MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Enterococcus faecium Aus0085 plasmid p2

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021995	TCTAT	2	10	558	567	20 %	60 %	0 %	20 %	529235636
2	NC_021995	CTTTT	3	15	5179	5193	0 %	80 %	0 %	20 %	529235643
3	NC_021995	TGATC	2	10	5225	5234	20 %	40 %	20 %	20 %	529235643
4	NC_021995	ATCAA	2	10	6313	6322	60 %	20 %	0 %	20 %	529235645
5	NC_021995	GATCA	2	10	7754	7763	40 %	20 %	20 %	20 %	529235646
6	NC_021995	ATCCA	2	10	10821	10830	40 %	20 %	0 %	40 %	529235651
7	NC_021995	ACAAA	2	10	11982	11991	80 %	0 %	0 %	20 %	529235651
8	NC_021995	CGAAA	2	10	16841	16850	60 %	0 %	20 %	20 %	529235657
9	NC_021995	GCTTA	2	10	18689	18698	20 %	40 %	20 %	20 %	529235658
10	NC_021995	ATTTT	2	10	20324	20333	20 %	80 %	0 %	0 %	529235658
11	NC_021995	AGTAC	2	10	21840	21849	40 %	20 %	20 %	20 %	529235659
12	NC_021995	AAAAG	2	10	24007	24016	80 %	0 %	20 %	0 %	529235660
13	NC_021995	AAGAA	2	10	30338	30347	80 %	0 %	20 %	0 %	529235669
14	NC_021995	TCAAA	2	10	32267	32276	60 %	20 %	0 %	20 %	529235672
15	NC_021995	GAAAG	2	10	33369	33378	60 %	0 %	40 %	0 %	529235673
16	NC_021995	GGAAT	2	10	33606	33615	40 %	20 %	40 %	0 %	529235673
17	NC_021995	AGATA	2	10	36140	36149	60 %	20 %	20 %	0 %	529235676
18	NC_021995	GAAAA	2	10	37081	37090	80 %	0 %	20 %	0 %	529235677
19	NC_021995	ACAAA	2	10	37661	37670	80 %	0 %	0 %	20 %	529235678
20	NC_021995	AATGG	2	10	39137	39146	40 %	20 %	40 %	0 %	529247572
21	NC_021995	AAAAG	2	10	41312	41321	80 %	0 %	20 %	0 %	529235680
22	NC_021995	AGAAA	2	10	41898	41907	80 %	0 %	20 %	0 %	529235680
23	NC_021995	ATCCA	2	10	42366	42375	40 %	20 %	0 %	40 %	529235680
24	NC_021995	GAAAA	2	10	42693	42702	80 %	0 %	20 %	0 %	529235680
25	NC_021995	AAGAA	2	10	42714	42723	80 %	0 %	20 %	0 %	529235680
26	NC_021995	TTAAA	2	10	43577	43586	60 %	40 %	0 %	0 %	529235682
27	NC_021995	AAAGC	2	10	44810	44819	60 %	0 %	20 %	20 %	529235684
28	NC_021995	CTTTA	2	10	45416	45425	20 %	60 %	0 %	20 %	529235685
29	NC_021995	ACACA	2	10	46270	46279	60 %	0 %	0 %	40 %	529235686
30	NC_021995	CGAAA	2	10	46829	46838	60 %	0 %	20 %	20 %	529235687
31	NC_021995	CTTTG	2	10	53486	53495	0 %	60 %	20 %	20 %	529235695
32	NC_021995	AAAAG	2	10	54372	54381	80 %	0 %	20 %	0 %	529235696
33	NC_021995	TTGTA	2	10	56255	56264	20 %	60 %	20 %	0 %	529235699
34	NC_021995	TCCAC	2	10	57448	57457	20 %	20 %	0 %	60 %	529235700
35	NC_021995	GATTA	2	10	58328	58337	40 %	40 %	20 %	0 %	529235701
36	NC_021995	TAAAT	2	10	58527	58536	60 %	40 %	0 %	0 %	529235701
37	NC_021995	AGCTC	2	10	59001	59010	20 %	20 %	20 %	40 %	529235702
38	NC_021995	CAAGA	2	10	59146	59155	60 %	0 %	20 %	20 %	529235702
39	NC_021995	TAAAC	2	10	59362	59371	60 %	20 %	0 %	20 %	529235703
40	NC_021995	TTTAT	2	10	60104	60113	20 %	80 %	0 %	0 %	529235704
41	NC_021995	GATTT	2	10	61145	61154	20 %	60 %	20 %	0 %	529235706
42	NC_021995	GGTAT	2	10	62071	62080	20 %	40 %	40 %	0 %	529235707
43	NC_021995	AAGCA	2	10	62419	62428	60 %	0 %	20 %	20 %	529235707
44	NC_021995	ATTAT	2	10	66226	66235	40 %	60 %	0 %	0 %	529235712
45	NC_021995	AAAAT	2	10	66959	66968	80 %	20 %	0 %	0 %	529235713

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.