MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptomyces collinus Tu 365 plasmid pSCO1

Total Repeats: 416

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022001	CTC	2	6	18	23	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_022001	GAG	2	6	31	36	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022001	GCA	3	9	223	231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_022001	GAC	2	6	371	376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_022001	TGG	2	6	881	886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022001	TTC	2	6	904	909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_022001	CTT	2	6	918	923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_022001	GGT	2	6	930	935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022001	GAG	2	6	954	959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022001	GGA	2	6	972	977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022001	CTT	2	6	993	998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_022001	GAA	2	6	999	1004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022001	CGA	2	6	1117	1122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_022001	GAG	2	6	1306	1311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022001	GCG	2	6	1315	1320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_022001	GGC	2	6	1800	1805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_022001	CTC	2	6	1810	1815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_022001	CGC	2	6	1870	1875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_022001	CCA	2	6	1944	1949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_022001	CGT	2	6	1955	1960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_022001	TGG	2	6	2272	2277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022001	TGG	2	6	2296	2301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022001	TCC	2	6	2302	2307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_022001	GCG	2	6	2308	2313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_022001	TGG	2	6	2345	2350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022001	GCA	2	6	2418	2423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_022001	CCT	2	6	2431	2436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_022001	AGC	2	6	2438	2443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_022001	CGT	2	6	2521	2526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_022001	CGG	2	6	2617	2622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_022001	CGT	2	6	2660	2665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_022001	AGC	2	6	2680	2685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_022001	CTC	2	6	2721	2726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_022001	ACC	2	6	2767	2772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_022001	CGT	2	6	2780	2785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_022001	CAG	2	6	2808	2813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_022001	GGT	2	6	2836	2841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022001	CTG	2	6	2911	2916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_022001	CCA	2	6	2995	3000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_022001	CCT	2	6	3004	3009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_022001	CGG	2	6	3265	3270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_022001	CTT	2	6	3294	3299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_022001	GAC	2	6	3315	3320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_022001	CGA	2	6	3353	3358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_022001	GGT	2	6	3371	3376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022001	CGT	2	6	3380	3385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_022001	AGA	2	6	3593	3598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022001	CTC	2	6	3621	3626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_022001	AAC	2	6	3750	3755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_022001	CGC	2	6	3808	3813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_022001	AGC	2	6	3848	3853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_022001	TCC	2	6	3922	3927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_022001	GAC	2	6	3987	3992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_022001	CTT	2	6	4053	4058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_022001	GAA	2	6	4322	4327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022001	GCT	2	6	4349	4354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_022001	CCG	2	6	4359	4364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_022001	TGG	2	6	4475	4480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022001	GCG	2	6	4521	4526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_022001	CAC	2	6	4538	4543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_022001	CTC	2	6	4544	4549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_022001	TCC	3	9	4560	4568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_022001	GCC	3	9	4593	4601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_022001	TCC	2	6	4710	4715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_022001	AGA	2	6	4732	4737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022001	GCA	2	6	4875	4880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_022001	GCC	2	6	4888	4893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_022001	AGG	2	6	4920	4925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022001	GAC	2	6	6904	6909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_022001	CAC	2	6	6997	7002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_022001	CTG	2	6	7030	7035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_022001	ACC	2	6	7066	7071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_022001	CCG	2	6	7073	7078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_022001	CAC	2	6	7083	7088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_022001	CGG	2	6	7116	7121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_022001	GCT	2	6	7200	7205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_022001	CAG	2	6	7223	7228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_022001	CGC	2	6	7240	7245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_022001	TCC	2	6	7251	7256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_022001	GCC	2	6	8734	8739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_022001	GTC	2	6	8852	8857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_022001	GCG	2	6	8997	9002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_022001	GAT	2	6	9007	9012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022001	CTA	2	6	9201	9206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_022001	CCG	2	6	9259	9264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_022001	TCA	2	6	9303	9308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_022001	CAA	2	6	9446	9451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_022001	CCA	2	6	9454	9459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_022001	CAC	2	6	9499	9504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_022001	CCG	2	6	9528	9533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_022001	GCG	2	6	9623	9628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_022001	TCC	3	9	9676	9684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_022001	CGT	2	6	9783	9788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_022001	ACT	2	6	9846	9851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_022001	CGG	2	6	9934	9939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_022001	CGG	2	6	9958	9963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_022001	ACG	2	6	10008	10013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_022001	CGA	2	6	10024	10029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_022001	ACG	2	6	10062	10067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_022001	GCA	2	6	10102	10107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_022001	GCC	2	6	10129	10134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_022001	GGC	2	6	10168	10173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_022001	TCG	2	6	10188	10193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_022001	CGG	2	6	10200	10205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_022001	AGC	2	6	10229	10234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_022001	TGC	2	6	10235	10240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_022001	GCC	2	6	10258	10263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_022001	CCG	2	6	10817	10822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_022001	AGT	2	6	10860	10865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022001	GAT	2	6	10978	10983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022001	GCG	2	6	11311	11316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_022001	CTG	2	6	11394	11399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_022001	CGG	2	6	11432	11437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_022001	GTG	2	6	11475	11480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022001	CGC	2	6	11508	11513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_022001	GAC	2	6	11716	11721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_022001	CGA	2	6	11847	11852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_022001	TGA	2	6	11865	11870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022001	CGT	2	6	12006	12011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_022001	GAA	2	6	12622	12627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022001	GGC	2	6	12650	12655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_022001	CGG	2	6	12817	12822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_022001	GCG	2	6	12927	12932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_022001	CCT	2	6	12968	12973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_022001	TCC	2	6	14729	14734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_022001	TGT	2	6	16144	16149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022001	GGC	2	6	16195	16200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_022001	GCA	2	6	16233	16238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_022001	GGT	2	6	16259	16264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022001	CCG	2	6	16336	16341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_022001	AGC	2	6	16358	16363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_022001	CGG	2	6	16365	16370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_022001	GCC	2	6	16650	16655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_022001	CAG	2	6	16695	16700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_022001	GGT	2	6	16794	16799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022001	GCT	2	6	16862	16867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_022001	GGC	2	6	16961	16966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_022001	TCG	2	6	17611	17616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_022001	AAC	2	6	18573	18578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_022001	ACC	2	6	18652	18657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_022001	CAC	2	6	18792	18797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_022001	GGC	2	6	19427	19432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_022001	CGG	2	6	19445	19450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_022001	GCG	2	6	19559	19564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_022001	CGC	2	6	19586	19591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_022001	GCT	2	6	20060	20065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_022001	GAA	2	6	20200	20205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022001	CGC	2	6	20229	20234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_022001	GGC	2	6	20316	20321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_022001	TCG	2	6	20365	20370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_022001	CTC	2	6	20379	20384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_022001	GCA	2	6	20625	20630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_022001	GGC	2	6	20796	20801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_022001	CGC	2	6	20815	20820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
155	NC_022001	GCG	2	6	20845	20850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_022001	TGG	2	6	20868	20873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
157	NC_022001	AGT	2	6	20940	20945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_022001	GCT	2	6	21038	21043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_022001	TGT	2	6	21097	21102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_022001	AGC	2	6	21473	21478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_022001	GCT	2	6	24619	24624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_022001	GCC	2	6	24640	24645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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165	NC_022001	CGT	2	6	25496	25501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_022001	CTG	2	6	25590	25595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_022001	TGG	2	6	25601	25606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
168	NC_022001	GTC	2	6	25612	25617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_022001	CTG	2	6	25622	25627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_022001	AGG	2	6	25659	25664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
171	NC_022001	GTT	2	6	25749	25754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
172	NC_022001	CCA	2	6	25865	25870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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174	NC_022001	CGA	2	6	26992	26997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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177	NC_022001	CCG	2	6	28245	28250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
178	NC_022001	CGC	2	6	30579	30584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
179	NC_022001	AGC	2	6	30595	30600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_022001	CAG	2	6	30684	30689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_022001	GGC	2	6	31610	31615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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184	NC_022001	CTC	2	6	31709	31714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
185	NC_022001	TGG	2	6	31881	31886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_022001	CCG	2	6	32039	32044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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197	NC_022001	CGG	2	6	36329	36334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
198	NC_022001	CGC	2	6	36385	36390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.