MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Enterococcus faecium Aus0085 plasmid p5

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021996	TTG	2	6	47	52	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529247575
2	NC_021996	TAT	2	6	73	78	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529247575
3	NC_021996	ATG	2	6	89	94	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529247575
4	NC_021996	TAA	2	6	162	167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529247575
5	NC_021996	GTT	2	6	177	182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529247575
6	NC_021996	TGA	2	6	372	377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529247575
7	NC_021996	TTA	2	6	380	385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529247575
8	NC_021996	TAA	2	6	498	503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529247575
9	NC_021996	AGA	2	6	518	523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529247575
10	NC_021996	TGG	2	6	556	561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529247575
11	NC_021996	CTG	2	6	656	661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529247575
12	NC_021996	ATG	2	6	682	687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529247575
13	NC_021996	AAC	2	6	699	704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529247575
14	NC_021996	ATT	2	6	713	718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529247575
15	NC_021996	ATG	2	6	782	787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529247575
16	NC_021996	AGG	2	6	881	886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529247575
17	NC_021996	GTT	2	6	963	968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529235716
18	NC_021996	ATA	2	6	1036	1041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529235716
19	NC_021996	ATT	2	6	1056	1061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529235716
20	NC_021996	AGT	2	6	1104	1109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529235716
21	NC_021996	TGA	2	6	1161	1166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529235717
22	NC_021996	TGG	2	6	1199	1204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529235717
23	NC_021996	ATT	2	6	1295	1300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529235717
24	NC_021996	ATG	2	6	1345	1350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529235717
25	NC_021996	TTC	2	6	1389	1394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529235717
26	NC_021996	AGA	2	6	1437	1442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529235717
27	NC_021996	AAG	2	6	1580	1585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529235718
28	NC_021996	TGA	2	6	1698	1703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529235718
29	NC_021996	GGT	2	6	1712	1717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529235718
30	NC_021996	TGA	2	6	1776	1781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529235718
31	NC_021996	GAA	2	6	2163	2168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529235719
32	NC_021996	ATA	2	6	2183	2188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529235719
33	NC_021996	GAT	2	6	2443	2448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529235719
34	NC_021996	TTC	2	6	2472	2477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529235719
35	NC_021996	ACA	2	6	2493	2498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529235719
36	NC_021996	AGC	2	6	2675	2680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529235719
37	NC_021996	TAA	2	6	2688	2693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529235719
38	NC_021996	CAA	2	6	2704	2709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529235719
39	NC_021996	AAT	2	6	2749	2754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529235719
40	NC_021996	AAG	2	6	2765	2770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529235719
41	NC_021996	CAA	2	6	2829	2834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529235719
42	NC_021996	TGG	2	6	2978	2983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529235719
43	NC_021996	GAA	2	6	3004	3009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529235719
44	NC_021996	CAA	2	6	3283	3288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529235719
45	NC_021996	GTT	2	6	3307	3312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529235719
46	NC_021996	CGG	2	6	3355	3360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529235719
47	NC_021996	CAG	2	6	3490	3495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529235719

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.