MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Enterococcus faecium Aus0085 plasmid p2

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021995	AT	3	6	185	190	50 %	50 %	0 %	0 %	529235636
2	NC_021995	TA	3	6	854	859	50 %	50 %	0 %	0 %	529235636
3	NC_021995	AG	3	6	1287	1292	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021995	AT	3	6	2001	2006	50 %	50 %	0 %	0 %	529235637
5	NC_021995	TA	3	6	2714	2719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021995	GA	3	6	2896	2901	50 %	0 %	50 %	0 %	529235638
7	NC_021995	CA	3	6	3147	3152	50 %	0 %	0 %	50 %	529235639
8	NC_021995	AT	3	6	3982	3987	50 %	50 %	0 %	0 %	529247569
9	NC_021995	AT	3	6	4222	4227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021995	AC	3	6	5637	5642	50 %	0 %	0 %	50 %	529235644
11	NC_021995	AC	3	6	6075	6080	50 %	0 %	0 %	50 %	529235644
12	NC_021995	GT	3	6	6235	6240	0 %	50 %	50 %	0 %	529235645
13	NC_021995	GA	3	6	6769	6774	50 %	0 %	50 %	0 %	529235645
14	NC_021995	CA	3	6	7434	7439	50 %	0 %	0 %	50 %	529235646
15	NC_021995	AC	4	8	9478	9485	50 %	0 %	0 %	50 %	529247570
16	NC_021995	AC	3	6	9721	9726	50 %	0 %	0 %	50 %	529235649
17	NC_021995	TG	3	6	10292	10297	0 %	50 %	50 %	0 %	529235649
18	NC_021995	CA	3	6	12301	12306	50 %	0 %	0 %	50 %	529235651
19	NC_021995	CA	3	6	12314	12319	50 %	0 %	0 %	50 %	529235651
20	NC_021995	AT	3	6	16038	16043	50 %	50 %	0 %	0 %	529235655
21	NC_021995	AG	3	6	16879	16884	50 %	0 %	50 %	0 %	529235657
22	NC_021995	AT	3	6	17176	17181	50 %	50 %	0 %	0 %	529235657
23	NC_021995	AG	3	6	17362	17367	50 %	0 %	50 %	0 %	529235657
24	NC_021995	GA	3	6	17543	17548	50 %	0 %	50 %	0 %	529235657
25	NC_021995	AG	3	6	18445	18450	50 %	0 %	50 %	0 %	529235657
26	NC_021995	AT	3	6	20787	20792	50 %	50 %	0 %	0 %	529235658
27	NC_021995	TA	3	6	21325	21330	50 %	50 %	0 %	0 %	529235659
28	NC_021995	TG	3	6	25352	25357	0 %	50 %	50 %	0 %	529235663
29	NC_021995	CA	3	6	25879	25884	50 %	0 %	0 %	50 %	529235663
30	NC_021995	CA	3	6	27696	27701	50 %	0 %	0 %	50 %	529235664
31	NC_021995	GA	3	6	27879	27884	50 %	0 %	50 %	0 %	529235664
32	NC_021995	GT	3	6	28131	28136	0 %	50 %	50 %	0 %	529235664
33	NC_021995	AC	3	6	29157	29162	50 %	0 %	0 %	50 %	529235666
34	NC_021995	AT	3	6	29437	29442	50 %	50 %	0 %	0 %	529235666
35	NC_021995	AG	3	6	29797	29802	50 %	0 %	50 %	0 %	529235666
36	NC_021995	TA	4	8	30063	30070	50 %	50 %	0 %	0 %	529235668
37	NC_021995	GT	3	6	30197	30202	0 %	50 %	50 %	0 %	529235669
38	NC_021995	GT	3	6	30279	30284	0 %	50 %	50 %	0 %	529235669
39	NC_021995	TG	3	6	30608	30613	0 %	50 %	50 %	0 %	529235669
40	NC_021995	AT	3	6	30816	30821	50 %	50 %	0 %	0 %	529235669
41	NC_021995	TG	3	6	31730	31735	0 %	50 %	50 %	0 %	529235671
42	NC_021995	AC	3	6	31741	31746	50 %	0 %	0 %	50 %	529235671
43	NC_021995	AC	3	6	31753	31758	50 %	0 %	0 %	50 %	529235671
44	NC_021995	AT	3	6	32019	32024	50 %	50 %	0 %	0 %	529235671
45	NC_021995	AT	3	6	32188	32193	50 %	50 %	0 %	0 %	529235672
46	NC_021995	CA	3	6	32969	32974	50 %	0 %	0 %	50 %	529235673
47	NC_021995	TA	3	6	33578	33583	50 %	50 %	0 %	0 %	529235673
48	NC_021995	AG	3	6	33655	33660	50 %	0 %	50 %	0 %	529235673
49	NC_021995	AT	3	6	33714	33719	50 %	50 %	0 %	0 %	529235673
50	NC_021995	AG	3	6	33773	33778	50 %	0 %	50 %	0 %	529235673
51	NC_021995	CT	3	6	33803	33808	0 %	50 %	0 %	50 %	529235673
52	NC_021995	GT	3	6	34342	34347	0 %	50 %	50 %	0 %	529235674
53	NC_021995	GT	3	6	35962	35967	0 %	50 %	50 %	0 %	529235676
54	NC_021995	CA	3	6	36520	36525	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_021995	GA	3	6	36842	36847	50 %	0 %	50 %	0 %	529235677
56	NC_021995	CA	3	6	38089	38094	50 %	0 %	0 %	50 %	529235678
57	NC_021995	TG	3	6	38455	38460	0 %	50 %	50 %	0 %	529235678
58	NC_021995	GA	3	6	39665	39670	50 %	0 %	50 %	0 %	529247572
59	NC_021995	TG	3	6	39926	39931	0 %	50 %	50 %	0 %	529247572
60	NC_021995	AG	3	6	41888	41893	50 %	0 %	50 %	0 %	529235680
61	NC_021995	AT	3	6	42149	42154	50 %	50 %	0 %	0 %	529235680
62	NC_021995	TC	3	6	42334	42339	0 %	50 %	0 %	50 %	529235680
63	NC_021995	CG	3	6	42431	42436	0 %	0 %	50 %	50 %	529235680
64	NC_021995	CA	3	6	42772	42777	50 %	0 %	0 %	50 %	529235681
65	NC_021995	TG	3	6	43419	43424	0 %	50 %	50 %	0 %	529235682
66	NC_021995	GA	3	6	44489	44494	50 %	0 %	50 %	0 %	529235683
67	NC_021995	GT	3	6	44765	44770	0 %	50 %	50 %	0 %	529235684
68	NC_021995	AG	3	6	44826	44831	50 %	0 %	50 %	0 %	529235684
69	NC_021995	TC	3	6	45730	45735	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_021995	GC	3	6	45947	45952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021995	TG	3	6	47664	47669	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021995	GA	3	6	48007	48012	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021995	AT	3	6	48628	48633	50 %	50 %	0 %	0 %	529235691
74	NC_021995	TA	3	6	49602	49607	50 %	50 %	0 %	0 %	529235692
75	NC_021995	AT	3	6	49624	49629	50 %	50 %	0 %	0 %	529235692
76	NC_021995	AC	3	6	49707	49712	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_021995	AT	3	6	49856	49861	50 %	50 %	0 %	0 %	529235693
78	NC_021995	TG	3	6	50801	50806	0 %	50 %	50 %	0 %	529235693
79	NC_021995	AT	3	6	51085	51090	50 %	50 %	0 %	0 %	529235693
80	NC_021995	AT	3	6	51200	51205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021995	GT	3	6	51493	51498	0 %	50 %	50 %	0 %	529235694
82	NC_021995	AC	3	6	51646	51651	50 %	0 %	0 %	50 %	529235694
83	NC_021995	GA	3	6	52181	52186	50 %	0 %	50 %	0 %	529235694
84	NC_021995	TG	3	6	52441	52446	0 %	50 %	50 %	0 %	529235694
85	NC_021995	AT	3	6	52862	52867	50 %	50 %	0 %	0 %	529235695
86	NC_021995	AT	3	6	53435	53440	50 %	50 %	0 %	0 %	529235695
87	NC_021995	GA	3	6	53601	53606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021995	AT	3	6	54549	54554	50 %	50 %	0 %	0 %	529235696
89	NC_021995	AT	3	6	55101	55106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021995	TA	3	6	55398	55403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021995	AT	3	6	55432	55437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021995	GA	3	6	55873	55878	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021995	AT	3	6	58179	58184	50 %	50 %	0 %	0 %	529235701
94	NC_021995	AT	3	6	58582	58587	50 %	50 %	0 %	0 %	529235701
95	NC_021995	GA	3	6	58714	58719	50 %	0 %	50 %	0 %	529235701
96	NC_021995	AT	5	10	58775	58784	50 %	50 %	0 %	0 %	529235702
97	NC_021995	TA	3	6	58920	58925	50 %	50 %	0 %	0 %	529235702
98	NC_021995	AG	3	6	59223	59228	50 %	0 %	50 %	0 %	529235702
99	NC_021995	TA	3	6	59276	59281	50 %	50 %	0 %	0 %	529235703
100	NC_021995	TC	3	6	59769	59774	0 %	50 %	0 %	50 %	529235703
101	NC_021995	AT	3	6	59997	60002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021995	TA	3	6	60019	60024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021995	AC	3	6	60540	60545	50 %	0 %	0 %	50 %	529235705
104	NC_021995	TC	3	6	61689	61694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_021995	TA	3	6	62158	62163	50 %	50 %	0 %	0 %	529235707
106	NC_021995	TA	3	6	63582	63587	50 %	50 %	0 %	0 %	529235709
107	NC_021995	TA	5	10	63721	63730	50 %	50 %	0 %	0 %	529235709
108	NC_021995	GT	3	6	63812	63817	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021995	AT	3	6	64150	64155	50 %	50 %	0 %	0 %	529235710
110	NC_021995	GT	3	6	65444	65449	0 %	50 %	50 %	0 %	529235711
111	NC_021995	AT	4	8	65750	65757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021995	CA	3	6	65775	65780	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_021995	AG	3	6	66152	66157	50 %	0 %	50 %	0 %	529235712
114	NC_021995	AT	3	6	67232	67237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.