MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Enterococcus faecium Aus0085

Total Repeats: 157

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021994	ATAAAA	2	12	24836	24847	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021994	AATAAA	2	12	51396	51407	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021994	AATAAA	2	12	69673	69684	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021994	TAATTA	2	12	111160	111171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021994	TTTTAT	2	12	158315	158326	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021994	CGTATA	2	12	177122	177133	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_021994	ATTTTG	2	12	182632	182643	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021994	AGGATG	2	12	184574	184585	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021994	CAAATA	2	12	246341	246352	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_021994	GTTTTT	2	12	255274	255285	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021994	GAAAAA	2	12	272076	272087	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021994	AAAACA	2	12	277010	277021	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_021994	TGCTTC	2	12	352456	352467	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021994	TCCTTT	2	12	390046	390057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021994	AAAAAG	2	12	390334	390345	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021994	CATTTT	2	12	408734	408745	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_021994	TTTTAC	2	12	423624	423635	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_021994	ACTTAA	2	12	442391	442402	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_021994	ATTTAG	2	12	467587	467598	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021994	CAAGAA	2	12	468331	468342	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_021994	CATTCT	2	12	469487	469498	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021994	TAAAAT	2	12	474141	474152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021994	GAAAAA	2	12	534589	534600	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021994	CAAGAC	2	12	535177	535188	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021994	CATTTT	2	12	602314	602325	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021994	TTTTTA	2	12	606527	606538	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021994	TAAAAA	2	12	621236	621247	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021994	AAAATG	2	12	643180	643191	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021994	ATAGTT	2	12	670528	670539	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021994	ATTTTC	2	12	683346	683357	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_021994	ATTCTT	2	12	723592	723603	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_021994	AACGGT	2	12	801255	801266	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_021994	CTCTTT	2	12	880007	880018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021994	TATTAC	2	12	883232	883243	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_021994	GTATCA	2	12	888958	888969	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_021994	ATCAAA	2	12	938431	938442	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_021994	ACATTT	2	12	966113	966124	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_021994	AAAATG	2	12	978048	978059	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021994	CTTTTT	2	12	983065	983076	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_021994	TAAAAA	2	12	994499	994510	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021994	TTGAAG	2	12	1000576	1000587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021994	TAAAAA	2	12	1003309	1003320	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021994	TGATAG	2	12	1020619	1020630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021994	AAAATG	2	12	1056533	1056544	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021994	TAAATT	2	12	1066032	1066043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021994	TTAAAA	2	12	1066369	1066380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021994	AGGGTA	2	12	1074181	1074192	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021994	ATCAAA	2	12	1079427	1079438	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_021994	ACAGTA	2	12	1092918	1092929	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_021994	CATTTT	2	12	1104737	1104748	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_021994	AAAATG	2	12	1127002	1127013	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021994	TAACTC	2	12	1130732	1130743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021994	AAAAGA	2	12	1142963	1142974	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021994	TTCACT	2	12	1165594	1165605	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021994	GAAAAA	2	12	1165653	1165664	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021994	AAAATG	2	12	1178211	1178222	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021994	AAAATA	2	12	1233834	1233845	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021994	AAAATG	2	12	1240986	1240997	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021994	AGTACC	2	12	1281696	1281707	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021994	ATAAAA	2	12	1283881	1283892	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021994	TAAACT	2	12	1302227	1302238	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_021994	GAAAAC	2	12	1307879	1307890	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_021994	AAAATG	2	12	1312810	1312821	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021994	TGCTTC	2	12	1332410	1332421	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021994	AAAAGA	2	12	1337112	1337123	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021994	TTTTCG	2	12	1353177	1353188	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_021994	TCGGAT	2	12	1382937	1382948	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_021994	TAATAG	2	12	1383621	1383632	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021994	TTCTTT	2	12	1388117	1388128	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_021994	AGAATG	2	12	1416730	1416741	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021994	CTTTTT	2	12	1437968	1437979	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_021994	AAAGAA	2	12	1476429	1476440	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021994	ATTTTT	2	12	1484226	1484237	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021994	CATTTT	2	12	1537933	1537944	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_021994	AAATGA	2	12	1559529	1559540	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021994	AAACTC	2	12	1561855	1561866	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021994	TTTGAT	2	12	1564948	1564959	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021994	TCGTCC	2	12	1576332	1576343	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_021994	TTTTAT	2	12	1590010	1590021	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021994	TAAAAA	2	12	1646534	1646545	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021994	AAAAAG	2	12	1654896	1654907	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021994	AAAACT	2	12	1697721	1697732	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_021994	AAAAAG	2	12	1700036	1700047	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021994	TTTTCT	2	12	1726108	1726119	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_021994	CAAACT	2	12	1755496	1755507	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021994	CATTTT	2	12	1755821	1755832	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_021994	TATTTT	2	12	1767071	1767082	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021994	TCTTTT	2	12	1806255	1806266	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_021994	TTTATT	2	12	1818496	1818507	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021994	CTTTTT	2	12	1832855	1832866	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_021994	TATTCA	2	12	1834499	1834510	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_021994	AAAATG	2	12	1841284	1841295	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021994	AGAACA	2	12	1854730	1854741	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_021994	AAAAGT	2	12	1904720	1904731	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021994	AATTTT	2	12	1914426	1914437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021994	ACAAAT	2	12	1931556	1931567	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_021994	TAAAAA	2	12	1934196	1934207	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021994	CAAAAC	2	12	1936832	1936843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021994	TCACTA	2	12	1937837	1937848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021994	GTTTTT	2	12	2009508	2009519	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021994	CATATA	2	12	2009983	2009994	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_021994	TGCTTC	2	12	2079488	2079499	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021994	TGATTC	2	12	2086767	2086778	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_021994	CATTTT	2	12	2088068	2088079	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_021994	AAAAGC	2	12	2101107	2101118	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_021994	CATTTT	2	12	2109949	2109960	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_021994	AAAAGG	2	12	2126523	2126534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021994	ATTTTT	2	12	2173767	2173778	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021994	ACAAGA	2	12	2260878	2260889	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_021994	TCTTGC	2	12	2260900	2260911	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021994	ATCCTT	2	12	2268158	2268169	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021994	AAGAAA	2	12	2270158	2270169	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021994	TTTCTT	2	12	2270184	2270195	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_021994	TTATTT	2	12	2270385	2270396	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021994	TTTCGA	2	12	2283761	2283772	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_021994	TTTGAT	2	12	2316406	2316417	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021994	TAAGAA	2	12	2381905	2381916	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021994	AAAATG	2	12	2385525	2385536	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021994	CATTCT	2	12	2406349	2406360	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021994	AAAACA	2	12	2427585	2427596	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_021994	GAAGCA	2	12	2433575	2433586	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_021994	CATTTT	2	12	2446294	2446305	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_021994	TCACTA	2	12	2448197	2448208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021994	TGGTTC	2	12	2466188	2466199	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_021994	ACTTAT	2	12	2488638	2488649	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_021994	TTTTTA	2	12	2491787	2491798	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021994	TTTAAT	2	12	2498892	2498903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021994	TTCACC	2	12	2499852	2499863	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_021994	TGTTTT	2	12	2543746	2543757	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021994	GAAATA	2	12	2555846	2555857	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021994	TCGGGT	2	12	2584046	2584057	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_021994	TGATAT	2	12	2613314	2613325	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.