MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptomyces collinus Tu 365 plasmid pSCO1

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022001	CTCC	2	8	170	177	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_022001	GGGA	2	8	311	318	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022001	GGAC	2	8	865	872	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_022001	CCGC	2	8	1086	1093	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_022001	GGGC	2	8	1842	1849	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6	NC_022001	CCGC	2	8	1930	1937	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_022001	CGGC	2	8	2191	2198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_022001	GCGG	2	8	3484	3491	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9	NC_022001	GAAA	2	8	3720	3727	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022001	ACTG	2	8	3864	3871	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_022001	CTCG	2	8	4257	4264	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_022001	CGCT	2	8	4451	4458	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_022001	GGCA	2	8	7742	7749	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_022001	ACCA	2	8	9146	9153	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_022001	TAGC	2	8	9601	9608	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_022001	ACCG	2	8	9737	9744	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_022001	ACCG	2	8	9974	9981	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_022001	GCCG	2	8	9993	10000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_022001	GGCC	2	8	10147	10154	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_022001	TGGT	2	8	10843	10850	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022001	AGTC	2	8	11169	11176	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_022001	GGCT	2	8	11286	11293	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_022001	TTCG	2	8	11403	11410	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_022001	CCCA	2	8	11742	11749	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_022001	GGCT	2	8	11998	12005	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_022001	CATC	2	8	12844	12851	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_022001	CTGG	2	8	16565	16572	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_022001	AGTC	2	8	16626	16633	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_022001	AGCT	2	8	16947	16954	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_022001	GGGA	2	8	20178	20185	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022001	GGAC	2	8	25707	25714	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_022001	GTCC	2	8	25934	25941	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_022001	CCGT	2	8	27476	27483	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_022001	GGGC	2	8	30655	30662	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_022001	AGGG	2	8	31684	31691	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022001	CGCC	2	8	36147	36154	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
37	NC_022001	CGGG	2	8	36164	36171	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38	NC_022001	GACC	2	8	36213	36220	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_022001	TGGC	2	8	36351	36358	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_022001	GCTC	2	8	40068	40075	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_022001	TGGG	2	8	40162	40169	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022001	CCGC	2	8	41352	41359	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43	NC_022001	AGCT	2	8	41490	41497	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_022001	CTCG	2	8	41994	42001	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_022001	GCAC	2	8	47386	47393	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_022001	GGCG	2	8	48015	48022	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_022001	CCCG	2	8	49502	49509	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48	NC_022001	CCGG	2	8	49538	49545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_022001	CACT	2	8	49642	49649	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_022001	CCAC	2	8	51949	51956	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_022001	GTCG	2	8	52912	52919	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_022001	TCGG	2	8	56530	56537	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_022001	GCGT	2	8	57534	57541	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_022001	GCTG	2	8	58059	58066	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_022001	AGTG	2	8	60217	60224	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022001	GCCG	2	8	60403	60410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_022001	GGGT	2	8	60707	60714	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022001	CCCG	2	8	61039	61046	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
59	NC_022001	CCGC	2	8	61050	61057	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
60	NC_022001	GCCT	2	8	61058	61065	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_022001	GTCC	2	8	61086	61093	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_022001	CTGC	2	8	61104	61111	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_022001	GAGC	2	8	61136	61143	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_022001	CGAA	2	8	62755	62762	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_022001	GCTG	2	8	62885	62892	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_022001	GGCG	2	8	63093	63100	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
67	NC_022001	TCGA	2	8	66344	66351	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_022001	GGGC	2	8	69751	69758	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
69	NC_022001	CGAG	2	8	72142	72149	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_022001	CCCG	2	8	74820	74827	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
71	NC_022001	CCGA	2	8	76554	76561	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_022001	GCAG	2	8	81117	81124	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_022001	CCGC	2	8	81794	81801	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
74	NC_022001	CCCG	2	8	84864	84871	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.