MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Streptomyces collinus Tu 365 plasmid pSCO1

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022001	CT	4	8	1500	1507	0 %	50 %	0 %	50 %	529239177
2	NC_022001	AC	3	6	5264	5269	50 %	0 %	0 %	50 %	529239179
3	NC_022001	GC	3	6	5379	5384	0 %	0 %	50 %	50 %	529239179
4	NC_022001	CG	3	6	6350	6355	0 %	0 %	50 %	50 %	529239180
5	NC_022001	CG	3	6	6435	6440	0 %	0 %	50 %	50 %	529239180
6	NC_022001	GC	3	6	6444	6449	0 %	0 %	50 %	50 %	529239180
7	NC_022001	AC	3	6	6857	6862	50 %	0 %	0 %	50 %	529239180
8	NC_022001	GA	3	6	7617	7622	50 %	0 %	50 %	0 %	529239181
9	NC_022001	GC	3	6	8425	8430	0 %	0 %	50 %	50 %	529239182
10	NC_022001	TC	3	6	12429	12434	0 %	50 %	0 %	50 %	529239184
11	NC_022001	CG	3	6	14212	14217	0 %	0 %	50 %	50 %	529239186
12	NC_022001	TG	3	6	14790	14795	0 %	50 %	50 %	0 %	529239187
13	NC_022001	GC	3	6	14865	14870	0 %	0 %	50 %	50 %	529239187
14	NC_022001	GC	3	6	15354	15359	0 %	0 %	50 %	50 %	529239187
15	NC_022001	CT	3	6	15414	15419	0 %	50 %	0 %	50 %	529239187
16	NC_022001	CG	3	6	15663	15668	0 %	0 %	50 %	50 %	529239187
17	NC_022001	CA	3	6	15957	15962	50 %	0 %	0 %	50 %	529239187
18	NC_022001	GC	3	6	16093	16098	0 %	0 %	50 %	50 %	529239187
19	NC_022001	CG	4	8	16105	16112	0 %	0 %	50 %	50 %	529239187
20	NC_022001	CG	3	6	16470	16475	0 %	0 %	50 %	50 %	529239188
21	NC_022001	GC	3	6	18211	18216	0 %	0 %	50 %	50 %	529239190
22	NC_022001	GC	3	6	18253	18258	0 %	0 %	50 %	50 %	529239190
23	NC_022001	CG	3	6	20542	20547	0 %	0 %	50 %	50 %	529239193
24	NC_022001	GA	3	6	20553	20558	50 %	0 %	50 %	0 %	529239193
25	NC_022001	CG	3	6	21730	21735	0 %	0 %	50 %	50 %	529239195
26	NC_022001	GC	3	6	21873	21878	0 %	0 %	50 %	50 %	529239195
27	NC_022001	GC	3	6	21927	21932	0 %	0 %	50 %	50 %	529239195
28	NC_022001	GC	3	6	22366	22371	0 %	0 %	50 %	50 %	529239196
29	NC_022001	CG	3	6	22536	22541	0 %	0 %	50 %	50 %	529239196
30	NC_022001	GC	3	6	22808	22813	0 %	0 %	50 %	50 %	529239196
31	NC_022001	GC	3	6	22984	22989	0 %	0 %	50 %	50 %	529239196
32	NC_022001	GC	3	6	23241	23246	0 %	0 %	50 %	50 %	529239197
33	NC_022001	CG	3	6	23294	23299	0 %	0 %	50 %	50 %	529239197
34	NC_022001	CG	3	6	23551	23556	0 %	0 %	50 %	50 %	529239197
35	NC_022001	GC	3	6	23588	23593	0 %	0 %	50 %	50 %	529239197
36	NC_022001	GC	3	6	24330	24335	0 %	0 %	50 %	50 %	529239198
37	NC_022001	GC	3	6	24352	24357	0 %	0 %	50 %	50 %	529239198
38	NC_022001	GC	3	6	24465	24470	0 %	0 %	50 %	50 %	529239198
39	NC_022001	GC	4	8	26741	26748	0 %	0 %	50 %	50 %	529239201
40	NC_022001	GC	3	6	27648	27653	0 %	0 %	50 %	50 %	529239203
41	NC_022001	CG	3	6	27704	27709	0 %	0 %	50 %	50 %	529239203
42	NC_022001	GC	3	6	28530	28535	0 %	0 %	50 %	50 %	529239205
43	NC_022001	GC	3	6	28581	28586	0 %	0 %	50 %	50 %	529239205
44	NC_022001	CG	4	8	28974	28981	0 %	0 %	50 %	50 %	529239205
45	NC_022001	GC	3	6	29147	29152	0 %	0 %	50 %	50 %	529239205
46	NC_022001	CG	3	6	29324	29329	0 %	0 %	50 %	50 %	529239205
47	NC_022001	AC	3	6	30119	30124	50 %	0 %	0 %	50 %	529239205
48	NC_022001	CG	3	6	30453	30458	0 %	0 %	50 %	50 %	529239205
49	NC_022001	GC	4	8	30921	30928	0 %	0 %	50 %	50 %	529239206
50	NC_022001	GC	3	6	34440	34445	0 %	0 %	50 %	50 %	529239210
51	NC_022001	GC	3	6	35681	35686	0 %	0 %	50 %	50 %	529239211
52	NC_022001	GC	3	6	35688	35693	0 %	0 %	50 %	50 %	529239211
53	NC_022001	GC	3	6	35850	35855	0 %	0 %	50 %	50 %	529239211
54	NC_022001	CG	3	6	37487	37492	0 %	0 %	50 %	50 %	529239213
55	NC_022001	GC	3	6	37549	37554	0 %	0 %	50 %	50 %	529239213
56	NC_022001	GC	3	6	37563	37568	0 %	0 %	50 %	50 %	529239213
57	NC_022001	GT	3	6	37876	37881	0 %	50 %	50 %	0 %	529239213
58	NC_022001	CG	3	6	38662	38667	0 %	0 %	50 %	50 %	529239213
59	NC_022001	CA	3	6	39492	39497	50 %	0 %	0 %	50 %	529239213
60	NC_022001	GC	3	6	42750	42755	0 %	0 %	50 %	50 %	529239217
61	NC_022001	GC	3	6	43052	43057	0 %	0 %	50 %	50 %	529239218
62	NC_022001	GC	3	6	45066	45071	0 %	0 %	50 %	50 %	529239219
63	NC_022001	CT	3	6	45269	45274	0 %	50 %	0 %	50 %	529239219
64	NC_022001	CG	3	6	45577	45582	0 %	0 %	50 %	50 %	529239219
65	NC_022001	CG	3	6	45711	45716	0 %	0 %	50 %	50 %	529239219
66	NC_022001	TC	3	6	46017	46022	0 %	50 %	0 %	50 %	529239219
67	NC_022001	GC	4	8	48409	48416	0 %	0 %	50 %	50 %	529239221
68	NC_022001	CA	3	6	48958	48963	50 %	0 %	0 %	50 %	529239222
69	NC_022001	GC	3	6	50631	50636	0 %	0 %	50 %	50 %	529239223
70	NC_022001	CG	3	6	50967	50972	0 %	0 %	50 %	50 %	529239224
71	NC_022001	CG	3	6	54174	54179	0 %	0 %	50 %	50 %	529239226
72	NC_022001	GC	3	6	54453	54458	0 %	0 %	50 %	50 %	529239226
73	NC_022001	CG	3	6	54467	54472	0 %	0 %	50 %	50 %	529239226
74	NC_022001	GC	3	6	54852	54857	0 %	0 %	50 %	50 %	529239226
75	NC_022001	GC	3	6	55126	55131	0 %	0 %	50 %	50 %	529239226
76	NC_022001	GC	3	6	55391	55396	0 %	0 %	50 %	50 %	529239226
77	NC_022001	GC	3	6	55828	55833	0 %	0 %	50 %	50 %	529239226
78	NC_022001	CG	3	6	55948	55953	0 %	0 %	50 %	50 %	529239226
79	NC_022001	CG	3	6	58259	58264	0 %	0 %	50 %	50 %	529239228
80	NC_022001	GC	3	6	59900	59905	0 %	0 %	50 %	50 %	529239230
81	NC_022001	CG	3	6	61183	61188	0 %	0 %	50 %	50 %	529239231
82	NC_022001	CA	3	6	61555	61560	50 %	0 %	0 %	50 %	529239231
83	NC_022001	CG	3	6	61742	61747	0 %	0 %	50 %	50 %	529239232
84	NC_022001	CG	3	6	61925	61930	0 %	0 %	50 %	50 %	529239232
85	NC_022001	CG	3	6	63598	63603	0 %	0 %	50 %	50 %	529239233
86	NC_022001	GC	4	8	64794	64801	0 %	0 %	50 %	50 %	529239233
87	NC_022001	TG	3	6	64963	64968	0 %	50 %	50 %	0 %	529239233
88	NC_022001	CG	3	6	64996	65001	0 %	0 %	50 %	50 %	529239233
89	NC_022001	GC	3	6	66889	66894	0 %	0 %	50 %	50 %	529239235
90	NC_022001	GC	3	6	66919	66924	0 %	0 %	50 %	50 %	529239235
91	NC_022001	GC	3	6	67424	67429	0 %	0 %	50 %	50 %	529239235
92	NC_022001	CG	3	6	67662	67667	0 %	0 %	50 %	50 %	529239235
93	NC_022001	GC	3	6	68317	68322	0 %	0 %	50 %	50 %	529239236
94	NC_022001	GC	3	6	68607	68612	0 %	0 %	50 %	50 %	529239237
95	NC_022001	GC	4	8	68869	68876	0 %	0 %	50 %	50 %	529239237
96	NC_022001	GC	3	6	70369	70374	0 %	0 %	50 %	50 %	529239241
97	NC_022001	CG	3	6	70474	70479	0 %	0 %	50 %	50 %	529239241
98	NC_022001	GC	3	6	70618	70623	0 %	0 %	50 %	50 %	529239242
99	NC_022001	GC	3	6	70777	70782	0 %	0 %	50 %	50 %	529239242
100	NC_022001	CG	3	6	71785	71790	0 %	0 %	50 %	50 %	529239243
101	NC_022001	GC	3	6	71869	71874	0 %	0 %	50 %	50 %	529239243
102	NC_022001	GC	3	6	73344	73349	0 %	0 %	50 %	50 %	529239245
103	NC_022001	CG	4	8	73354	73361	0 %	0 %	50 %	50 %	529239245
104	NC_022001	GC	3	6	73838	73843	0 %	0 %	50 %	50 %	529239245
105	NC_022001	AC	3	6	75190	75195	50 %	0 %	0 %	50 %	529239247
106	NC_022001	GT	3	6	75234	75239	0 %	50 %	50 %	0 %	529239247
107	NC_022001	GC	3	6	75745	75750	0 %	0 %	50 %	50 %	529239248
108	NC_022001	GC	3	6	75877	75882	0 %	0 %	50 %	50 %	529239249
109	NC_022001	GC	3	6	76059	76064	0 %	0 %	50 %	50 %	529239250
110	NC_022001	CG	3	6	76446	76451	0 %	0 %	50 %	50 %	529239251
111	NC_022001	TG	3	6	77654	77659	0 %	50 %	50 %	0 %	529239252
112	NC_022001	TG	3	6	77873	77878	0 %	50 %	50 %	0 %	529239252
113	NC_022001	TG	3	6	79382	79387	0 %	50 %	50 %	0 %	529239252
114	NC_022001	CA	3	6	80877	80882	50 %	0 %	0 %	50 %	529239252
115	NC_022001	GC	3	6	81406	81411	0 %	0 %	50 %	50 %	529239253
116	NC_022001	GC	3	6	81510	81515	0 %	0 %	50 %	50 %	529239253
117	NC_022001	CG	3	6	82434	82439	0 %	0 %	50 %	50 %	529239254
118	NC_022001	GC	3	6	83018	83023	0 %	0 %	50 %	50 %	529239254
119	NC_022001	CG	3	6	83878	83883	0 %	0 %	50 %	50 %	529239254
120	NC_022001	CA	3	6	84025	84030	50 %	0 %	0 %	50 %	529239254
121	NC_022001	AG	3	6	84460	84465	50 %	0 %	50 %	0 %	529239254

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.