MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus 386B plasmid Apa386Bp3

Total Repeats: 183

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021992	CTG	2	6	157	162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021992	CGC	2	6	199	204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_021992	GCC	2	6	326	331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_021992	CTT	2	6	394	399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021992	CTG	2	6	478	483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021992	CCG	2	6	642	647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_021992	CCA	2	6	783	788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_021992	CGC	3	9	818	826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_021992	CAT	2	6	927	932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021992	TGC	2	6	1002	1007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021992	TGG	2	6	1059	1064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021992	CAC	2	6	1131	1136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_021992	TTC	2	6	1220	1225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021992	CCA	2	6	1446	1451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_021992	CTG	2	6	1561	1566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021992	CGT	2	6	1591	1596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021992	CAC	2	6	1684	1689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_021992	CCA	2	6	1743	1748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_021992	CCA	3	9	1761	1769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_021992	CAG	2	6	1786	1791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021992	CCG	2	6	1869	1874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_021992	ACC	2	6	1976	1981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_021992	CGC	2	6	2056	2061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_021992	GCT	2	6	2130	2135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021992	ATC	2	6	2144	2149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021992	CCA	2	6	2196	2201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_021992	CCG	2	6	2253	2258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_021992	CTG	2	6	2305	2310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021992	CAG	2	6	2347	2352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021992	CTC	2	6	2416	2421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_021992	GCG	2	6	2477	2482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021992	CAG	2	6	2566	2571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021992	CCA	2	6	2705	2710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529232690
34	NC_021992	CAC	2	6	2916	2921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529232690
35	NC_021992	TTG	2	6	2929	2934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529232690
36	NC_021992	CAT	2	6	2963	2968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232690
37	NC_021992	GCT	2	6	2995	3000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232690
38	NC_021992	TGA	2	6	3029	3034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232690
39	NC_021992	TTA	2	6	3129	3134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021992	AGC	2	6	3280	3285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021992	GAC	2	6	3437	3442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232691
42	NC_021992	GGC	2	6	3537	3542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232691
43	NC_021992	CAT	2	6	3619	3624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232691
44	NC_021992	GAT	2	6	3676	3681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232691
45	NC_021992	GGC	2	6	3733	3738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232691
46	NC_021992	GGC	2	6	4031	4036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232692
47	NC_021992	CGC	2	6	4103	4108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232692
48	NC_021992	CCG	2	6	4190	4195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232692
49	NC_021992	TCC	3	9	4266	4274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_021992	CAA	2	6	4356	4361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021992	ACG	2	6	4418	4423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021992	GGC	2	6	4436	4441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021992	GCT	2	6	4539	4544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021992	GCC	3	9	4662	4670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232693
55	NC_021992	GAT	2	6	4686	4691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232693
56	NC_021992	TGC	2	6	4712	4717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232693
57	NC_021992	GCC	2	6	4992	4997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232693
58	NC_021992	TCT	2	6	5024	5029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529232693
59	NC_021992	TCA	2	6	5250	5255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021992	CCG	2	6	5292	5297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_021992	CCA	2	6	5425	5430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_021992	TGC	2	6	5476	5481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021992	GCT	2	6	5491	5496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021992	TGG	2	6	5635	5640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021992	GGC	2	6	5760	5765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021992	CGG	2	6	5780	5785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_021992	TGT	2	6	6127	6132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529232694
68	NC_021992	CCT	2	6	6142	6147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529232694
69	NC_021992	GCA	2	6	6163	6168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232694
70	NC_021992	TCG	2	6	6271	6276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232694
71	NC_021992	CAG	2	6	6424	6429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232694
72	NC_021992	CGA	2	6	6544	6549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232694
73	NC_021992	CGC	2	6	6593	6598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232694
74	NC_021992	GCC	2	6	6615	6620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232694
75	NC_021992	ATG	2	6	6675	6680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232694
76	NC_021992	ATT	2	6	6699	6704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529232694
77	NC_021992	ACG	2	6	6727	6732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232694
78	NC_021992	GAT	2	6	6844	6849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232694
79	NC_021992	ATC	2	6	6870	6875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232694
80	NC_021992	TCA	2	6	6924	6929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232694
81	NC_021992	CAT	2	6	7037	7042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232694
82	NC_021992	GAA	2	6	7090	7095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529232694
83	NC_021992	TCA	2	6	7110	7115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232694
84	NC_021992	GAC	2	6	7216	7221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021992	ATC	2	6	7238	7243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021992	CTG	2	6	7315	7320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021992	CAC	2	6	7334	7339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_021992	ACC	2	6	7383	7388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_021992	CAG	3	9	7561	7569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232695
90	NC_021992	ATG	2	6	7619	7624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232695
91	NC_021992	ACA	2	6	7647	7652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529232695
92	NC_021992	GCC	2	6	7689	7694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232695
93	NC_021992	GAG	2	6	7717	7722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529232695
94	NC_021992	CCG	2	6	7774	7779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232695
95	NC_021992	CCA	2	6	7967	7972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_021992	CGT	2	6	8097	8102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021992	CCA	2	6	8149	8154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_021992	CGA	2	6	8224	8229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021992	GCA	2	6	8501	8506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232696
100	NC_021992	GCG	2	6	8592	8597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232696
101	NC_021992	ACC	2	6	8944	8949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529232696
102	NC_021992	ATT	2	6	9000	9005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021992	TTA	2	6	9354	9359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529232697
104	NC_021992	GCC	2	6	9366	9371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232697
105	NC_021992	ATA	2	6	9666	9671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529232697
106	NC_021992	GAT	2	6	9675	9680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232697
107	NC_021992	ATT	2	6	9711	9716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529232697
108	NC_021992	GGT	2	6	9735	9740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529232697
109	NC_021992	TGA	2	6	9875	9880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232697
110	NC_021992	GCT	2	6	9942	9947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232697
111	NC_021992	GAT	2	6	9972	9977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232697
112	NC_021992	TGG	2	6	10017	10022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529232697
113	NC_021992	CGT	3	9	10041	10049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232697
114	NC_021992	GGA	2	6	10050	10055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529232697
115	NC_021992	TTA	2	6	10079	10084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529232697
116	NC_021992	AAT	2	6	10118	10123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529232697
117	NC_021992	CCG	2	6	10183	10188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232697
118	NC_021992	AGA	2	6	10209	10214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529232697
119	NC_021992	GAA	3	9	10673	10681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529232697
120	NC_021992	CGA	2	6	10832	10837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232697
121	NC_021992	TCA	2	6	10864	10869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232697
122	NC_021992	TCA	2	6	10993	10998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232697
123	NC_021992	GTC	2	6	11058	11063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232697
124	NC_021992	ATG	2	6	11105	11110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232697
125	NC_021992	GCG	2	6	11184	11189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232698
126	NC_021992	CTG	2	6	11231	11236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232698
127	NC_021992	TGG	2	6	11240	11245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529232698
128	NC_021992	CTG	2	6	11306	11311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232698
129	NC_021992	ATC	2	6	11414	11419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232698
130	NC_021992	TGC	2	6	11487	11492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232698
131	NC_021992	TCG	2	6	11565	11570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232698
132	NC_021992	AGA	2	6	11743	11748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529232698
133	NC_021992	CAT	2	6	11776	11781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232698
134	NC_021992	AGA	2	6	11809	11814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529232698
135	NC_021992	TTC	2	6	11889	11894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529232698
136	NC_021992	GCG	2	6	11955	11960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232698
137	NC_021992	ACG	2	6	12006	12011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232698
138	NC_021992	TCG	2	6	12192	12197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232698
139	NC_021992	CGC	2	6	12403	12408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232698
140	NC_021992	TCG	2	6	12471	12476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232698
141	NC_021992	TGC	2	6	12636	12641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232698
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148	NC_021992	GGC	2	6	13175	13180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232698
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150	NC_021992	ACG	2	6	13259	13264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232698
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152	NC_021992	TTG	2	6	13488	13493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529232698
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160	NC_021992	CTG	2	6	14279	14284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_021992	TGT	2	6	14313	14318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529232699
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166	NC_021992	CAA	2	6	14578	14583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529232699
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176	NC_021992	TCT	2	6	15181	15186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529232700
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180	NC_021992	GCT	2	6	15358	15363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_021992	AGA	2	6	15365	15370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
182	NC_021992	TTC	3	9	15397	15405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_021992	TCC	2	6	15538	15543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.