MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus 386B

Total Repeats: 265

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021991	CACAA	2	10	15416	15425	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_021991	CCTGC	2	10	29985	29994	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_021991	TGCCA	2	10	35753	35762	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_021991	CTGCC	2	10	43200	43209	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5	NC_021991	ACGAT	2	10	56878	56887	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_021991	CCTTG	2	10	75907	75916	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_021991	AACGA	2	10	77937	77946	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_021991	TAATG	2	10	88116	88125	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021991	CACAA	2	10	99744	99753	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_021991	AACAG	2	10	112972	112981	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_021991	TAATA	2	10	113611	113620	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021991	ACGCA	2	10	128680	128689	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_021991	AGGAA	2	10	172474	172483	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021991	AAAAC	2	10	173693	173702	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_021991	AAAAT	2	10	176767	176776	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021991	GCTAG	2	10	187248	187257	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_021991	AATCA	2	10	203197	203206	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_021991	AGGAC	2	10	205596	205605	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_021991	TTTCT	2	10	206480	206489	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_021991	TATGT	2	10	216435	216444	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021991	TATAA	2	10	216445	216454	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021991	CCTTT	2	10	216520	216529	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_021991	ATCGT	2	10	222150	222159	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_021991	GAAAA	2	10	227736	227745	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021991	ACTGA	2	10	234678	234687	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_021991	AATAA	2	10	248663	248672	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021991	GCTTC	2	10	267209	267218	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_021991	CTGAA	2	10	270366	270375	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_021991	CCGTT	2	10	272432	272441	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_021991	CTTGC	2	10	279070	279079	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_021991	CCACC	2	10	284094	284103	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
32	NC_021991	GGGAT	2	10	290180	290189	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021991	GCCCA	2	10	294192	294201	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
34	NC_021991	CACGA	2	10	294259	294268	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_021991	CCCAT	2	10	295589	295598	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
36	NC_021991	CCTTT	2	10	301394	301403	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_021991	TATTT	2	10	316418	316427	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021991	ATAGC	2	10	320123	320132	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_021991	TTATT	2	10	339005	339014	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021991	TTAAA	2	10	350452	350461	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021991	TAAAT	2	10	358150	358159	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021991	GGTAA	2	10	401340	401349	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021991	AAATC	2	10	408124	408133	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_021991	ATATT	2	10	427379	427388	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021991	TCCTC	2	10	447824	447833	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
46	NC_021991	AAATT	2	10	460765	460774	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021991	AAACC	2	10	466615	466624	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_021991	ATTTT	2	10	474320	474329	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021991	TAAAT	2	10	474394	474403	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021991	TAAAA	2	10	474750	474759	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021991	CGATA	2	10	479125	479134	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_021991	ATAAA	2	10	479135	479144	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021991	ATTTT	2	10	482152	482161	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021991	ATTTT	2	10	485058	485067	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021991	TACGT	2	10	507027	507036	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_021991	ATTTA	2	10	509989	509998	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021991	ATTTA	2	10	510044	510053	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021991	AGTAA	2	10	510068	510077	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021991	AACAA	2	10	513940	513949	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_021991	CTTAC	2	10	520291	520300	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_021991	GTCAG	2	10	521413	521422	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_021991	GGGAT	2	10	531691	531700	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021991	GCCCA	2	10	535703	535712	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
64	NC_021991	CACGA	2	10	535770	535779	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_021991	CCCAT	2	10	537100	537109	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
66	NC_021991	GAAAA	2	10	580854	580863	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021991	CCCCG	2	10	584059	584068	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
68	NC_021991	TGCCT	2	10	626573	626582	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_021991	CAGAG	2	10	670097	670106	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_021991	GGCAA	2	10	680809	680818	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_021991	CTTTT	2	10	685204	685213	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_021991	TAAAC	2	10	707771	707780	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_021991	CGACA	2	10	709586	709595	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_021991	TCTTT	2	10	713626	713635	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_021991	TTCGT	2	10	719214	719223	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_021991	TCCTG	2	10	721123	721132	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_021991	ATAAA	2	10	721134	721143	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021991	AGATG	2	10	726818	726827	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021991	ATAAA	2	10	728703	728712	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021991	ACGGT	2	10	728743	728752	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_021991	TAACG	2	10	734647	734656	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_021991	TAAAA	2	10	748060	748069	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021991	ACTCT	2	10	750141	750150	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_021991	TGTCA	2	10	755359	755368	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_021991	CTCTG	2	10	755414	755423	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_021991	GCCCT	2	10	770115	770124	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
87	NC_021991	TATTT	2	10	780862	780871	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021991	GGCTT	2	10	790588	790597	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_021991	CCCTG	2	10	794352	794361	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
90	NC_021991	AATAC	2	10	804053	804062	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_021991	CCTTT	2	10	810931	810940	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_021991	CCGCT	2	10	816562	816571	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
93	NC_021991	CTGAC	2	10	819566	819575	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_021991	TGACC	2	10	848511	848520	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_021991	CAGAA	2	10	860761	860770	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_021991	AGAAA	2	10	909511	909520	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021991	GCCAT	2	10	932636	932645	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_021991	ATTTT	2	10	940144	940153	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021991	TCATT	2	10	940458	940467	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_021991	TTTTA	2	10	945728	945737	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021991	TCCTA	2	10	951325	951334	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_021991	GAAAA	2	10	962055	962064	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021991	CCTTG	2	10	963209	963218	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_021991	ACCGC	2	10	964962	964971	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
105	NC_021991	GTATT	2	10	972905	972914	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021991	AATAT	2	10	982101	982110	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021991	GGGAT	2	10	1004339	1004348	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021991	GCCCA	2	10	1008351	1008360	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
109	NC_021991	CACGA	2	10	1008418	1008427	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_021991	CATTT	2	10	1009937	1009946	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_021991	GGCAA	2	10	1013567	1013576	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_021991	CTGTT	2	10	1038212	1038221	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_021991	CTTTT	2	10	1054572	1054581	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_021991	CTGTA	2	10	1054590	1054599	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_021991	CTGTT	2	10	1068038	1068047	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_021991	GATAT	2	10	1072131	1072140	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021991	TTAAT	2	10	1072796	1072805	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021991	CCTAC	2	10	1088109	1088118	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
119	NC_021991	CCTTT	2	10	1106789	1106798	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_021991	CAAAC	2	10	1125641	1125650	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_021991	ATATT	2	10	1135936	1135945	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021991	ATAAA	2	10	1140507	1140516	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021991	CTGCT	2	10	1148658	1148667	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_021991	TAAAA	2	10	1173984	1173993	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021991	AATTT	2	10	1174006	1174015	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021991	AAGGC	2	10	1199373	1199382	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_021991	ATGTG	2	10	1216053	1216062	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021991	GCTTT	2	10	1224424	1224433	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_021991	AGCAA	2	10	1249347	1249356	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_021991	CCTTT	2	10	1255534	1255543	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_021991	ACGTA	2	10	1274039	1274048	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_021991	GGGAT	2	10	1274955	1274964	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021991	GCCCA	2	10	1278967	1278976	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
134	NC_021991	CACGA	2	10	1279034	1279043	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
135	NC_021991	CCCAT	2	10	1280366	1280375	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
136	NC_021991	CTGCC	2	10	1306497	1306506	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
137	NC_021991	AAAAT	2	10	1316058	1316067	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021991	AAACG	2	10	1336486	1336495	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_021991	TCTGT	2	10	1363604	1363613	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_021991	CTCTT	2	10	1395937	1395946	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_021991	ACAAT	2	10	1406369	1406378	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_021991	CCTTA	2	10	1409556	1409565	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_021991	TTCAT	2	10	1412156	1412165	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_021991	TAAGT	2	10	1423013	1423022	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021991	CGCCA	2	10	1424414	1424423	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
146	NC_021991	CTGCA	2	10	1429705	1429714	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
147	NC_021991	GGGAT	2	10	1430007	1430016	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021991	GCCCA	2	10	1434019	1434028	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
149	NC_021991	CACGA	2	10	1434086	1434095	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
150	NC_021991	CCCAT	2	10	1435416	1435425	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
151	NC_021991	TCTTT	2	10	1444697	1444706	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
152	NC_021991	TACAA	2	10	1502509	1502518	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
153	NC_021991	CACAT	2	10	1503341	1503350	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
154	NC_021991	CATTA	2	10	1521775	1521784	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
155	NC_021991	AAAAG	2	10	1530346	1530355	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
156	NC_021991	GCAAA	2	10	1556351	1556360	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
157	NC_021991	AATAA	2	10	1560407	1560416	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_021991	TTTGA	2	10	1616863	1616872	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
159	NC_021991	CTGAA	2	10	1625746	1625755	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
160	NC_021991	CAAGG	2	10	1628986	1628995	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
161	NC_021991	AAGGT	2	10	1637141	1637150	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
162	NC_021991	GTCTG	2	10	1638799	1638808	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
163	NC_021991	GCTCT	2	10	1642371	1642380	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
164	NC_021991	AGGGA	2	10	1642427	1642436	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
165	NC_021991	GCGTT	2	10	1647818	1647827	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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168	NC_021991	AACAG	2	10	1678786	1678795	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
169	NC_021991	GCATA	2	10	1683932	1683941	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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171	NC_021991	CCTAT	2	10	1698406	1698415	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
172	NC_021991	TAGAT	2	10	1706830	1706839	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
173	NC_021991	ATTTT	2	10	1706898	1706907	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_021991	CAAAA	2	10	1713555	1713564	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
175	NC_021991	TAAAG	2	10	1717659	1717668	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
176	NC_021991	TAGAG	2	10	1717922	1717931	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
177	NC_021991	GTAAA	2	10	1735347	1735356	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
178	NC_021991	GAACT	2	10	1739205	1739214	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
179	NC_021991	ATCGT	2	10	1754391	1754400	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
180	NC_021991	GTGAT	2	10	1762830	1762839	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
181	NC_021991	GGATT	2	10	1764518	1764527	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
182	NC_021991	CAGAA	2	10	1764753	1764762	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
183	NC_021991	TTCCA	2	10	1771729	1771738	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
184	NC_021991	GAATG	2	10	1789408	1789417	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_021991	TGGAA	2	10	1801030	1801039	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
187	NC_021991	CTGTC	2	10	1850765	1850774	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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191	NC_021991	TATAT	2	10	1906310	1906319	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_021991	GGGCA	2	10	1908710	1908719	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
193	NC_021991	ACGGC	2	10	1909702	1909711	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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196	NC_021991	CTTTA	2	10	1922511	1922520	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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202	NC_021991	TGAAC	2	10	1972422	1972431	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
203	NC_021991	GGGGC	2	10	1978515	1978524	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
204	NC_021991	CCATG	2	10	1981884	1981893	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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247	NC_021991	CTGAA	2	10	2420176	2420185	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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250	NC_021991	TCTCA	2	10	2481831	2481840	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
251	NC_021991	GTTGT	2	10	2599949	2599958	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
252	NC_021991	TGCAC	2	10	2623799	2623808	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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260	NC_021991	TTCCT	2	10	2717058	2717067	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
261	NC_021991	TCCTG	2	10	2770832	2770841	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
262	NC_021991	TCTTT	2	10	2776370	2776379	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
263	NC_021991	GTTTT	2	10	2781425	2781434	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
264	NC_021991	TCTTT	2	10	2785526	2785535	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
265	NC_021991	ATGGC	2	10	2810057	2810066	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.