MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus 386B plasmid Apa386Bp3

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021992	CCA	2	6	2705	2710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529232690
2	NC_021992	CAC	2	6	2916	2921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529232690
3	NC_021992	TTG	2	6	2929	2934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529232690
4	NC_021992	CAT	2	6	2963	2968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232690
5	NC_021992	GCT	2	6	2995	3000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232690
6	NC_021992	TGA	2	6	3029	3034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232690
7	NC_021992	GAC	2	6	3437	3442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232691
8	NC_021992	GGC	2	6	3537	3542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232691
9	NC_021992	CAT	2	6	3619	3624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232691
10	NC_021992	GAT	2	6	3676	3681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232691
11	NC_021992	GGC	2	6	3733	3738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232691
12	NC_021992	GGC	2	6	4031	4036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232692
13	NC_021992	CGC	2	6	4103	4108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232692
14	NC_021992	CCG	2	6	4190	4195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232692
15	NC_021992	GCC	3	9	4662	4670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232693
16	NC_021992	GAT	2	6	4686	4691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232693
17	NC_021992	TGC	2	6	4712	4717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232693
18	NC_021992	GCC	2	6	4992	4997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232693
19	NC_021992	TCT	2	6	5024	5029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529232693
20	NC_021992	TGT	2	6	6127	6132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529232694
21	NC_021992	CCT	2	6	6142	6147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529232694
22	NC_021992	GCA	2	6	6163	6168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232694
23	NC_021992	TCG	2	6	6271	6276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232694
24	NC_021992	CAG	2	6	6424	6429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232694
25	NC_021992	CGA	2	6	6544	6549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232694
26	NC_021992	CGC	2	6	6593	6598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232694
27	NC_021992	GCC	2	6	6615	6620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232694
28	NC_021992	ATG	2	6	6675	6680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232694
29	NC_021992	ATT	2	6	6699	6704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529232694
30	NC_021992	ACG	2	6	6727	6732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232694
31	NC_021992	GAT	2	6	6844	6849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232694
32	NC_021992	ATC	2	6	6870	6875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232694
33	NC_021992	TCA	2	6	6924	6929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232694
34	NC_021992	CAT	2	6	7037	7042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232694
35	NC_021992	GAA	2	6	7090	7095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529232694
36	NC_021992	TCA	2	6	7110	7115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232694
37	NC_021992	CAG	3	9	7561	7569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232695
38	NC_021992	ATG	2	6	7619	7624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232695
39	NC_021992	ACA	2	6	7647	7652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529232695
40	NC_021992	GCC	2	6	7689	7694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232695
41	NC_021992	GAG	2	6	7717	7722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529232695
42	NC_021992	CCG	2	6	7774	7779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232695
43	NC_021992	GCA	2	6	8501	8506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232696
44	NC_021992	GCG	2	6	8592	8597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232696
45	NC_021992	ACC	2	6	8944	8949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529232696
46	NC_021992	TTA	2	6	9354	9359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529232697
47	NC_021992	GCC	2	6	9366	9371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232697
48	NC_021992	ATA	2	6	9666	9671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529232697
49	NC_021992	GAT	2	6	9675	9680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232697
50	NC_021992	ATT	2	6	9711	9716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529232697
51	NC_021992	GGT	2	6	9735	9740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529232697
52	NC_021992	TGA	2	6	9875	9880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232697
53	NC_021992	GCT	2	6	9942	9947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232697
54	NC_021992	GAT	2	6	9972	9977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232697
55	NC_021992	TGG	2	6	10017	10022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529232697
56	NC_021992	CGT	3	9	10041	10049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232697
57	NC_021992	GGA	2	6	10050	10055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529232697
58	NC_021992	TTA	2	6	10079	10084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529232697
59	NC_021992	AAT	2	6	10118	10123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529232697
60	NC_021992	CCG	2	6	10183	10188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232697
61	NC_021992	AGA	2	6	10209	10214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529232697
62	NC_021992	GAA	3	9	10673	10681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529232697
63	NC_021992	CGA	2	6	10832	10837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232697
64	NC_021992	TCA	2	6	10864	10869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232697
65	NC_021992	TCA	2	6	10993	10998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232697
66	NC_021992	GTC	2	6	11058	11063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232697
67	NC_021992	ATG	2	6	11105	11110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232697
68	NC_021992	GCG	2	6	11184	11189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232698
69	NC_021992	CTG	2	6	11231	11236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232698
70	NC_021992	TGG	2	6	11240	11245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529232698
71	NC_021992	CTG	2	6	11306	11311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232698
72	NC_021992	ATC	2	6	11414	11419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232698
73	NC_021992	TGC	2	6	11487	11492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232698
74	NC_021992	TCG	2	6	11565	11570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232698
75	NC_021992	AGA	2	6	11743	11748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529232698
76	NC_021992	CAT	2	6	11776	11781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232698
77	NC_021992	AGA	2	6	11809	11814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529232698
78	NC_021992	TTC	2	6	11889	11894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529232698
79	NC_021992	GCG	2	6	11955	11960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232698
80	NC_021992	ACG	2	6	12006	12011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232698
81	NC_021992	TCG	2	6	12192	12197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232698
82	NC_021992	CGC	2	6	12403	12408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232698
83	NC_021992	TCG	2	6	12471	12476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232698
84	NC_021992	TGC	2	6	12636	12641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232698
85	NC_021992	AAC	2	6	12659	12664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529232698
86	NC_021992	CTT	2	6	12707	12712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529232698
87	NC_021992	ACG	2	6	12762	12767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232698
88	NC_021992	GGA	2	6	12800	12805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529232698
89	NC_021992	ATG	3	9	12909	12917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232698
90	NC_021992	GAA	2	6	13031	13036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529232698
91	NC_021992	GGC	2	6	13175	13180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232698
92	NC_021992	TGA	2	6	13182	13187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232698
93	NC_021992	ACG	2	6	13259	13264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232698
94	NC_021992	CTG	2	6	13412	13417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232698
95	NC_021992	TTG	2	6	13488	13493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529232698
96	NC_021992	GGC	2	6	13613	13618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232698
97	NC_021992	CTT	2	6	13756	13761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529232698
98	NC_021992	GCC	2	6	13847	13852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232698
99	NC_021992	TCC	2	6	13882	13887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529232698
100	NC_021992	AAC	2	6	13890	13895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529232698
101	NC_021992	TCT	2	6	13978	13983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529232698
102	NC_021992	TGT	2	6	14313	14318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529232699
103	NC_021992	TGA	2	6	14329	14334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232699
104	NC_021992	CAT	3	9	14462	14470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232699
105	NC_021992	CAA	2	6	14500	14505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529232699
106	NC_021992	AGA	2	6	14531	14536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529232699
107	NC_021992	CAA	2	6	14578	14583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529232699
108	NC_021992	CCA	2	6	14609	14614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529232699
109	NC_021992	TGA	2	6	14628	14633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232699
110	NC_021992	ATA	2	6	14646	14651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529232699
111	NC_021992	CGG	2	6	14864	14869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232699
112	NC_021992	CTG	2	6	14956	14961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232699
113	NC_021992	TCC	2	6	15030	15035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529232700
114	NC_021992	ACC	3	9	15091	15099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529232700
115	NC_021992	GCC	2	6	15151	15156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232700
116	NC_021992	TCT	2	6	15181	15186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529232700
117	NC_021992	TCC	2	6	15225	15230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529232700
118	NC_021992	AAC	2	6	15248	15253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529232700

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.