MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus 386B plasmid Apa386Bp5

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021993	TCA	2	6	52	57	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021993	CGG	2	6	106	111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021993	TCA	2	6	145	150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021993	TTC	2	6	162	167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021993	TGA	2	6	194	199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021993	GGA	2	6	209	214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021993	CTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021993	TGT	2	6	360	365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021993	GCT	2	6	453	458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021993	ATC	2	6	459	464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021993	AAT	2	6	465	470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021993	TTA	2	6	487	492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021993	TAT	2	6	501	506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021993	GAT	2	6	523	528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021993	ATT	2	6	534	539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021993	TCC	2	6	627	632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_021993	CCA	2	6	709	714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_021993	TGC	2	6	747	752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021993	CAA	2	6	761	766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021993	ATT	2	6	894	899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021993	AAT	2	6	935	940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021993	TTA	2	6	1013	1018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529232702
23	NC_021993	GCA	2	6	1024	1029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232702
24	NC_021993	ATC	2	6	1121	1126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232702
25	NC_021993	GGT	2	6	1211	1216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529232702
26	NC_021993	TCG	2	6	1299	1304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232702
27	NC_021993	GCT	2	6	1318	1323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232702
28	NC_021993	TGG	2	6	1362	1367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529232702
29	NC_021993	AAC	2	6	1470	1475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021993	CGG	2	6	1589	1594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021993	AGA	2	6	1796	1801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529232703
32	NC_021993	CCA	2	6	1814	1819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529232703
33	NC_021993	GCA	2	6	1825	1830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232703
34	NC_021993	GCG	2	6	1842	1847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232703
35	NC_021993	GCG	2	6	1903	1908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232703
36	NC_021993	GGC	2	6	1944	1949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232703
37	NC_021993	CAA	2	6	2070	2075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529232703
38	NC_021993	GCC	2	6	2284	2289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232703
39	NC_021993	CCG	2	6	2361	2366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232703
40	NC_021993	CCG	2	6	2451	2456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232703
41	NC_021993	GAA	2	6	2500	2505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529232703
42	NC_021993	GAA	2	6	2530	2535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529232703
43	NC_021993	CAT	2	6	2538	2543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232703
44	NC_021993	TTG	2	6	2567	2572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529232703
45	NC_021993	GAG	2	6	2602	2607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529232703
46	NC_021993	CAT	2	6	2668	2673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232703
47	NC_021993	CGT	3	9	2728	2736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232703
48	NC_021993	TTG	2	6	2794	2799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529232703
49	NC_021993	GAA	2	6	2832	2837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529232703
50	NC_021993	TGG	2	6	2927	2932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529232703
51	NC_021993	GAT	2	6	3028	3033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232703
52	NC_021993	CAT	2	6	3047	3052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232703
53	NC_021993	ATG	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021993	ATA	2	6	3486	3491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529232704
55	NC_021993	GCC	2	6	3588	3593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232705
56	NC_021993	CAG	2	6	3643	3648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232705
57	NC_021993	TGC	2	6	3667	3672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232705
58	NC_021993	GGC	2	6	3856	3861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232706
59	NC_021993	GTG	2	6	4028	4033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529232706
60	NC_021993	TCG	2	6	4107	4112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232706
61	NC_021993	TTC	2	6	4125	4130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529232706
62	NC_021993	CAA	2	6	4264	4269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529232707
63	NC_021993	CAT	2	6	4280	4285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232707
64	NC_021993	TCG	2	6	4312	4317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232707
65	NC_021993	GCA	2	6	4348	4353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232707
66	NC_021993	CGC	2	6	4381	4386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232707
67	NC_021993	CAT	3	9	4387	4395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232707
68	NC_021993	CAT	3	9	4450	4458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232707
69	NC_021993	TTA	2	6	4647	4652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021993	GCC	2	6	5273	5278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232708
71	NC_021993	TGC	2	6	5284	5289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232708
72	NC_021993	TTG	2	6	5463	5468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021993	CGC	2	6	5492	5497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232709
74	NC_021993	TCA	2	6	5645	5650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232709
75	NC_021993	GCT	2	6	5681	5686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232709
76	NC_021993	GGT	2	6	5719	5724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529232709
77	NC_021993	TCA	2	6	5745	5750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232709
78	NC_021993	GTT	2	6	5814	5819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529232709
79	NC_021993	GGT	2	6	5836	5841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529232709
80	NC_021993	TGT	2	6	5880	5885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529232709
81	NC_021993	GCT	2	6	5976	5981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232709
82	NC_021993	GAA	2	6	6259	6264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021993	TGC	2	6	6276	6281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232710
84	NC_021993	TGT	2	6	6446	6451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529232710
85	NC_021993	GCG	2	6	6461	6466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232710
86	NC_021993	GCA	2	6	6467	6472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232710
87	NC_021993	TGA	2	6	6492	6497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232710
88	NC_021993	TGC	2	6	6615	6620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232710
89	NC_021993	GGC	2	6	6631	6636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232710
90	NC_021993	GAA	2	6	6752	6757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529232710
91	NC_021993	CTG	2	6	6813	6818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021993	GGC	2	6	6949	6954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021993	TCG	2	6	6959	6964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_021993	CAA	2	6	7016	7021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529232711
95	NC_021993	AGC	2	6	7074	7079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232711
96	NC_021993	CTT	2	6	7140	7145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529232711
97	NC_021993	GTC	2	6	7174	7179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232711
98	NC_021993	ACA	2	6	7259	7264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021993	AAT	2	6	7357	7362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529232712
100	NC_021993	ATG	2	6	7528	7533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232712
101	NC_021993	TTA	2	6	7681	7686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529232712
102	NC_021993	TTC	2	6	7692	7697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529232712
103	NC_021993	CTT	2	6	7816	7821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529232712
104	NC_021993	CGG	2	6	8038	8043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232712
105	NC_021993	TTG	2	6	8059	8064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529232712
106	NC_021993	TGA	2	6	8111	8116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232712
107	NC_021993	GCA	2	6	8181	8186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232712
108	NC_021993	GCC	2	6	8217	8222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232712
109	NC_021993	TAC	2	6	8335	8340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232712
110	NC_021993	ATA	2	6	8373	8378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529232712
111	NC_021993	TTC	2	6	8700	8705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021993	TTA	2	6	8860	8865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021993	GAA	2	6	9024	9029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021993	CAG	2	6	9070	9075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_021993	AGG	2	6	9076	9081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021993	GTA	2	6	9209	9214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021993	CGG	2	6	9358	9363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021993	CGA	2	6	9368	9373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_021993	CGA	2	6	9380	9385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021993	GGC	2	6	9395	9400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_021993	ATG	2	6	9451	9456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021993	TGA	2	6	9503	9508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021993	CCT	2	6	9521	9526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_021993	GCG	2	6	9541	9546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021993	CAG	2	6	9563	9568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021993	GCA	3	9	9634	9642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_021993	GAC	2	6	9756	9761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_021993	GTA	2	6	9786	9791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021993	GAA	2	6	9816	9821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021993	GAA	2	6	9870	9875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021993	CCG	2	6	9887	9892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.