MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Streptomyces collinus Tu 365 plasmid pSCO1

Total Repeats: 184

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022001	GA	3	6	555	560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022001	GT	3	6	823	828	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022001	CT	4	8	1500	1507	0 %	50 %	0 %	50 %	529239177
4	NC_022001	TG	4	8	1922	1929	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022001	CG	3	6	2405	2410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_022001	CG	3	6	2591	2596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_022001	GA	3	6	2876	2881	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022001	CG	3	6	3438	3443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_022001	GC	3	6	3628	3633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_022001	CA	3	6	4384	4389	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_022001	CG	3	6	4911	4916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_022001	AC	3	6	5264	5269	50 %	0 %	0 %	50 %	529239179
13	NC_022001	GC	3	6	5379	5384	0 %	0 %	50 %	50 %	529239179
14	NC_022001	CG	3	6	6350	6355	0 %	0 %	50 %	50 %	529239180
15	NC_022001	CG	3	6	6435	6440	0 %	0 %	50 %	50 %	529239180
16	NC_022001	GC	3	6	6444	6449	0 %	0 %	50 %	50 %	529239180
17	NC_022001	AC	3	6	6857	6862	50 %	0 %	0 %	50 %	529239180
18	NC_022001	CA	3	6	6943	6948	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_022001	GA	3	6	7617	7622	50 %	0 %	50 %	0 %	529239181
20	NC_022001	GC	3	6	8425	8430	0 %	0 %	50 %	50 %	529239182
21	NC_022001	CG	3	6	9372	9377	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_022001	TC	3	6	9388	9393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_022001	CG	3	6	9405	9410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_022001	GC	4	8	9646	9653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_022001	GC	3	6	9697	9702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_022001	CG	3	6	9711	9716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_022001	GA	3	6	10275	10280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022001	TG	3	6	11353	11358	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022001	CT	4	8	12105	12112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_022001	TC	3	6	12429	12434	0 %	50 %	0 %	50 %	529239184
31	NC_022001	CG	3	6	14212	14217	0 %	0 %	50 %	50 %	529239186
32	NC_022001	TG	3	6	14790	14795	0 %	50 %	50 %	0 %	529239187
33	NC_022001	GC	3	6	14865	14870	0 %	0 %	50 %	50 %	529239187
34	NC_022001	GC	3	6	15354	15359	0 %	0 %	50 %	50 %	529239187
35	NC_022001	CT	3	6	15414	15419	0 %	50 %	0 %	50 %	529239187
36	NC_022001	CG	3	6	15663	15668	0 %	0 %	50 %	50 %	529239187
37	NC_022001	CA	3	6	15957	15962	50 %	0 %	0 %	50 %	529239187
38	NC_022001	GC	3	6	16093	16098	0 %	0 %	50 %	50 %	529239187
39	NC_022001	CG	4	8	16105	16112	0 %	0 %	50 %	50 %	529239187
40	NC_022001	CG	3	6	16470	16475	0 %	0 %	50 %	50 %	529239188
41	NC_022001	GC	3	6	18211	18216	0 %	0 %	50 %	50 %	529239190
42	NC_022001	GC	3	6	18253	18258	0 %	0 %	50 %	50 %	529239190
43	NC_022001	AC	3	6	18796	18801	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_022001	TC	6	12	20114	20125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_022001	CG	3	6	20172	20177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_022001	GA	3	6	20184	20189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022001	GA	3	6	20388	20393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022001	CG	3	6	20542	20547	0 %	0 %	50 %	50 %	529239193
49	NC_022001	GA	3	6	20553	20558	50 %	0 %	50 %	0 %	529239193
50	NC_022001	CG	3	6	21730	21735	0 %	0 %	50 %	50 %	529239195
51	NC_022001	GC	3	6	21873	21878	0 %	0 %	50 %	50 %	529239195
52	NC_022001	GC	3	6	21927	21932	0 %	0 %	50 %	50 %	529239195
53	NC_022001	GC	3	6	22366	22371	0 %	0 %	50 %	50 %	529239196
54	NC_022001	CG	3	6	22536	22541	0 %	0 %	50 %	50 %	529239196
55	NC_022001	GC	3	6	22808	22813	0 %	0 %	50 %	50 %	529239196
56	NC_022001	GC	3	6	22984	22989	0 %	0 %	50 %	50 %	529239196
57	NC_022001	GC	3	6	23241	23246	0 %	0 %	50 %	50 %	529239197
58	NC_022001	CG	3	6	23294	23299	0 %	0 %	50 %	50 %	529239197
59	NC_022001	CG	3	6	23551	23556	0 %	0 %	50 %	50 %	529239197
60	NC_022001	GC	3	6	23588	23593	0 %	0 %	50 %	50 %	529239197
61	NC_022001	GC	3	6	24330	24335	0 %	0 %	50 %	50 %	529239198
62	NC_022001	GC	3	6	24352	24357	0 %	0 %	50 %	50 %	529239198
63	NC_022001	GC	3	6	24465	24470	0 %	0 %	50 %	50 %	529239198
64	NC_022001	CA	3	6	24823	24828	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_022001	AC	4	8	25216	25223	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_022001	CT	3	6	25427	25432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_022001	GT	3	6	25514	25519	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022001	TC	3	6	25520	25525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_022001	AC	3	6	25731	25736	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_022001	GA	3	6	25981	25986	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022001	GC	4	8	26741	26748	0 %	0 %	50 %	50 %	529239201
72	NC_022001	CG	3	6	26975	26980	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_022001	GC	3	6	27648	27653	0 %	0 %	50 %	50 %	529239203
74	NC_022001	CG	3	6	27704	27709	0 %	0 %	50 %	50 %	529239203
75	NC_022001	GC	3	6	28530	28535	0 %	0 %	50 %	50 %	529239205
76	NC_022001	GC	3	6	28581	28586	0 %	0 %	50 %	50 %	529239205
77	NC_022001	CG	4	8	28974	28981	0 %	0 %	50 %	50 %	529239205
78	NC_022001	GC	3	6	29147	29152	0 %	0 %	50 %	50 %	529239205
79	NC_022001	CG	3	6	29324	29329	0 %	0 %	50 %	50 %	529239205
80	NC_022001	AC	3	6	30119	30124	50 %	0 %	0 %	50 %	529239205
81	NC_022001	CG	3	6	30453	30458	0 %	0 %	50 %	50 %	529239205
82	NC_022001	CA	3	6	30536	30541	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_022001	GC	4	8	30921	30928	0 %	0 %	50 %	50 %	529239206
84	NC_022001	GC	3	6	34440	34445	0 %	0 %	50 %	50 %	529239210
85	NC_022001	GC	3	6	35681	35686	0 %	0 %	50 %	50 %	529239211
86	NC_022001	GC	3	6	35688	35693	0 %	0 %	50 %	50 %	529239211
87	NC_022001	GC	3	6	35850	35855	0 %	0 %	50 %	50 %	529239211
88	NC_022001	TC	3	6	36203	36208	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_022001	CG	3	6	37487	37492	0 %	0 %	50 %	50 %	529239213
90	NC_022001	GC	3	6	37549	37554	0 %	0 %	50 %	50 %	529239213
91	NC_022001	GC	3	6	37563	37568	0 %	0 %	50 %	50 %	529239213
92	NC_022001	GT	3	6	37876	37881	0 %	50 %	50 %	0 %	529239213
93	NC_022001	CG	3	6	38662	38667	0 %	0 %	50 %	50 %	529239213
94	NC_022001	CA	3	6	39492	39497	50 %	0 %	0 %	50 %	529239213
95	NC_022001	GT	3	6	41183	41188	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022001	CT	3	6	41922	41927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_022001	GC	3	6	42750	42755	0 %	0 %	50 %	50 %	529239217
98	NC_022001	GC	3	6	43052	43057	0 %	0 %	50 %	50 %	529239218
99	NC_022001	GC	3	6	44658	44663	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_022001	GC	3	6	45066	45071	0 %	0 %	50 %	50 %	529239219
101	NC_022001	CT	3	6	45269	45274	0 %	50 %	0 %	50 %	529239219
102	NC_022001	CG	3	6	45577	45582	0 %	0 %	50 %	50 %	529239219
103	NC_022001	CG	3	6	45711	45716	0 %	0 %	50 %	50 %	529239219
104	NC_022001	TC	3	6	46017	46022	0 %	50 %	0 %	50 %	529239219
105	NC_022001	CG	3	6	47516	47521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_022001	GC	4	8	48409	48416	0 %	0 %	50 %	50 %	529239221
107	NC_022001	CA	3	6	48958	48963	50 %	0 %	0 %	50 %	529239222
108	NC_022001	CT	3	6	49330	49335	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_022001	GC	3	6	50631	50636	0 %	0 %	50 %	50 %	529239223
110	NC_022001	CG	3	6	50967	50972	0 %	0 %	50 %	50 %	529239224
111	NC_022001	CG	3	6	51918	51923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_022001	CG	3	6	51965	51970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_022001	AG	3	6	52071	52076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022001	CG	3	6	52881	52886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_022001	CG	3	6	54174	54179	0 %	0 %	50 %	50 %	529239226
116	NC_022001	GC	3	6	54453	54458	0 %	0 %	50 %	50 %	529239226
117	NC_022001	CG	3	6	54467	54472	0 %	0 %	50 %	50 %	529239226
118	NC_022001	GC	3	6	54852	54857	0 %	0 %	50 %	50 %	529239226
119	NC_022001	GC	3	6	55126	55131	0 %	0 %	50 %	50 %	529239226
120	NC_022001	GC	3	6	55391	55396	0 %	0 %	50 %	50 %	529239226
121	NC_022001	GC	3	6	55828	55833	0 %	0 %	50 %	50 %	529239226
122	NC_022001	CG	3	6	55948	55953	0 %	0 %	50 %	50 %	529239226
123	NC_022001	GC	3	6	56295	56300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_022001	GC	3	6	56793	56798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_022001	CG	3	6	58259	58264	0 %	0 %	50 %	50 %	529239228
126	NC_022001	TG	3	6	58813	58818	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022001	GC	3	6	59900	59905	0 %	0 %	50 %	50 %	529239230
128	NC_022001	GT	3	6	60181	60186	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022001	CG	3	6	61183	61188	0 %	0 %	50 %	50 %	529239231
130	NC_022001	CA	3	6	61555	61560	50 %	0 %	0 %	50 %	529239231
131	NC_022001	CG	3	6	61742	61747	0 %	0 %	50 %	50 %	529239232
132	NC_022001	CG	3	6	61925	61930	0 %	0 %	50 %	50 %	529239232
133	NC_022001	CG	3	6	62916	62921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_022001	GC	4	8	63029	63036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_022001	CG	3	6	63598	63603	0 %	0 %	50 %	50 %	529239233
136	NC_022001	GC	4	8	64794	64801	0 %	0 %	50 %	50 %	529239233
137	NC_022001	TG	3	6	64963	64968	0 %	50 %	50 %	0 %	529239233
138	NC_022001	CG	3	6	64996	65001	0 %	0 %	50 %	50 %	529239233
139	NC_022001	GC	3	6	65403	65408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_022001	AG	3	6	66553	66558	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022001	GC	3	6	66889	66894	0 %	0 %	50 %	50 %	529239235
142	NC_022001	GC	3	6	66919	66924	0 %	0 %	50 %	50 %	529239235
143	NC_022001	GC	3	6	67424	67429	0 %	0 %	50 %	50 %	529239235
144	NC_022001	CG	3	6	67662	67667	0 %	0 %	50 %	50 %	529239235
145	NC_022001	GC	3	6	68317	68322	0 %	0 %	50 %	50 %	529239236
146	NC_022001	GC	3	6	68607	68612	0 %	0 %	50 %	50 %	529239237
147	NC_022001	GC	4	8	68869	68876	0 %	0 %	50 %	50 %	529239237
148	NC_022001	GC	3	6	69782	69787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_022001	GC	3	6	69811	69816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_022001	GC	3	6	70369	70374	0 %	0 %	50 %	50 %	529239241
151	NC_022001	CG	3	6	70474	70479	0 %	0 %	50 %	50 %	529239241
152	NC_022001	GC	3	6	70618	70623	0 %	0 %	50 %	50 %	529239242
153	NC_022001	GC	3	6	70777	70782	0 %	0 %	50 %	50 %	529239242
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155	NC_022001	GC	3	6	71869	71874	0 %	0 %	50 %	50 %	529239243
156	NC_022001	CG	3	6	72300	72305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
157	NC_022001	CG	3	6	72376	72381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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169	NC_022001	CT	3	6	75994	75999	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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184	NC_022001	CG	3	6	85015	85020	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.