MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Streptomyces collinus Tu 365 plasmid pSCO1

Total Repeats: 1114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022001	CGT	3	9	1371	1379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239177
2	NC_022001	CTC	2	6	1386	1391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239177
3	NC_022001	CTC	2	6	1448	1453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239177
4	NC_022001	CGT	3	9	1658	1666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239177
5	NC_022001	GCC	2	6	1669	1674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239177
6	NC_022001	CAG	2	6	3087	3092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239178
7	NC_022001	GCC	2	6	3142	3147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239178
8	NC_022001	CTC	2	6	5000	5005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239179
9	NC_022001	CGA	2	6	5062	5067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239179
10	NC_022001	ACG	2	6	5077	5082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239179
11	NC_022001	CGC	2	6	5249	5254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239179
12	NC_022001	GCT	2	6	5438	5443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239179
13	NC_022001	GGA	2	6	5525	5530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529239179
14	NC_022001	TTC	3	9	5580	5588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529239179
15	NC_022001	CGG	2	6	5618	5623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239179
16	NC_022001	CGC	2	6	5666	5671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239179
17	NC_022001	TCT	2	6	5771	5776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529239180
18	NC_022001	GCA	2	6	5816	5821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239180
19	NC_022001	GCC	2	6	5909	5914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239180
20	NC_022001	AGC	3	9	5923	5931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239180
21	NC_022001	CCT	2	6	5975	5980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239180
22	NC_022001	TCC	2	6	6025	6030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239180
23	NC_022001	CTC	2	6	6036	6041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239180
24	NC_022001	CAC	2	6	6052	6057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529239180
25	NC_022001	GAC	2	6	6203	6208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239180
26	NC_022001	GCC	2	6	6220	6225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239180
27	NC_022001	CCA	2	6	6297	6302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529239180
28	NC_022001	CGC	2	6	6308	6313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239180
29	NC_022001	CCG	2	6	6327	6332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239180
30	NC_022001	CAT	2	6	6390	6395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529239180
31	NC_022001	TCA	2	6	6404	6409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529239180
32	NC_022001	CTG	2	6	6429	6434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239180
33	NC_022001	CAC	2	6	6563	6568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529239180
34	NC_022001	GAA	2	6	6654	6659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529239180
35	NC_022001	CCT	2	6	6788	6793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239180
36	NC_022001	CGG	2	6	7355	7360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239181
37	NC_022001	GCA	2	6	7361	7366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239181
38	NC_022001	GAG	2	6	7369	7374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529239181
39	NC_022001	AGT	2	6	7448	7453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529239181
40	NC_022001	GCG	2	6	7489	7494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239181
41	NC_022001	GCA	2	6	7628	7633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239181
42	NC_022001	GTG	2	6	7654	7659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529239181
43	NC_022001	GTG	2	6	7685	7690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529239181
44	NC_022001	CGG	2	6	7701	7706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239181
45	NC_022001	GGT	2	6	7761	7766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529239182
46	NC_022001	GCT	2	6	7770	7775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239182
47	NC_022001	CGG	2	6	7778	7783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239182
48	NC_022001	AGG	2	6	7834	7839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529239182
49	NC_022001	GTC	2	6	7902	7907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239182
50	NC_022001	GCG	2	6	7927	7932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239182
51	NC_022001	GTA	2	6	7968	7973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529239182
52	NC_022001	GGC	2	6	8037	8042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239182
53	NC_022001	TCA	2	6	8060	8065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529239182
54	NC_022001	GAT	2	6	8094	8099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529239182
55	NC_022001	GCA	2	6	8255	8260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239182
56	NC_022001	CGG	2	6	8317	8322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239182
57	NC_022001	GAC	4	12	8436	8447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239182
58	NC_022001	CCA	2	6	8462	8467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529239182
59	NC_022001	AGC	2	6	8533	8538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239182
60	NC_022001	TCC	2	6	8563	8568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239182
61	NC_022001	GCG	2	6	8642	8647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239182
62	NC_022001	TCG	2	6	10619	10624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239183
63	NC_022001	ATG	2	6	10625	10630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529239183
64	NC_022001	CTG	2	6	10636	10641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239183
65	NC_022001	GAT	2	6	10753	10758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529239183
66	NC_022001	CGT	2	6	12135	12140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239184
67	NC_022001	GCT	2	6	12152	12157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239184
68	NC_022001	TTC	2	6	12250	12255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529239184
69	NC_022001	CTG	2	6	12354	12359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239184
70	NC_022001	CGG	2	6	12360	12365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239184
71	NC_022001	GCG	2	6	12422	12427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239184
72	NC_022001	TCT	2	6	12443	12448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529239184
73	NC_022001	CTG	2	6	12454	12459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239184
74	NC_022001	CGA	2	6	12501	12506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239184
75	NC_022001	CTT	2	6	12579	12584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529239184
76	NC_022001	TCT	2	6	12603	12608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529239184
77	NC_022001	ACC	2	6	13087	13092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529239185
78	NC_022001	GTC	2	6	13096	13101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239185
79	NC_022001	GGA	2	6	13111	13116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529239185
80	NC_022001	CGT	2	6	13176	13181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239185
81	NC_022001	CTG	3	9	13198	13206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239185
82	NC_022001	CCA	2	6	13253	13258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529239185
83	NC_022001	AGC	2	6	13481	13486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239186
84	NC_022001	CGG	2	6	13555	13560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239186
85	NC_022001	GGT	2	6	13672	13677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529239186
86	NC_022001	GCT	2	6	13679	13684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239186
87	NC_022001	CTT	2	6	13885	13890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529239186
88	NC_022001	AGC	2	6	13949	13954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239186
89	NC_022001	TCG	2	6	13958	13963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239186
90	NC_022001	TTC	2	6	14024	14029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529239186
91	NC_022001	CTC	2	6	14056	14061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239186
92	NC_022001	GCC	2	6	14106	14111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239186
93	NC_022001	CTT	2	6	14178	14183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529239186
94	NC_022001	CAG	2	6	14314	14319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239186
95	NC_022001	CCA	2	6	14331	14336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529239186
96	NC_022001	CGA	2	6	14382	14387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239186
97	NC_022001	GCC	2	6	14513	14518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239186
98	NC_022001	CTC	2	6	14554	14559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239186
99	NC_022001	GCT	2	6	14595	14600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239186
100	NC_022001	CGT	2	6	14673	14678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239186
101	NC_022001	GCC	2	6	14822	14827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239187
102	NC_022001	GTA	2	6	14942	14947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529239187
103	NC_022001	GTC	2	6	15029	15034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239187
104	NC_022001	TCT	2	6	15115	15120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529239187
105	NC_022001	GTG	2	6	15159	15164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529239187
106	NC_022001	CGG	2	6	15274	15279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239187
107	NC_022001	CGT	2	6	15448	15453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239187
108	NC_022001	GTC	2	6	15455	15460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239187
109	NC_022001	GCT	2	6	15499	15504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239187
110	NC_022001	GAA	2	6	15519	15524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529239187
111	NC_022001	TCC	2	6	15531	15536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239187
112	NC_022001	GCT	2	6	15613	15618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239187
113	NC_022001	CAG	2	6	15674	15679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239187
114	NC_022001	CCG	2	6	15729	15734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239187
115	NC_022001	CTC	2	6	15746	15751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239187
116	NC_022001	CGA	2	6	15841	15846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239187
117	NC_022001	CTG	2	6	15903	15908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239187
118	NC_022001	CCA	2	6	15930	15935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529239187
119	NC_022001	CGG	3	9	15992	16000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239187
120	NC_022001	CTT	2	6	16022	16027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529239187
121	NC_022001	TCC	2	6	16426	16431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239188
122	NC_022001	TCA	2	6	16432	16437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529239188
123	NC_022001	GCC	3	9	16446	16454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239188
124	NC_022001	CAG	2	6	17076	17081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239189
125	NC_022001	CGA	2	6	17129	17134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239189
126	NC_022001	CAG	2	6	17148	17153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239189
127	NC_022001	CAT	2	6	17187	17192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529239189
128	NC_022001	TGC	2	6	17333	17338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239189
129	NC_022001	GCG	2	6	17355	17360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239189
130	NC_022001	GAC	2	6	17382	17387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239189
131	NC_022001	CCT	2	6	17396	17401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239189
132	NC_022001	GGC	2	6	17403	17408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239189
133	NC_022001	GGC	2	6	17541	17546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239189
134	NC_022001	GAT	2	6	17547	17552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529239189
135	NC_022001	CGG	2	6	17561	17566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239189
136	NC_022001	GGC	2	6	17680	17685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239190
137	NC_022001	CTT	2	6	17698	17703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529239190
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139	NC_022001	TGC	2	6	17733	17738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239190
140	NC_022001	GGT	2	6	17785	17790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529239190
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143	NC_022001	TTC	2	6	17885	17890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529239190
144	NC_022001	GAC	2	6	17912	17917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239190
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146	NC_022001	TTC	2	6	17963	17968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529239190
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148	NC_022001	CCA	2	6	17979	17984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529239190
149	NC_022001	AGC	2	6	17987	17992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239190
150	NC_022001	TCG	2	6	18017	18022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239190
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152	NC_022001	GCA	2	6	18120	18125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239190
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156	NC_022001	GGC	2	6	18316	18321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239190
157	NC_022001	CAG	2	6	18328	18333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239190
158	NC_022001	GCG	2	6	18457	18462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239190
159	NC_022001	CGG	2	6	18519	18524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239190
160	NC_022001	GTC	2	6	18530	18535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239190
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220	NC_022001	GCC	2	6	23233	23238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239197
221	NC_022001	GTC	2	6	23259	23264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239197
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237	NC_022001	CCT	2	6	24298	24303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239198
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239	NC_022001	TCC	2	6	24399	24404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239198
240	NC_022001	AGA	2	6	24453	24458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529239198
241	NC_022001	TGC	2	6	24507	24512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239198
242	NC_022001	GCA	2	6	24531	24536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239198
243	NC_022001	GGC	2	6	24903	24908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239199
244	NC_022001	TAA	2	6	24977	24982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529239199
245	NC_022001	CCT	2	6	25046	25051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239199
246	NC_022001	GCC	2	6	25101	25106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239199
247	NC_022001	GAG	2	6	26025	26030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529239200
248	NC_022001	GCC	2	6	26074	26079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239200
249	NC_022001	ACC	2	6	26104	26109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529239200
250	NC_022001	ATC	2	6	26118	26123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529239200
251	NC_022001	CAC	2	6	26244	26249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529239201
252	NC_022001	CCG	2	6	26300	26305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239201
253	NC_022001	GGC	2	6	26354	26359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239201
254	NC_022001	ACC	2	6	26364	26369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529239201
255	NC_022001	CCA	2	6	26383	26388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529239201
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283	NC_022001	GAC	2	6	28331	28336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239205
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373	NC_022001	CGC	2	6	32940	32945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239209
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376	NC_022001	CCG	3	9	33050	33058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239209
377	NC_022001	GAC	2	6	33079	33084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239209
378	NC_022001	CCA	2	6	33092	33097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529239209
379	NC_022001	CGG	2	6	33111	33116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239209
380	NC_022001	ACC	2	6	33133	33138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529239209
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383	NC_022001	GGC	2	6	33292	33297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239210
384	NC_022001	CGC	2	6	33385	33390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239210
385	NC_022001	CGC	2	6	33403	33408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239210
386	NC_022001	GCC	2	6	33458	33463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239210
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389	NC_022001	TCA	2	6	33567	33572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529239210
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392	NC_022001	ATC	2	6	33698	33703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529239210
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404	NC_022001	CCT	2	6	34231	34236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239210
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494	NC_022001	GGC	3	9	38615	38623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239213
495	NC_022001	TGC	2	6	38708	38713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239213
496	NC_022001	CAC	2	6	38780	38785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529239213
497	NC_022001	TGA	2	6	38868	38873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529239213
498	NC_022001	AGA	2	6	39001	39006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529239213
499	NC_022001	CGC	2	6	39040	39045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239213
500	NC_022001	GAC	3	9	39090	39098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239213

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