MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Streptomyces collinus Tu 365 plasmid pSCO1

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022001	TCGACG	2	12	2529	2540	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_022001	CCTGGA	2	12	5459	5470	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	529239179
3	NC_022001	CCCAGG	2	12	7518	7529	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	529239181
4	NC_022001	TCGGCG	2	12	9067	9078	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_022001	CTGCAC	2	12	10570	10581	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	529239183
6	NC_022001	TGTAGT	2	12	12543	12554	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	529239184
7	NC_022001	CCGGCC	2	12	16300	16311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_022001	CTGGTA	2	12	17794	17805	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	529239190
9	NC_022001	GCATCA	2	12	20149	20160	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_022001	CCCTGC	2	12	20235	20246	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_022001	TGCGCT	2	12	20408	20419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239193
12	NC_022001	CGGGAG	2	12	21520	21531	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_022001	CCGTGA	2	12	25283	25294	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_022001	CGGGGC	2	12	28405	28416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239205
15	NC_022001	ACGCGG	2	12	29050	29061	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	529239205
16	NC_022001	GCCCGC	2	12	29391	29402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239205
17	NC_022001	GTACAG	2	12	30145	30156	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	529239205
18	NC_022001	TCCCAG	2	12	31140	31151	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	529239206
19	NC_022001	CGGGTG	2	12	33525	33536	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	529239210
20	NC_022001	CTGGAG	2	12	34049	34060	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	529239210
21	NC_022001	TCGCCC	2	12	34071	34082	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	529239210
22	NC_022001	GCGCGA	2	12	35035	35046	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	529239210
23	NC_022001	CACCGA	2	12	35424	35435	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	529239211
24	NC_022001	TCGTTC	2	12	35892	35903	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	529239212
25	NC_022001	TCGTTC	2	12	35934	35945	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	529239212
26	NC_022001	CTCGTT	2	12	35978	35989	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	529239212
27	NC_022001	ACCCAG	2	12	36125	36136	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_022001	GGTCGG	2	12	37597	37608	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	529239213
29	NC_022001	GCCGAG	2	12	38150	38161	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	529239213
30	NC_022001	GTCGAT	2	12	38279	38290	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	529239213
31	NC_022001	CCGGAA	2	12	39456	39467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239213
32	NC_022001	TCAGCG	2	12	39707	39718	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	529239214
33	NC_022001	CGACCT	2	12	39782	39793	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	529239214
34	NC_022001	GACCAC	2	12	46428	46439	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	529239220
35	NC_022001	GCACCG	2	12	53790	53801	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	529239226
36	NC_022001	GCCGGA	2	12	54726	54737	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	529239226
37	NC_022001	GGCCGA	2	12	56901	56912	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_022001	GCCCGT	2	12	57502	57513	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_022001	GGGTGT	2	12	58040	58051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022001	GCGGGC	2	12	59453	59464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_022001	GACCGA	2	12	59574	59585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239230
42	NC_022001	CGGCTG	2	12	60069	60080	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_022001	CGGCAC	2	12	62662	62673	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_022001	CCAGCC	2	12	69109	69120	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	529239238
45	NC_022001	GGCCTT	2	12	70293	70304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239241
46	NC_022001	CGGTGA	2	12	70570	70581	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	529239242
47	NC_022001	CACGGT	2	12	71120	71131	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	529239242
48	NC_022001	CGGCAC	2	12	71487	71498	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_022001	GCGAGT	2	12	73192	73203	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	529239245
50	NC_022001	TACACC	2	12	73527	73538	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	529239245
51	NC_022001	CCCCTA	2	12	74683	74694	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	529239246
52	NC_022001	TGGTCC	2	12	75493	75504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239247
53	NC_022001	CGCCCG	2	12	76039	76050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239250
54	NC_022001	CGGTGG	2	12	76941	76952	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_022001	CCTGGC	2	12	78200	78211	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	529239252
56	NC_022001	GCCTGT	2	12	79647	79658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239252
57	NC_022001	GGTCCG	2	12	79807	79818	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	529239252
58	NC_022001	GTCCCG	2	12	80936	80947	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	529239252
59	NC_022001	TGGGCG	2	12	81278	81289	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	529239253
60	NC_022001	CCACCG	2	12	83732	83743	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	529239254
61	NC_022001	GCACCA	2	12	84275	84286	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	529239254

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.