MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Enterococcus faecium Aus0085 plasmid p3

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021988	AAAGA	2	10	1282	1291	80 %	0 %	20 %	0 %	529230035
2	NC_021988	GAAAT	2	10	3019	3028	60 %	20 %	20 %	0 %	529230038
3	NC_021988	AGAAT	2	10	5410	5419	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021988	AAATG	2	10	5733	5742	60 %	20 %	20 %	0 %	529230043
5	NC_021988	AATAT	2	10	12981	12990	60 %	40 %	0 %	0 %	529230052
6	NC_021988	CGGTT	2	10	14390	14399	0 %	40 %	40 %	20 %	529230054
7	NC_021988	ATCTA	2	10	14823	14832	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_021988	GAAAT	2	10	15982	15991	60 %	20 %	20 %	0 %	529230056
9	NC_021988	ACATA	2	10	18015	18024	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_021988	AACAA	2	10	18081	18090	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_021988	TTGTA	2	10	19899	19908	20 %	60 %	20 %	0 %	529230060
12	NC_021988	TCCAC	2	10	21092	21101	20 %	20 %	0 %	60 %	529230061
13	NC_021988	CGATT	2	10	21655	21664	20 %	40 %	20 %	20 %	529230062
14	NC_021988	TATAT	2	10	21808	21817	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021988	AGTTG	2	10	24805	24814	20 %	40 %	40 %	0 %	529230067
16	NC_021988	TAATA	2	10	26359	26368	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021988	GATTC	2	10	26617	26626	20 %	40 %	20 %	20 %	529230070
18	NC_021988	AAGTC	2	10	27606	27615	40 %	20 %	20 %	20 %	529230071
19	NC_021988	TTTTC	2	10	28744	28753	0 %	80 %	0 %	20 %	529230074
20	NC_021988	TTGCA	2	10	29827	29836	20 %	40 %	20 %	20 %	529230076
21	NC_021988	TTAAA	2	10	30834	30843	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.