG	3	6	90547	90552	50 %	0 %	50 %	0 %	530313975
132	NC_022045	TC	3	6	91553	91558	0 %	50 %	0 %	50 %	530313976
133	NC_022045	AT	3	6	91840	91845	50 %	50 %	0 %	0 %	530313976
134	NC_022045	TC	3	6	92671	92676	0 %	50 %	0 %	50 %	530313978
135	NC_022045	TC	4	8	93169	93176	0 %	50 %	0 %	50 %	530313978
136	NC_022045	TA	3	6	93406	93411	50 %	50 %	0 %	0 %	530313978
137	NC_022045	CT	3	6	93669	93674	0 %	50 %	0 %	50 %	530313979
138	NC_022045	AC	3	6	94470	94475	50 %	0 %	0 %	50 %	530313979
139	NC_022045	TA	3	6	94867	94872	50 %	50 %	0 %	0 %	530313980
140	NC_022045	TA	3	6	95292	95297	50 %	50 %	0 %	0 %	530313981
141	NC_022045	TG	3	6	95568	95573	0 %	50 %	50 %	0 %	530313981
142	NC_022045	AT	4	8	98286	98293	50 %	50 %	0 %	0 %	530313983
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.