MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptomyces collinus Tu 365 plasmid pSCO1

Total Repeats: 277

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022001	CTCC	2	8	170	177	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_022001	GGGA	2	8	311	318	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022001	GGAC	2	8	865	872	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_022001	CCGC	2	8	1086	1093	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_022001	CGGC	2	8	1751	1758	0 %	0 %	50 %	50 %	529239177
6	NC_022001	GGGC	2	8	1842	1849	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7	NC_022001	CCGC	2	8	1930	1937	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8	NC_022001	CGGC	2	8	2191	2198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_022001	GCGG	2	8	3484	3491	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10	NC_022001	GAAA	2	8	3720	3727	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022001	ACTG	2	8	3864	3871	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_022001	CTCG	2	8	4257	4264	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_022001	CGCT	2	8	4451	4458	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_022001	TCCA	2	8	5122	5129	25 %	25 %	0 %	50 %	529239179
15	NC_022001	GACC	2	8	5677	5684	25 %	0 %	25 %	50 %	529239179
16	NC_022001	CGGG	2	8	5988	5995	0 %	0 %	75 %	25 %	529239180
17	NC_022001	CCGC	2	8	6137	6144	0 %	0 %	25 %	75 %	529239180
18	NC_022001	GCCG	2	8	6421	6428	0 %	0 %	50 %	50 %	529239180
19	NC_022001	CTGC	2	8	6798	6805	0 %	25 %	25 %	50 %	529239180
20	NC_022001	GGCA	2	8	7742	7749	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_022001	GGGC	2	8	8291	8298	0 %	0 %	75 %	25 %	529239182
22	NC_022001	CGGG	2	8	8605	8612	0 %	0 %	75 %	25 %	529239182
23	NC_022001	GCGG	2	8	8631	8638	0 %	0 %	75 %	25 %	529239182
24	NC_022001	ACCA	2	8	9146	9153	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_022001	TAGC	2	8	9601	9608	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_022001	ACCG	2	8	9737	9744	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_022001	ACCG	2	8	9974	9981	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_022001	GCCG	2	8	9993	10000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_022001	GGCC	2	8	10147	10154	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_022001	TGGT	2	8	10843	10850	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022001	AGTC	2	8	11169	11176	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_022001	GGCT	2	8	11286	11293	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_022001	TTCG	2	8	11403	11410	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_022001	CCCA	2	8	11742	11749	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
35	NC_022001	GGCT	2	8	11998	12005	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_022001	CGGT	2	8	12227	12234	0 %	25 %	50 %	25 %	529239184
37	NC_022001	CATC	2	8	12844	12851	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_022001	CTTC	2	8	13872	13879	0 %	50 %	0 %	50 %	529239186
39	NC_022001	CGTC	2	8	14043	14050	0 %	25 %	25 %	50 %	529239186
40	NC_022001	GTGA	2	8	14522	14529	25 %	25 %	50 %	0 %	529239186
41	NC_022001	CCAC	2	8	14568	14575	25 %	0 %	0 %	75 %	529239186
42	NC_022001	GGCC	2	8	15541	15548	0 %	0 %	50 %	50 %	529239187
43	NC_022001	GTCG	2	8	15884	15891	0 %	25 %	50 %	25 %	529239187
44	NC_022001	CGCC	2	8	15968	15975	0 %	0 %	25 %	75 %	529239187
45	NC_022001	GCAG	2	8	15981	15988	25 %	0 %	50 %	25 %	529239187
46	NC_022001	CTGG	2	8	16565	16572	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_022001	AGTC	2	8	16626	16633	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_022001	AGCT	2	8	16947	16954	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_022001	CAGT	2	8	17038	17045	25 %	25 %	25 %	25 %	529239189
50	NC_022001	CCGA	2	8	17374	17381	25 %	0 %	25 %	50 %	529239189
51	NC_022001	CCAG	2	8	17591	17598	25 %	0 %	25 %	50 %	529239189
52	NC_022001	GGGC	2	8	17997	18004	0 %	0 %	75 %	25 %	529239190
53	NC_022001	GGCG	2	8	18988	18995	0 %	0 %	75 %	25 %	529239191
54	NC_022001	GGCG	2	8	19001	19008	0 %	0 %	75 %	25 %	529239191
55	NC_022001	CGGG	2	8	19331	19338	0 %	0 %	75 %	25 %	529239191
56	NC_022001	TCGG	2	8	19668	19675	0 %	25 %	50 %	25 %	529239192
57	NC_022001	GCCG	2	8	19796	19803	0 %	0 %	50 %	50 %	529239192
58	NC_022001	GGGA	2	8	20178	20185	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022001	GAAG	2	8	21373	21380	50 %	0 %	50 %	0 %	529239194
60	NC_022001	TCAT	2	8	21427	21434	25 %	50 %	0 %	25 %	529239194
61	NC_022001	GCCG	2	8	21783	21790	0 %	0 %	50 %	50 %	529239195
62	NC_022001	GCCG	2	8	22450	22457	0 %	0 %	50 %	50 %	529239196
63	NC_022001	CCCG	2	8	23104	23111	0 %	0 %	25 %	75 %	529239197
64	NC_022001	CTCA	2	8	23487	23494	25 %	25 %	0 %	50 %	529239197
65	NC_022001	GCCG	2	8	23520	23527	0 %	0 %	50 %	50 %	529239197
66	NC_022001	GGTC	2	8	23932	23939	0 %	25 %	50 %	25 %	529239198
67	NC_022001	CCGG	2	8	24028	24035	0 %	0 %	50 %	50 %	529239198
68	NC_022001	GGCG	2	8	25088	25095	0 %	0 %	75 %	25 %	529239199
69	NC_022001	GGAC	2	8	25707	25714	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_022001	GTCC	2	8	25934	25941	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_022001	CCGC	2	8	26524	26531	0 %	0 %	25 %	75 %	529239201
72	NC_022001	TCCG	2	8	27255	27262	0 %	25 %	25 %	50 %	529239202
73	NC_022001	CCGT	2	8	27476	27483	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_022001	CGCC	2	8	27610	27617	0 %	0 %	25 %	75 %	529239203
75	NC_022001	GCCG	2	8	27832	27839	0 %	0 %	50 %	50 %	529239203
76	NC_022001	CGGT	2	8	28004	28011	0 %	25 %	50 %	25 %	529239204
77	NC_022001	CCCA	2	8	28012	28019	25 %	0 %	0 %	75 %	529239204
78	NC_022001	GCCC	2	8	28385	28392	0 %	0 %	25 %	75 %	529239205
79	NC_022001	CCGC	2	8	28480	28487	0 %	0 %	25 %	75 %	529239205
80	NC_022001	GCGG	2	8	28637	28644	0 %	0 %	75 %	25 %	529239205
81	NC_022001	CGTC	2	8	29281	29288	0 %	25 %	25 %	50 %	529239205
82	NC_022001	ACCG	2	8	29367	29374	25 %	0 %	25 %	50 %	529239205
83	NC_022001	ACGG	2	8	29883	29890	25 %	0 %	50 %	25 %	529239205
84	NC_022001	CGGA	2	8	29925	29932	25 %	0 %	50 %	25 %	529239205
85	NC_022001	ACTC	2	8	30048	30055	25 %	25 %	0 %	50 %	529239205
86	NC_022001	CGCC	2	8	30340	30347	0 %	0 %	25 %	75 %	529239205
87	NC_022001	ACCC	2	8	30521	30528	25 %	0 %	0 %	75 %	529239205
88	NC_022001	GGGC	2	8	30655	30662	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
89	NC_022001	ACGA	2	8	31287	31294	50 %	0 %	25 %	25 %	529239206
90	NC_022001	AGGG	2	8	31684	31691	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022001	CCCG	2	8	32314	32321	0 %	0 %	25 %	75 %	529239208
92	NC_022001	CCTG	2	8	32475	32482	0 %	25 %	25 %	50 %	529239208
93	NC_022001	CGGC	2	8	33032	33039	0 %	0 %	50 %	50 %	529239209
94	NC_022001	CGCC	2	8	33231	33238	0 %	0 %	25 %	75 %	529239210
95	NC_022001	GGCC	2	8	33262	33269	0 %	0 %	50 %	50 %	529239210
96	NC_022001	CCGG	2	8	33446	33453	0 %	0 %	50 %	50 %	529239210
97	NC_022001	CCCA	2	8	33602	33609	25 %	0 %	0 %	75 %	529239210
98	NC_022001	CGGC	2	8	35696	35703	0 %	0 %	50 %	50 %	529239211
99	NC_022001	GCAG	2	8	36079	36086	25 %	0 %	50 %	25 %	529239212
100	NC_022001	CGCC	2	8	36147	36154	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
101	NC_022001	CGGG	2	8	36164	36171	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
102	NC_022001	GACC	2	8	36213	36220	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_022001	TGGC	2	8	36351	36358	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_022001	TCGG	2	8	36659	36666	0 %	25 %	50 %	25 %	529239213
105	NC_022001	CGGT	2	8	36993	37000	0 %	25 %	50 %	25 %	529239213
106	NC_022001	TCGG	2	8	37163	37170	0 %	25 %	50 %	25 %	529239213
107	NC_022001	CCGG	2	8	37208	37215	0 %	0 %	50 %	50 %	529239213
108	NC_022001	CGGC	2	8	38047	38054	0 %	0 %	50 %	50 %	529239213
109	NC_022001	GTCG	2	8	38080	38087	0 %	25 %	50 %	25 %	529239213
110	NC_022001	AGGT	2	8	38247	38254	25 %	25 %	50 %	0 %	529239213
111	NC_022001	AGGC	2	8	38313	38320	25 %	0 %	50 %	25 %	529239213
112	NC_022001	TGGC	2	8	38364	38371	0 %	25 %	50 %	25 %	529239213
113	NC_022001	GCTG	2	8	38516	38523	0 %	25 %	50 %	25 %	529239213
114	NC_022001	ACCG	2	8	38688	38695	25 %	0 %	25 %	50 %	529239213
115	NC_022001	CTGC	2	8	38821	38828	0 %	25 %	25 %	50 %	529239213
116	NC_022001	GCCC	2	8	38947	38954	0 %	0 %	25 %	75 %	529239213
117	NC_022001	CGCC	2	8	39022	39029	0 %	0 %	25 %	75 %	529239213
118	NC_022001	CGGC	2	8	39289	39296	0 %	0 %	50 %	50 %	529239213
119	NC_022001	GCTC	2	8	40068	40075	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_022001	TGGG	2	8	40162	40169	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022001	TGGG	2	8	40249	40256	0 %	25 %	75 %	0 %	529239215
122	NC_022001	GTAG	2	8	40351	40358	25 %	25 %	50 %	0 %	529239215
123	NC_022001	CGGT	2	8	40412	40419	0 %	25 %	50 %	25 %	529239215
124	NC_022001	GCCG	2	8	40436	40443	0 %	0 %	50 %	50 %	529239215
125	NC_022001	CGGC	2	8	40683	40690	0 %	0 %	50 %	50 %	529239215
126	NC_022001	GGCC	2	8	40901	40908	0 %	0 %	50 %	50 %	529239215
127	NC_022001	CCGC	2	8	41352	41359	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
128	NC_022001	AGCT	2	8	41490	41497	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_022001	CTCG	2	8	41994	42001	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_022001	GGGA	2	8	42617	42624	25 %	0 %	75 %	0 %	529239217
131	NC_022001	CACG	2	8	42866	42873	25 %	0 %	25 %	50 %	529239217
132	NC_022001	GATG	2	8	42923	42930	25 %	25 %	50 %	0 %	529239217
133	NC_022001	GCAC	2	8	43101	43108	25 %	0 %	25 %	50 %	529239218
134	NC_022001	GTTC	2	8	43565	43572	0 %	50 %	25 %	25 %	529239218
135	NC_022001	GCCA	2	8	43680	43687	25 %	0 %	25 %	50 %	529239218
136	NC_022001	CTCC	2	8	43966	43973	0 %	25 %	0 %	75 %	529239218
137	NC_022001	CAAG	2	8	44453	44460	50 %	0 %	25 %	25 %	529239218
138	NC_022001	TGCG	2	8	45131	45138	0 %	25 %	50 %	25 %	529239219
139	NC_022001	TGGT	2	8	45536	45543	0 %	50 %	50 %	0 %	529239219
140	NC_022001	GAGC	2	8	45584	45591	25 %	0 %	50 %	25 %	529239219
141	NC_022001	CCCG	2	8	45594	45601	0 %	0 %	25 %	75 %	529239219
142	NC_022001	GCAG	2	8	45880	45887	25 %	0 %	50 %	25 %	529239219
143	NC_022001	GGGA	2	8	46958	46965	25 %	0 %	75 %	0 %	529239220
144	NC_022001	CCGG	2	8	47059	47066	0 %	0 %	50 %	50 %	529239220
145	NC_022001	GAAG	2	8	47079	47086	50 %	0 %	50 %	0 %	529239220
146	NC_022001	GGCA	2	8	47214	47221	25 %	0 %	50 %	25 %	529239220
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149	NC_022001	CCGA	2	8	48145	48152	25 %	0 %	25 %	50 %	529239221
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154	NC_022001	CCGG	2	8	49538	49545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
155	NC_022001	CACT	2	8	49642	49649	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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250	NC_022001	CTGC	2	8	78994	79001	0 %	25 %	25 %	50 %	529239252
251	NC_022001	TGCC	2	8	79094	79101	0 %	25 %	25 %	50 %	529239252
252	NC_022001	TGGG	2	8	79106	79113	0 %	25 %	75 %	0 %	529239252
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259	NC_022001	CTGC	2	8	80595	80602	0 %	25 %	25 %	50 %	529239252
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262	NC_022001	GCAG	2	8	81117	81124	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
263	NC_022001	CTGC	2	8	81351	81358	0 %	25 %	25 %	50 %	529239253
264	NC_022001	GCCG	2	8	81592	81599	0 %	0 %	50 %	50 %	529239253
265	NC_022001	CCGC	2	8	81794	81801	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
266	NC_022001	ACCC	2	8	81833	81840	25 %	0 %	0 %	75 %	529239254
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271	NC_022001	TGCG	2	8	82856	82863	0 %	25 %	50 %	25 %	529239254
272	NC_022001	CCGC	2	8	83273	83280	0 %	0 %	25 %	75 %	529239254
273	NC_022001	GCCC	2	8	83284	83291	0 %	0 %	25 %	75 %	529239254
274	NC_022001	GCCG	2	8	83372	83379	0 %	0 %	50 %	50 %	529239254
275	NC_022001	CGAA	2	8	83978	83985	50 %	0 %	25 %	25 %	529239254
276	NC_022001	CGCC	2	8	84231	84238	0 %	0 %	25 %	75 %	529239254
277	NC_022001	CCCG	2	8	84864	84871	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.